1 / 9

Bioinformatika Szakirodalmi Tanulmányok 2005 Csörgő Bálint

A universal method for automated gene mapping Peder Zipperlen, Knud Nairz, Ivo Rimann, Konrad Basler, Ernst Hafen, Michael Hengartner and Alex Hajnal Genome Biology 2005, 6: R19. Bioinformatika Szakirodalmi Tanulmányok 2005 Csörgő Bálint.

simeon
Download Presentation

Bioinformatika Szakirodalmi Tanulmányok 2005 Csörgő Bálint

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. A universal method for automated gene mappingPeder Zipperlen, Knud Nairz, Ivo Rimann, Konrad Basler, Ernst Hafen, Michael Hengartner and Alex HajnalGenome Biology 2005, 6:R19 Bioinformatika Szakirodalmi Tanulmányok 2005 Csörgő Bálint

  2. Szekvencia polimorfizmusok alkalmazása a genotipizálásban SNP (single-nucleotide polymorphism) detektálás -SNP-t átfedő PCR amplifikátum szekvenálása -5’ nukleáz próba -DHPLC (denaturing high-performance liquid chromatography) -RFLP (restriction fragment length polymorphism) -Primer-extenzió alapú módszerek -DNS chip technológia STR (short tandem repeat) detektálás -fragmens hossz különbségek detektálása InDel (small insertions and deletions) detektálás -FLP (fragment length polymorphism)

  3. Az FLP nehézségei

  4. C. elegans és Drosophila FLP térképei

  5. Mire jó a térkép? (Proof of principle kísérletek) 3 jól leírt mutációnak a térképezése: -let-23(sy1): vulva nélküli fenotípus -rol-1(e91): testtengely körüli forgás -unc-52(e444): bénulást okozó mutáció

  6. FLP alkalmazása ismeretlen pozíciójú mutáció térképezésére I.

  7. FLP alkalmazása ismeretlen pozíciójú mutáció térképezésére II.

  8. Összefoglalás FLP térképezéssel napok alatt térképezhető ~200 lehetséges génre egy ismeretlen mutáció; a módszer nagy része automatizálható

  9. Köszönöm a figyelmet!

More Related