170 likes | 297 Views
T üvirakkude arenguliini määramine transkriptsiooni tasemel. Konstantin Tretjakov kt@ut.ee. Rakude diferentseerumine. Organismis määrab genotüüp ja keskkond päris täpselt fenotüüpi . Organismi üksikrakude puhul see ei kehti !. Rakude diferentseerumine.
E N D
Tüvirakkude arenguliini määramine transkriptsiooni tasemel Konstantin Tretjakovkt@ut.ee
Rakude diferentseerumine • Organismis määrab genotüüp ja keskkond päris täpselt fenotüüpi. • Organismi üksikrakude puhul see ei kehti!
Rakude diferentseerumine • Rakud annavad üle omajärglastele peale DNA-d ka muid asju
Epigeneetiline pärimine • Peale DNA-d pärib rakk vanematelt asju nagu näiteks: • “Stabiilsed” valkude kompleksid • Kromatiini-märgistused • Kromatiini-pakkimine • Raku struktuur & organellid
Diferentseerumisvõime • Raku oluline “pärand” on tema diferentseerumisvõime: • Totipotentsus • Pluripotentsus • Multipotentsus • Unipotentsus
Diferentseerumismehhanism • Juhuslikult tekkinud erinevuse amplifitseerimine • Koespetsiifiliste faktorite mõju • Arvatakse et kontroll toimub põhiliselt transkriptsiooni tasemel.
Diferentseerumismehhanism • Juhuslikult tekkinud erinevuse amplifitseerimine
Näide: C. elegans • Alguses kõik rakud samaväärsed • Üks neist toodab rohkem LAG-2’i • See paneb ülejäänud tootma LIN-12 (see on LAG-2’-e retseptor) ning lõpetamaLAG-2’-etootmist. • Voila!
Diferentseerumismehhanism • Koespetsiifiliste faktorite mõju
Näide: Lihased • Transkriptsioonifaktor MyoD: • Aktiveerib lihase-spetsiifilisi geene. • Aktiveerib iseennast. • Muudab peaaegu suvalist raku lihaseks!
Näide: Lihased • MyoD on bHLH valk, mis vajab töötamiseks õiget paarilist (E12,E47). • Id on “vale paariline”, mis takistab MyoD tööd.
Näide: Lihased • Müoblasti jagunemisstaadiumis ta ei diferentseeru. • Kasvufaktorid (FGF) stimuleerivad Id ja PKC tootmist. • Viimane fosforüleerib MyoD seondumispiirkonda. • Pärast diferentseerimist ei annaMyoD rakule siseneda S-faasi blokeerides Rb.
Diferentseerumise uurimine • Tüvirakkude uurimine on päris kuum teema praegu. • Eelkõige tahaks rohkem teada diferentseerumismehhanismide kohta. • Kuidas?
Diferentseerumise uurimine • Kuidas? • Ära arvata õige geen + vaadata mis ilma selleta toimub • Homoloogia järgi • Mikrokiip-eksperimendi abil
Kokkuvõte • Epigeneetiline pärimine lubab rakudel diferentseeruda • Diferentseerimismehhanismid on tavaliselt keerulised. • Me ei tea paljusid asju, agakindlasti saame teada.
Allikad • T. Maimets. Molekulaarne Rakubioloogia. • I. Greenwald. LIN-12/Notch signaling in C. elegans. • I. Roeder. Towards an understanding of lineage specification in [...] transcription factors GATA-1 and PU.1 • S. Tanaka et al.Gene ... Profiling of ESC Reveals ... Genes Associated With Pluripotency and Lineage Specificity • Wikipedia (www.wikipedia.org)