790 likes | 1.26k Views
VIRUSOLOĢIJA (VĪRUSI UN ĀRPUSHROMOSOMU ĢENĒTISKIE ELEMENTI). VĪRUSU UN ĀRPUSHROMOSOMU ELEMENTU GRUPAS dsDNS VĪRUSI. ds DNS vīrusi. Kopējais raksturojums Baktēriju vīrusi Dzīvnieku vīrusi Papilomas - poliomas vīrusi Adenovīrusi Herpesvīrusi Baku vīrusi Bakulovīrusi
E N D
VIRUSOLOĢIJA (VĪRUSI UN ĀRPUSHROMOSOMU ĢENĒTISKIE ELEMENTI) VĪRUSU UN ĀRPUSHROMOSOMU ELEMENTU GRUPAS dsDNS VĪRUSI
ds DNS vīrusi • Kopējais raksturojums • Baktēriju vīrusi • Dzīvnieku vīrusi • Papilomas - poliomas vīrusi • Adenovīrusi • Herpesvīrusi • Baku vīrusi • Bakulovīrusi • Iridovīrusi
ds DNS vīrusu kopējais raksturojums dsDNS vīrusu saimnieku loks: Eubacteria un Archebacteria, (bakteriofāgi, piem.: Podoviridae, E coli fāgi); Hordata (Pox-, Herpes-, Adeno-, Papiloma- Polyomavirdae); Insecta (Baculo-, Irido- un Polydnaviridae); Eikariotiskās aļģes (Phycodnaviridae). Augi nav dsDNS vīrusu saimniekorganismi
ds DNS vīrusu kopējais raksturojums DNS izmēri: No 5-8 kb (Polyoma- Papilomaviridae), ietverot 30-40 kb (l fāgs un Adenoviridae) līdz 200 kb (Baculoviridae); 300 kb (Herpes- , Pox- , Irido- un Phycodnaviridae) līdz pat 1,2 Mb (Mimiviridae). Mazāko parazītisko prokariotu genoma garums ir ap 600 kb
ds DNS vīrusu kopējais raksturojums DNS formas gredzenveida (Papiloma-, Polyoma-, Baculo- un Polydnaviridae); lineāri (Adeno- un Herpesviridae, daži fāgi); cikliski permutēti lineāri genomi (fāgs T4, daži Iridoviridae); lineāri genomi ar kovalenti noslēgtiem galiem (Pox- un Phycodnaviridae) lineāri genomi ar moduļveida uzbūvi (Herpesviridae) Visiem vīrusiem, izņemot Polydnaviridae ir vienkomponenta genoms.
ds DNS vīrusu kopējais raksturojums Replikācija Replikācija notiek līdzīgi saimniekšūnas genomam. Papavoviridae replikācijas un plazmīdu genoma replikācijas līdzība. Eikariotu šūnās dsDNA vīrusi replicējas kodolā, izmantojot saimniekšūnas polimerāzes, nukleāzes, metilāzes utt. Izņēmums: poksvīrusi, daži bakulovīrusi (granulozes grupa) un daži iridovirusi, replicējas citoplazmā, izmantojot vīrusspecifiskus fermentus (DNS-atkarīga DNS polimerāze !), veidojot īpašus vīrusa ieslēgumus (“viral factories”).
Baktēriju vīrusi Dz.: Myoviridae Ģ.: T4 - līdzīgie fāgi dsDNA ~270 kbp, lineāra, permutēta, galu atkārtojumi, virions satur ap 50 proteīnu, kodē fermentus. Mu, P1, P2
Baktēriju vīrusi T4 - fāga genoma karte
Citozīna atlikums T4 fāga DNS sastāvā ir modificēts (hidroksimetilcitozīns) un glikozilēts glikoze - http://www.genelink.com/newsite/products/images/modificationimages/5-Hydroxymethyl-dC.gif
Baktēriju vīrusi Dz.: Syphoviridae Ģ.: l - līdzīgie fāgi dsDNA ~48 - 50 kbp, lineāra, ar lipīgiem galiem, 9 struktūras proteīni; galvenie kapsīda proteīni D un E
Baktēriju vīrusi Dz.: Syphoviridae Ģ.: l - līdzīgie fāgi Korinebaktēriju b fāgs – lizogēns, tā genoms kodē difterijas A (activity)T (transport)B (binding) toksīna sintēzi Difterijas toksīna struktūra; A domēns citoplazmā katalizē ADP-ribozes (no NAD) pārnesi uz eikariotu proteīna sintēzes elongācijas faktpru EF-2. kas to inaktivē un pārtrauc proteīnu sintēzi Diftamīds – modificēts histidīns EF-2 molekulā http://textbookofbacteriology.net/BetaPhage.jpg
Dz.: Syphoviridae Ģ.: l - līdzīgie fāgi T5 fāga replikācijas stratēģija – agrīno gēnu lokalizācija first step transfer (fst) rajonā fāga genomā IC – infekciju izraisošo fāgu daļiņu skaits 32P radioakīvitāte nogulsnēs Bacteriol.Rev. 32, 227, 1968
Baktēriju vīrusi Dz.: Podoviridae Ģ.: T7- līdzīgie fāgi dsDNA ~40 kbp, lineāra, nepermutēta, galu atkārtojumi
Baktēriju vīrusi T7 - fāga genoma karte
Baktēriju dsDNS vīrusi Tectiviridae morfoloģija
Tectiviridae morfoloģija: Krioelektronu mikroskopija un TEM Baktēriju dsDNS vīrusi
Baktēriju dsDNS vīrusi Tectiviridae adsorbcija un penetrācija
