250 likes | 536 Views
METABOLISME dan INFORMASI GENETIK. Bagian ke 1 dari KI-3161 Biokimia Dasar. Diasuh oleh: FM,SH,ZN Aturan Main: Kehadiran 80% Tiap dosen akan memberikan ujian max 2 kali Nilai Praktikum berbobot 25-30%
E N D
METABOLISME dan INFORMASI GENETIK Bagian ke 1 dari KI-3161 Biokimia Dasar
Diasuh oleh: FM,SH,ZN Aturan Main: Kehadiran 80% Tiap dosen akan memberikan ujian max 2 kali Nilai Praktikum berbobot 25-30% Peserta praktikum harus hadir di pertemuan awal praktikum (31 Agustus 2006) pk. 8.00 di Lab. Biokimia Buku Rujukan: Mathews,van Holde and Ahern, “Biochemistry” Lehninger (1982). A, “Principles of Biochemistry”, Worth Publishers, Inc, New York. Stryer L. (1995), “Biochemistry”, 4th ed, W.H. Freeman Co, New York Aturan Main & Buku Rujukan
Kinetika Reaksi enzim Pendekatan kesetimbangan Pendekatan steady state Inhibisi enzim Metabolisme : Membran dan proses transport Hubungan katabolisme dan Anabolisme Katabolisme & Anabolisme Karbohidrat Glikolisis TCA Rantai Respirasi Glukoneogenesis Glikogenolisis Glikogenesis Fotosintesis Katabolisme & Anabolisme Lipid b-oksidasi Biosintesis asam lemak Katabolisme protein Siklus urea Informasi genetik: pengendalian metabolisme : operon Pokok Bahasan
Kinetika Reaksi Enzim • Kerja enzim • Model mekanisme kerja enzim: • Model ‘Kunci & anak kunci’ : Emil Fisher (1894) • Model ‘Induced-fit’: Daniel Koshland (1958) • Contoh: Hexokinase
Kinetika • Reaksi: • Pendekatan Kesetimbangan • Pendekatan Keadaan tunak, steady state
Pendekatan Kesetimbangan Penyusunan ulang persamaan (1) dan substitusi persamaan (3) dihasilkan:
Prinsip: laju pembentukan senyawa antara sama dengan laju penguraiannya. d[ES]/dt = - d[ES]/dt [Etot]=[E]+[ES] Setelah mensubstitusi harga [E] dan dengan mengasumsikan harga tetapan laju kearah penguraian produk sangat kecil maka,akan deperoleh harga [ES] Pendekatan Keadaan tunak (steady state)
Penentuan KM & Vmax • Berdasarkan pers Michaelis-Menten • Kurva antara V terhadap [S] • Pada saat [V] = ½[Vmax], maka: • [S]= Km • Berdasarkan pers. Lineweaver-Burk • kurva 1/V thd 1/[S] • Pada 1/V = 0, 1/[S]=-1/Km • Pada 1/[S]=0, 1/V= 1/Vmax
Arti fisik besaran-besaran: KM, kcat dan kcat/KM • KM menyatakan : konsentrasi substrat yang diperlukan agar reaksi katalisis efektif. • kcat adalah tetapan laju pada tahap penentu laju. • Untuk tahapan reaksi enzim sbb: • k2 adalah kcat • Satuan kcat : s-1→ kebalikannya: waktu yang diperlukan untuk mengubah 1 molekul substrat oleh 1 molekul enzim → kcat : jumlah substrat yang dapat diubah (turned over) per detik. → turn over number • Kcat/KM = turn over number/afinitas terhadap substrat→ merupakan ukuran efisiensi suatu enzim • Contoh:
Inhibisi Enzim • Inhibisi Reversibel • Kompetitif • Uncompetitive • Non Kompetitif • Inhibisi Irreversibel
Membran Sel dan Proses Transport • Struktur Membran : • Lipid ‘bilayer’ • Protein • Fluiditas Membran • Proses transport
Proses transport • Transport pasif → Difusi • Difusi dengan bantuan • pori • pengemban (carrier) • Transport aktif → dengan bantuan sumber energi, terjadi proses transport yang melawan arah gradien konsentrasi: • pompa Ion • sistem ko-tansport • transport dengan modifikasi