Travail de 2ème doctorat

1. Travail de 2ème doctorat Martins Rita Margueritte Aurélien Mahler Elodie

2. Intérêts de l’utilisation des indicateurs de santé pour la sélection génétique des saumons

3. Plan: 1.Introduction 2.Index de santé proposés: • Evaluation par autopsie • Activité du lysozyme plasmatique • Fréquence de l’infection par R.Salmoninarum 3.Evaluation des index • Tests de survie • Taux de croissance et taille 4.Résultats 5.Discussion 6.Conclusion

4. 1. Introduction: • Les 3 indicateurs de santé: • Activité du lysozyme plasmatique (A.P.L.) • Détection de Renibacterium salmoninarium engendrant la Bacterial Kidney Disease (BDK) • L’évaluation de l’index de santé basée sur l’autopsie (HAIA)

5. Croisements-test: • W: souche sauvage • D: souche domestique (YIAL)

6. 4 types de descendants: • WW Homozygote sauvage • DD Homozygote domestique • WD • DW Hybrides

7. Estimation de l’héritabilité des index de santé. Recherche de la corrélation entre les index de santé et les performances. 2 buts des croisements:

8. 2. Index de santé proposés 1) Evaluation à l’autopsie • Examens qualitatif de différents organes • Chaque organe est noté selon l’échelle suivante: - 0 : aucune anormalité - 30 : anormalités modérées - 60 : anormalités sévères • Test de chi-carré pour évaluer les différences entre scores de santé selon les familles de poissons.

9. 2) Activité du lysozyme plasmatique • Utilisation de la technique sur « lysoplate » - Dépôt de 6 échantillons de plasma de poisson - Dépôt d’un échantillon d’une solution étalon contenant du lysozyme de blanc d’œuf • Diamètre de la zone de lyse autour de chaque échantillon. • ANOVA 1 • Estimation de l’héritabilité de l’activité lysozyme

10. 3) Fréquence de l’infection à R. salmoninarum • Extraction de l’ADN de l’homogénat des reins • PCR d’un fragment de 501 pb du gène p57 de R. salmoninarum • Visualisation de l’ADN amplifié sur gel d’agarose • Comparaison à des témoins infectés et sains • ANOVA 1 • Estimation de l’héritabilité de la fréquence d’infection

11. 3. Evaluation des indexSurvie des différents croisements : • à une vibriose « naturelle » • à un pathogène inoculé ( V. anguillarum) Injection intrapéritonéale de 0.1 ml d’une solution contenant V. anguillarum comparée à celle d’un placébo • Evaluation de la résistance à la maladie. • Anova

12. Performances des poissons • Taux de croissance : évaluation du poids à 8 mois d’intervalle • Taille en fonction de l’âge : - taille à 420 jours post-fertilisation - taille à 615 jours post-fertilisation • Anova

13. Analyse par régression linéaire • But = voir l’utilité des indicateurs de santé pour prédire les performances familiales • Régression pour chaque indicateur de santé potentiel par rapport au : - taux de survie après l’infection naturelle à Vibrio après inoculation de V.anguillarum - taux de croissance et à la taille des poissons

14. 4.Résultats • A.L.P (activité du lysozyme plasmatique): est la plus élevée chez les WW

15. H.A.I.(évaluation de l’état de santé): 91,2% des saumons ont un score de “0”•Taux de survie: DD 92,4% ; DW et WD taux intermediaires par rapport aux lignés pures.•Taux de croissance (taille-âge): á 420j _ WW» WD=DW» DD á 620j _ WW = WD » DW•Composante héritable paternelle pour A.P.L. WW : h2= 0,17+/-0,04 DD : h2= -0,12+/-0,33

16. 5.Discussion • Santé du poisson • Index de santé • Composante paternelle héritable de l’A.P.L. • L’usage de la technique PCR pour détecter Renibacterium salmoninarum

17. 6.Conclusion • Association : A.P.L. élevée avec BKD + Sont des bons indicateurs de la santé chez le poisson • Augmentation du nombre des IS ont amélioré la resolution de cet étude... • Pour trouver des correlations genétiques entre IS et traits performants on conseille de tenir compte des traits generalisés: croissance et survie.

18. Bibliographie • « Utility of genetically based healt indicators for selection purposes in captive-reared chinook salmon, Oncorhynchus tschawytscha, Walbaum », Rachel M. Johnson et al.Aquaculture Research, 2003, 34, 1029-1036.