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Papilomas - poliomas vīrusi (kārpu un audzēju) Dz., Dz.: Polyomaviridae; Papilomaviridae 45 vai 55 nm diametrs. Membrānas apvalks nav. Gredzenveida dsDNA, 5,0 - 5,5 vai ~8 kbp. 2-3 struktūras proteīni, pārejie: regulācija. Kodējošo iespēju izmantošana, abas ķēdes, pārklājošās nolasīšana. Cilvēka papilomas (kārpu) vīrusa tipi 1 - 58. Peļu poliomas vīruss un SV - 40. Cilvēka JC vīruss. Progresējošā multifokālā leiko-encefalopātija. Cilvēka BK vīruss. Nieru saslimšana (imūnsupresijas fonā) Trušu Šoupa papilomas vīruss.
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Papovavīrusu DNS replikācija
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Agrīnais rajons: mazais un lielais T antigēns (transkripcijas faktori); vēlīnais rajons - kapsīda proteīni.
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Poliomas (SV40) vīrusa transkripcijas un replikācijas regulācijas rajona struktūra
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Papilomas vīrusu genoma struktūra Nepermisīvās šūnās - integrācija. Vīrusa transkripcijas faktori E6 (saista p53); E7 (saista p105RB) - onkogēni. Šūnas cikla regulatori p53; p105RB - antionkogēni, tumoru supresori. HPV16 - saistība ar dzemdes vēzi.
DNS vīrusu onkoģenēze un šūnas cikls Šūnas cikla regulācija
Antionkogēni (tumoru supresori, piemērs RB proteīns) E7 Šūnas cikla regulatori : antionkogēni
2008. gada Nobela prēmijas fizioloģijā un medicīnā Haraldam zur Hauzenam par atklājumu, ka papiliomas vīrusi izraisa dzemdes vēzi; Fransuāzai Barre-Sinusi un Lukam Montanje par cilvēka imūndeficīta vīrusa atklāšanu.
B. Alisjahbana, R. Dinata, E.Sutedja, I. Suryahudaya, H. Soedjana, N. Hidajat, R. Soetikno, E. Oktaliansah, A. Deng, P. Rady,S. Tyring, A. Gaspari Disfiguring Generalized Verrucosis in an IndonesianMan with Idiopathic CD4 Lymphopenia Arch. Dermatol., 146, (1) 69-73, 2010 Dede Kosawa, Jakarta region, Indonesia
Šoupa papilomas vīruss – keratokarcinomas trušiem http://sites.lafayette.edu/hollidac/files/2009/11/jack07ukansas.jpg http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/7e/Rabbit_shopes_papilloma_virus_3.jpg
Dzīvnieku dsDNS vīrusi ADENOVĪRUSI Dz.: Adenoviridae Ģ. Ģ.: Mastadenovirus; Aviadenovirus Ikosaedriski virioni, bez apvalka, diametrs 80 - 110 nm. Lineāra ds DNA, 35 - 40 kbp. 5’ gala kovalenti saistītais proteīns (TP), galu invertētie atkārtojumi Cilvēka adenovīrusi, tipi 1 - 47 Permisīvas, nepermisīvas šūnas Splaisings
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Adenovīrusu morfoloģija
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Adenovīrusu morfoloģija
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Adenovīrusu DNS uzbūve
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Adenovīrusu genoma struktūra
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Adenovīrusu gēnu splaisinga elektronmikroskopija
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Adenovīrusu infekcijas gaita
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Adenovīrusu konjuktuvīts
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Adenovīrusu onkoģenēze
Dzīvnieku dsDNS vīrusi HERPESVĪRUSI Ikosaedriski virioni, 100 - 200 nm diametrs, ir apvalks. HHV 7 un 8, putnu Mareka slimības vīrusi nav klasificēti ģintīs. Ar AIDS asociēts cilvēka 8. herpesvīruss
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Herpesvīrusa morfoloģija
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Herpesvīrusu genoma struktūra
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Herpesvīrusu gēnu ekspresijas regulācijas
Dzīvnieku dsDNS vīrusi Herpesvīrusa izsitumu saslimšnas norise
Dzīvnieku dsDNS vīrusi HSV1 izsitumi un persistence