80 likes | 487 Views
MLPA MULTIPLEX LIGATION-DEPENDENT PROBE AMPLIFICATION. Kolektiv Laboratoře molekulární biologie Onkologické centrum J. G. Mendela Nový Jičín. komplementární sekvence k univerzálnímu primeru Y. Stuffer sekvence. komplementární sekvence k univerzálnímu primeru X.
E N D
MLPAMULTIPLEX LIGATION-DEPENDENT PROBE AMPLIFICATION Kolektiv Laboratoře molekulární biologie Onkologické centrum J. G. Mendela Nový Jičín
komplementární sekvence k univerzálnímu primeru Y Stuffer sekvence komplementární sekvence k univerzálnímu primeru X specifická hybridizačnísekvence SCHÉMA KONSTRUKCE PÁRŮ SOND
ds DNA DENATURACE (98°C) ss DNA ss DNA HYBRIDIZACE (98°C) Ligáza-65 LIGACE (54°C) inaktivace ligázy při 98°C PCR F R použití univerzálních primerů fragmentová analýza SEPARACE SCHÉMA PRINCIPU MLPA
A B C 1 2 4 3 DETEKCE DELECÍ A) NORMÁLNÍ HOMOZYGOT B) DELETOVANÝ HOMOZYGOT 1 2 3 4 1 3 4 1 2 3 4 1 3 4 2 2 C) HETEROZYGOT 1 2 4 3 1 3 4 2
“Stuffer”sequence EcoRV XbaI SphI PCR primer sequence BsmI (vector: blue plaques) “Stuffer”sequence EcoRV XbaI SphI BsmI Hybridizing sequence (clone: white plaques) EcoRV BsmI “Stuffer”sequence PCR primer sequence Hybridizing sequence