Les rotavirus : autre virus de gastro-entérites chez l’Homme

1. Les rotavirus : autre virus de gastro-entérites chez l’Homme • F : Reoviridae • G : Rotavirus, Reovirus, Orbivirus (bluetongue), Phytoréovirus (riz) • Le genre Rotavirus comprend des virus humains et animaux • Chez l’homme, il provoque des gastro-entérites • Agent étiologique majeur des diarrhées sévères chez le jeune enfant : 30 à 50 % des hospitalisations infantiles pour cause de DA • 1000.000 décès / an dans monde (enfants)

2. Organisation et structure • Virus non enveloppée ; capside icosahédrale formée de 3 couches protéiques (1000 A° ) • très résistant dans l’environnement • Génome ARN double brin segmenté (10 à 12 segments) • Rotavirus humain : 11 segments = 12 protéines (6 structurales + 6 NS) • système propre de réplication/transcription

3. Capside : structure et fonction • Capside double couche ou monocouche non infectieuses : les 3 couches sont nécessaires • Couche externe : 260 trimères VP7 (gp 38 kD) + 120 copies VP4 (88 kD) spicules dimériques • 132 canaux ioniques traversent les 2 couchent externes

4. Capside : couche externe • VP 4 : interaction avec la cellule hôte • Attachement – pénétration – hémagglutination – neutralisation et virulence • Clivage protéolytique de VP4 augmente son infectiosité et son entrée (ex virus trypsiné)

5. Couche externe • VP 4  VP8 (28 kD 247 aa) et VP5 (60 kD aa 248-776) : restent associés dans le virion • Fusion par VP4 à la cellule  clivage : internalisation (?) mécanisme mal connu

6. Capside – VP4 très flexible • Chez les rotavirus animaux, VP8 interagit avec les acides sialiques mbr, VP5 avec les intégrines • Chez le rotavirus humain, VP5 induit l’entrée du virus – sialic indépendant entrée apicale ou baso-latérale des entérocytes • Si Sialic dépendant : induit une conformation favorable à l’action de VP5

7. Capside – VP7 et DLP • VP 7 rôle dans la décapsidation : influencé par de faible [Ca] iC : dissocie VP7 trimers => décapsidation  libère les DLP active • DLP : la transcription à lieu dedans

8. DLP • Formée de VP6 (260 trimères - externe interaction VP7/VP4) et de VP2 (interne) • DLP nécessaire et suffisante pour transcrire en ARNm – transcription endogène à DLP

9. DLP Transcription • VP6 assure la structure de DLP pour y assurer la transcription endogène (intra DLP) et VP2 rôle dans la transcription • Blocage de VP6 par Atc ou VP7 : courts ARNm donc conformation stricte VP6-VP2 nécessaire pour des transcrits complets

10. Capside « interne » VP1 2 3 • VP2 la plus abondante (60 dimères) : interaction avec VP6 et RNA génomique • Auto-assemblage en ‘mini’ capside VP1 enzyme RNA pol RNA dép • VP3 enzyme guanylyl méthyl transférase

11. Capside interne • InteractionVP2/RNAg/VP1-3 : transcription • mRNA 5’ Cap 3’consensus (pas de poly A) • mRNA libérés par des canaux DLP

12. Organisation génomique • 11 segments de 660 – 3300 bp • Total 18.5 kbp • Chaque segment a une interaction symétrique avec VP2

13. génome • Influence du pH dans la structure de l’ARNg et son interaction avec VP2 : pH élevé : affecte le complexe (déprotonation de VP2)  condensation de l’ARN isométrique (au centre de la particule)

14. Réplication et encapsidation • Réplication concomitante avec la transcription DANS la DLP • Organisation en viroplasmes • Comment la capside englobe le bon set de segments ???? • Rôle des NSP

15. NSP 3 • NSP 3 protéine basique 63 kD, dimère : domaine Nt interagit avec la séquence 3’ des ARNm • Domaine Ct fixe eIF4G – traduction • Protège l’ARNm

16. NSP 2 – NSP 5 • NSP2 et 5 impliquées dans la réplication et l’encapsidation • Présentes dans les viroplasmes • NSP2 : NTPase, RNA-binding et hélicase • Fournit l’énergie (hydrolyse NTP) pour l’encapsidation • NSP5 : protéine acide, interaction avec les domaines basiques de NSP2 (?)

17. NSP • NSP5 : rôle de régulation de l’interaction NSP2/ARN pendant la réplication et l’encapsidation • NSP 4 , gp, aurait un rôle dans la régulation de la [Ca2+] intra C : entérotoxine