490 likes | 601 Views
Vznik protonmotivní síly při fotosyntéze. Srovnání respiračních a PS řetězců. + protonový obvod - tvorba p ( podobná hodnota cca 200mV ) + transport elektronů + proteinové složky (cytochromy, Fe-S centra, chinony …) + ATP synthasa – rozdíly pouze v detailech
E N D
Srovnání respiračních a PS řetězců • + protonový obvod - tvorba p (podobná hodnota cca 200mV) • + transport elektronů • + proteinové složky (cytochromy, Fe-S centra, chinony …) • + ATP synthasa – rozdíly pouze v detailech • Specifika PS systémů: • A) světlosběrné antény • pohlcení kvanta světla a přechod do excitovaného stavu • B) reakční centra • P*P+ P BENG - Photo - e- + e-
1)Oxygenní fotosyntetické baktérie • - chlorofyl (prokaryontní fytoplankton) • - cyanobaktérie (sinice) • 2)Anaerobní anoxygenní fotosyntetické baktérie (dna jezer a moří, sedimenty, sirné prameny, ..) • - bakteriochlorofylpurple non-sulfur photosynthetic bacteria • 3) Aerobní anoxygenní fotosyntetické bakterie • - Erythrobacter, Roseobacter („zelené baktérie“ - až 9% oceánských baktérií) • - heterotrofní (acetát, butyrát, glukosa…) • 4)Červené řasy (Rhodophyta) - • 5) Zelené řasy a rostliny • - chlorofyl (eukaryontní fytoplankton) Typy fotosyntetických organismů BENG - Photo
BENG-membrány Fotosyntetizující baktérie Tři skupiny: 1)zelené baktérie - cyklus C v mořích 2)purpurové baktérie - sirné - nesirné 3)cyanobaktérie („modrozelené řasy“) symbionti - lišejníky
BENG-membrány Archebaktérie Halobacterium Halobaktérie: * unikátní systém přeměny světelné energie * život v extrémních podmínkách solných jezer bakteriorhodopsin = světlem poháněná protonová pumpa
BENG-membrány Rekonstituované systémy Chemiosmotická teorie: „…funkční oddělitelnost primární a sekundární protonové pumpy…“ „rekonstituční experimenty“ - inkorporace purifikovaných protonových pump do umělých membránových systémů
Fotosyntéza u Rhodobacter www.rhodobacter.org * velmi variabilní metabolismus * schopnost fotosyntézy, litotrofie, aerobního i anaerobní respirace, fixace N2 * nejvíce prozkoumané (purifikace komponent, RTG struktura, ..) BENG - Photo
Kluster fotosyntetických genů Rhodobacter sphaeroides - genome BENG - Photo
zjednodušené schéma • (např. existují alternativní cytochromy schopné nahradit cyt c2) Cyklický přenos e- poháněný světlem BENG - Photo
Bakteriochlorofyl excitovaný světlem Přenos e- ve vztahu k redoxním potenciálům Reverzní tok e- pro redukci NAD+ BENG - Photo Necyklický tok e- na finální akceptor O2
Anténa = uspořádání polypeptidů a pigmentů v membráně * zvýšení absorbční hustoty v membráně a výsledný efektivnější přenos e- na redoxní centrum * větší rozsah absorbované vlnové délky * nejsou nezbytnépro PS (mutanti žijí ..) „Antény“ – základní koncept PS BENG - Photo • Rhodobacter • absorbční max. 870nm • na 1 foton E = 1,42eV • účinnost 70%
Přenos excitační energie v anténách • Většina molekul Bchl ~absorbce světla s 870nm • = nutný přenos na nižší energetické hladiny odpovídající 870nm • přenos resonanční energie • * překryv fluorescenčního emisního spektra donoru a excitačního spektra akceptoru • * závisí na relativní orientaci a vzdálenosti (do 20 Ǻ) • 2) spřažení delokalizovaných excitonů • * efektivní sdílení orbitalů na blízké vzdálenosti (do 15 Ǻ) • * na malé vzdálenosti daleko rychlejší než resonanční přenos • * typické pro excitované karotenoidy – krátký čas života BENG - Photo
LH1 = 1616 cylindr vyplněný reakčním centrem Model uspořádání světlosběrných komplexů LH2 = 99 cylindr vyplněný fosfolipidy R. spheroides 10 ps BENG - Photo 40 ps 1 ps 3 ps přenos delokalizovanými excitony
*R.viridis:první 2 membránové proteiny s vyřešenou RTG-strukturou * R. sphaeroides : více prozkoumané na funkční úrovni – podobnost PS II zelených rostlin - 3 polypeptidy H, L, M - 4 molekuly bakteriochlorofylu (BChl) - 2 molekuly bakteriofytinu (Bpheo) - 2 molekuly ubichinonu (UQ) - 1 molekulu nehemového Fe Bakteriální fotosyntetické centrum BENG - Photo bakteriofytin
Bakteriální PS centrum atom Fe ubichinon BENG - Photo atom Mg bakteriochlorofyl
Kardiolipin ve PS centru Rhodobacter sphaeroides Úloha lipidů ve struktuře PS centra Anionické lipidy – důležitá úloha ve funkcí membrán (prostředí pro integrální proteiny PS a respiračních komplexů BENG - Photo
