410 likes | 521 Views
Vstupy centrálních regulátorů :. checkpoints – reakce na poškození a zpětná vazba. „cell cycle engine“. vstupy. výstupy. velikost signály poškození. gen. exprese morfogeneze. ???. Why do events occur in a particular order? How are superficially unrelated events kept in phase?
E N D
Vstupy centrálních regulátorů: checkpoints – reakce na poškození a zpětná vazba
„cell cycle engine“ vstupy výstupy velikost signály poškození ... gen. exprese morfogeneze ...
??? • Why do events occur in a particular order? • How are superficially unrelated events kept in phase? • How are growth and division co-ordinated? • How does the cell know where to locate new structures? (A.E. Wheals, 1976)
cdc9 L. Hartwell a T. Weinert, 80.- 90. léta
Mutace zvyšující citlivost ke zlomům: rad (radiation sensitive) UV wt rad9 (mrtvé se barví methylenovou modří)
UV dělá zlomy ... a co defekt ligázy?? (občas ztráta chromosomu) rad9, 25 i 37 oC wt, 37 oC RAD9 nutný k bloku cyklu při poškození! cdc9, 37 oC cdc9rad9, 37 oC (Hartwell and Weinert 1988)
Model „kontrolních bodů“ (checkpoints) • Existují mechanismy, které průběžně monitorují úplnost a „zdraví“ důležitých mechanismů BC a v případě poruchy cyklus zastaví, aby byl čas na opravu. • RAD9 je součástí dráhy, která takto monitoruje celistvost DNA (DNA damage checkpoint). poškozená DNA v S nebo G2/M G2 M
Jak funguje RAD9 checkpoint? • 2 epistatické třídy RAD genů • RAD17, RAD24, MEC3 a DDC1 • RAD9 • protein kináza MEC1 – detektor?
Cíl 1: transkripce cyklinů (CLN via SCB, CLB via MCB)
Cíl 2: replikace - přes primázu
Cíl 3: securin (inhibitor separace chromosomů, substrát APC, který vyvazuje separasu)
Tenodera aridifolia sinensis Replikace není jediným zdrojem rizika ...
Chromosomové určení pohlaví u kudlanky ♀: X1X2 X1X2 ♂: X1X2 Y
Anafázi lze obnovit mechanickým tahem za kinetochor! Anafáze Blok Anafáze (Li a Nicklas 1995)
Jak kinetochor ví, že se za něj tahá? (anti-phosphoprotein Ab)
Jak je to u kvasinek? • benomyl – destrukce vřeténka a M arrest • MAD/BUB geny: mitotic arrest deficient/budding uninhibited by benomyl wt, benomyl mad/bub, benomyl
„Spindle checkpoint“ • Aktivace u kvasinek: • benomyl, nocodazol a jiné mt jedy • mutace SPB • mutace centromer (CDEIII) • nadpočetné centromery (mnoho různých YCp) • Aktivace u hmyzu: • nepřichycené chromosomy
Co když se chromosom ztratí později? Bub2: část „dvousložkového“ GAP (připomínka: Cdc14 je fosfatáza nezbytná pro mitotic exit)
Spindle checkpoint - cíle telofázní regulátor APC securin/separáza transkripce CKI
A to ještě není vše! (1995) cdc24 cdc42 Proč jsou Hartwellovi mutanti dvojjaderní, ale vjiném genetickém backgroundu jen 1 G2 jádro?
Absence pupene zdržuje mitosu! iniciace terminace segregace
Obecně: cell morphogenesis checkpoint Senzor: proteinové komplexy asociované se septiny Cíl: inhibiční fosforylace CDC28 (Y19)! Y19F a někt. kmeny standardní wt
Y15 T14 Y15 Y15 T161 T14 T14 T161 T161 Y15 Y15 T14 T14 T161 T161 Pro kontrolu pupenem nutná fosforylace Y19 (homolog Y15) cdc25 wee1
Cíle – širší pohled (Saccharomyces wee1)
??? • Why do events occur in a particular order? • How are superficially unrelated events kept in phase? • How are growth and division co-ordinated? • How does the cell know where to locate new structures? (A.E. Wheals, 1976)
Kontrola velikostí: necyklující cyklin CLN3 velikost CLN3 START SWI4/6 CLN1,2
Jaký to má vztah k živinám?A jak je kvasinka vnímá? • „Start II“ mutace: • blok ve Startu bez růstu • „kvasinka si myslí, že hladoví“ • CDC25: GEF pro RAS!
CDC25 stimuluje produkci cAMP GEF adenylátcykláza Cdc25 Cyr1 Ras-GDP Ras-GTP fosfodiesteráza Pde cAMP Ira1,2 AMP ATP GAP inhibice nebo stimulace Startu?
Regulace proteinkinázy A pomocí cAMP adenylátcykláza Cyr1 (Cyr1: sporulace na bohatých médiích etc.) cAMP AMP ATP proteinkináza A (PK-A) Tpk1,2,3 Tpk1,2,3 Bcy1 Bcy1 (Bypass of Cyr) (zase jedna kináza regulovaná inhibitorem) ?
Kvasinková RAS/cAMP dráha GEF adenylátcykláza Cdc25 Cyr1 fosfodiesteráza Ras-GDP Ras-GTP Pde cAMP AMP ATP Ira1,2 proteinkináza A (PK-A) Tpk Tpk GAP Bcy1 Bcy1 inhibice nebo stimulace Startu?
Předpokládali bychom, že cAMP stimuluje, ale ... asynchronní kultura (M.D. Baroni, Milano, Italy – Nature 371:339, 1994
... cAMP inhibuje BC, aby mohla vzrůst kritická velikost! a-factor release
cAMP zprostředkuje spřažení cyklu a růstu u S. cerevisiae • Cíl regulace přes Tpk/PK-A: nastavení citlivosti transkripce CLN1 a CLN2 vůči hladině CLN3 • Čím víc cukru, tím víc cAMP a tím víc CLN3 = větší velikost před startem! • cAMP podobně reguluje i anafázi a mitotic exit (srv. S. pombe!) – inhibice APC prostřednictvím PK-A