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Proteínas

Proteínas. Puedo analizar. Estructra primaria : composición y orden de los aa. Estructura secundaria : interacción entre aa cercanos Alfa hélices (H) Hojas plegadas beta (E) Giros (T) Colas ( C).

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Presentation Transcript

  1. Proteínas Puedo analizar Estructra primaria: composición y orden de los aa Estructura secundaria: interacción entre aa cercanos Alfa hélices (H) Hojas plegadas beta (E) Giros (T) Colas ( C)

  2. Estructura Terciaria: interacción entre aa no cercanos Puentes di sulfuro Interacciones hidrofóbicas Estructura cuaternaria: interacción entre subunidades

  3. Estructura primaria: composición y orden de los aa Composición aminiacídica Peso molecular teórico Punto isoeléctrico Hidrofobicidad

  4. Numero de aa Peso molecular PI % composion de aa Coef de ext molar Vida media en distintos org. http://ca.expasy.org/tools/#proteome

  5. Hidrofobicidad Sosui: indica si la prot es soluble o tiene segmentos transmembrana http://bp.nuap.nagoya-u.ac.jp/sosui/sosui_submit.html

  6. http://bp.nuap.nagoya-u.ac.jp/sosui/sosui_submit.html

  7. Estructura secundaria: interacción entre aa cercanos Alfa hélices (H) Hojas plegadas beta (E) Giros (T) Colas ( C) Areas acceseibles a solventes (ASA)

  8. http://sable.cchmc.org/

  9. También puedo buscar dominios Los dominios están asociados a funciones o estructuras Varios programas llevan a bases de datos

  10. http://ca.expasy.org/tools/#proteome Determina los dominios encontrados Comparado con la base de datos de prosite

  11. clic http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd.shtml http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi

  12. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cdd.shtml

  13. Motivos particulares: Hay varios motores de búsqueda Los puedo encontrar en el expasy Ej. Motivo de union al DNA HTH

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