UQH2 Schéma bakteriálního fotosyntetického centra h • Přechod elektronu jednou větví reakčního centra Rhodobacter sphaeroides • „P870“ = dimer BChl, po absorbci kvanta ztrácí e- • - ox.BChl+ má EPR signál • další molekula BChl zprostředkuje přenos na Bpheo • stabilizace radikálu UQ.- vazbou na protein • 2 molekuly UQ = převod procesu na 2-elektronový a tvorba p * UQBH2 2 H+ + e- e- e- BENG - Photo + e- e- + e- e-
Bakteriochlorofyl excitovaný světlem Shrnutí - Rhodobacter Reverzní tok e- pro redukci NAD+ BENG - Photo Necyklický tok e- na finální akceptor O2
BChl´= odlišná struktura ve srovnání s Rhodobacter • podobnost fotosystému II u rostlin • feredoxin = nižší potenciál umožňuje přímou redukci NAD+ bez reverzního toku Přenos e- v zelené sirné baktérii fylochinon Fe-S centra feredoxin BENG - Photo menachinon
Shrnutí PS v rostlinách BENG - Photo
Membrána thylakoidu BENG - Photo
možnost necyklického toku e- na terminální akceptor • dvě nezávislé světelné reakce pro redoxní rozsah H2O/O2 a NADP+ Rostliny – schéma PS I a PS II inhibice BENG - Photo inhibice
Chlorofyl a BENG - Photo
Další pomocné pigmenty BENG - Photo
Pigmenty na podzim … BENG - Photo
LHC II monomer: - transmembránové helixy A, B, C, D Světlosběrná anténa thylakoidů BENG - Photo
Schema přenosu energie v PS BENG - Photo
cyanobaktérie Synechococcus Organizace peptidů a kofaktorů PSII BENG - Photo
Komplex PSII BENG - Photo
PSII v elektronovém mikroskopu špenát Arabidopsis BENG - Photo
e- h Reakce štěpení vody v PS II potřeba 4 kvanta pro odebrání 4 e- z H2O e- S0 S1 2H+ e- H+ e- BENG - Photo H+ S2 S4 h e- e- S3 h e- h e-
RTG struktura v rozlišení 2,5 Ǻ Nature 2001 Struktura PS I Synechococcus BENG - Photo
Struktura PS I - S.elongatus BENG - Photo
Struktura PS I Text BENG - Photo
Energetické poměry PS I – S.elongatus JBC (2001) 273, 23429 BENG - Photo
přenos 6 H+ do P-fáze na každé 2 e- přenesené na NADP+ Stechiometrie přenosu náboje a tvorby p BENG - Photo
Fyziologické cyklování e- v thylakoidu BENG - Photo
Fyziologické cyklování e- v thylakoidu BENG - Photo
Regulace struktury thylakoidu fosforylací BENG - Photo fosforylace vede ke změně poměru zhuštěných oblastmi (více PSII)
Halobacterium sp. BENG - Photo
Protein se 7 transmembránovými helixy • Retinal - kovalentně vázaný aldehydickou skupinou – Schiffova báze • objeven v Halobacterium salinarum(dříve Halobium) • světlem poháněna pumpa H+ ven z buňky • složitý cyklus - nejméně 7 kroků • pravděpodobně v dalších eubaktériích Bakteriorhodopsin BENG - Photo
Dráha H+ v bakteriorhodopsinu BENG - Photo
1) Fotoizomerizaci retinalu z all-trans na 13-cis - cca 5 ps. 2) Přeměna K590 na L550 intermediát - zesílení vodíkové vazby mezi protonovanou Schiffovou bazí a Asp-85 3) 1.transfer protonu: z L550 na M410(EC) - transfer H+ z Schiffovy base na Asp-85 v extracellularním kanálu 4) 1. překlopení z extracellularní na cytoplasmatické : M410(EC) to M410(CP) - de- a reprotonace na úrovni intermediátu M410(EC) to M410(CP) 5) 2. transfer protonu: z M410(EC) na N560 - reprotonace Schiffovy baze z Asp-96 v cytoplasmatickém kanálu 6) Thermoisomerace retinal z 13-cis na all-trans: N560 to O640 -isomerizace retinalu v prostředí protonovaných Asp-96 a Asp-85 7) 2. překlopení z cytoplasmické do extracellularní - deprotonace Asp-85 dokončuje katalytický cyklus Fotocyklus bakteriorhodopsinu BENG - Photo
Fotocyklus bakteriorhodopsinu BENG - Photo
Důležité konformační změny bakteriorhodopsinu BENG - Photo animace
Archebaktérie Halobacterium salinarium - světlem poháněná pumpa aniontů do buňky (Cl, NO3,..) - absorbce zelené světlo, max. 578 nm Halorhodopsin • existuje celá řada světlem poháněných pump u archebaktérií a eubaktérií • společné: obsah retinalu • Např. protorhodopsin – mořský bakterioplankton BENG - Photo
Halorodopsin • model halorhodopsinu • podélný řez • příčný řez BENG - Photo
1) Fotoisomerizace retinalu z all-trans na 13-cis formu - cca 5 ps 2) Přenos prvního Cl- - zahrnuje přesun chloridů v externím kanálu – v řádově ms 3) První převrácení dostupnosti z extracelární na cytoplasmatickou: - změna polohy a dostupnosti Schiffovy báze 4) Přenos druhého Cl- - pohyb chloridu z Schiffovy báze přes Thr-203 na cytoplasmatický povrch – řádově ms 5) Termoisomerizace retinalu z 13-cis na all-trans 2.převrácení dostupnosti z cytoplasmatické na extracelulární - návrat do původního stavu – řádově ms Popis cyklus halorodopsinu BENG - Photo
Příště:ATP synthasa BENG - Photo