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CURSO: BIOTECOLOGIA GRUPO- 5B SECUENCIA DE ADN DOCENTE: BLG. SOTO GONZALES, HERBERT HERNAN ELABORADO POR: FLORES, OBDULIO MAMANI, YANINA PARISUAÑA, SOLEDED MAYO 2023
1.- ELABORACION DE CUADRO DE LA SECUENCIA DEL ADN IDENTIFICADAS CON BIODIT Y NCBI (BLAST). 1.- ELABORACION DE CUADRO DE LA SECUENCIA DEL ADN IDENTIFICADAS CON BIODIT Y NCBI (BLAST). CALIDAD DE SECUENCIA N° GRUPO NOMBRE DEL ARCHIVO CORRESPONDE A TIPO DE ORGANISMO Regular 1 E09_5_09 Enterobacter sp. Bacterias gramnegativas Regular 2 EE10_13_10 Uncultured bacterium Bacterias Buena 3 F07_6H_11 Enterobacter ludwigii Bacterias gramnegativas Buena 4 F09_6_11 Klebsiella sp. Bacterias Mala 5 F10_14_12 No se encontro similitud significativa ------------------- Buena 6 G1 G07_7H_13 Kosakonia oryzae Bacterias Regular 7 G09_7_13 Uncultured bacterium Bacteria Regular 8 G10_15_14 Enterobacter cloacae Bacteria No se encontró una similitud significativa Mala 9 H07_8H_15 ------------------- No se encontró una similitud significativa Mala 10 H09_8_15 ------------------- Regular 11 H10_16_16 Enterobacter sp. Bacteria Pseudomonas sp. strain VWK3 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 12 B11_18_03 Regular Bacterias gramnegativas Enterobacter sp. strain C7-5A 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 13 C07_3H_05 Buena Bacterias Gram negativas Enterobacter sp. NA10140 gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence 14 C08_11H_06 Regular Bacterias Gram negativas Phytobacter diazotrophicus strain UAEU22 chromosome, complete genome 15 C09_3_05 Regular Bacteria Pseudomonas fluorescens strain WL99 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 16 C10_11_06 Mala Bacteria Gram negativo Klebsiella oxytoca strain EE04 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 17 C11_19_05 Mala Germen , Bacteria Gram negativa
Staphylococcus epidermidis IRQBAS65 gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence 18 G2 D07_4H_07 Regular Bacteria Staphylococcaceae Staphylococcus sp. US-13 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 19 D08_12H_08 Regular Bacteria Grimontella sp. strain AB21_soil 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 20 D09_4_07 Regular Bacteria Pseudomonas mosselii strain 73332 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 21 D10_12_08 Regular Bacterias gram negativas No se encontró una similitud significativa 22 E07_5H_09 Mala ------------------- Paraburkholderia silvatlantica strain NRB111 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 23 E08_13H_10 Regular Bacterias gram negativas Enterobacter ludwigii strain PR16 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 24 E09_5_09 Regular ------------------- Enterobacter sp. strain BacI46 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 25 01_A03_01 Buena Bacterias gram negativas 26 02_B03_03 Mala No se encontró similitud significativa. ------------------- Klebsiella sp. strain B10.02 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 27 03_C03_05 Mala Bacteria Enterobacter sp. ICBR 189 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 28 04_D03_07 Regular Bacterias gram negativas Enterobacter sp. strain AAUGM-14 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 29 05_E03_09 Buena Bacterias gram negativas
30 06_F03_11 Mala No se encontró similitud significativa. ------------------- 31 G3 07_G03_13 Mala No se encontró similitud significativa. ------------------- Erwinia sp. ZFGT-4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 32 08_H03_15 Regular Bacteria 33 09_A04_02 Mala No se encontró similitud significativa. ------------------- 34 10_B04_04 Regular Achromobacter xylosoxidans strain MBGIPS 12 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Bacterias gram negativas Klebsiella sp. SUS7K 16S ribosomal RNA gene, partial sequence 35 11_C04_06 Regular Bacterias inmoviles 36 12_D04_08 Bueno No se encontró similitud significativa. ------------------- 37 13_E04_10 Regular No se encontró similitud significativa. ------------------- Klebsiella variicola cepa M186-1- bacteria Gram negativa Regular 38 526Y1_F011 Enterobacter sp. WF14-6 Gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial bacilos anaerobios bueno 39 419Y1_G01_13 Regular 40 375H_H01_15 No se encontró similitud significativa. ------------------- Enterobacter cloacae strain RAT2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Gram negativo Oxidasa negativo Bueno 41 419YZ_A02_02 Regular 42 01-419NZ_A01_01 No se encontró similitud significativa. ------------------- Klebsiella pneumoniae cepa WSHvKP cromosoma, genoma completo bacteria de forma bacilar Malo 43 02-526NZ_B01_03 Klebsiella grimontii strain SS141 chromosome, complete genome bacteria Gram negativa bueno 44 03-419AZ_C01_05 Klebsiella pneumoniae strain CEMTC_2574 16S ribosomal RNA gene, partial sequence bacteria de forma bacilar bueno 45 G4 04-88NZ_D01_07
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport strain CP016014.1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence bacilos gramnegativos bueno 46 05-88AZ_E01_09 Regular 47 10-88H_B02_04 No se encontró similitud significativa. ------------------- Bueno 48 11-37NZ_C01_06 No se encontró similitud significativa. ------------------- Klebsiella quasivariicola cepa HBUAS53417 gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial bacteria Gram negativa Bueno 49 12_526YZ_D02_08 Enterobacter sp. strain E1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence bacteria Gram negativa Bueno 50 13-483NZ_E02_10 Enterobacter hormaechei cepa AMS-38 cromosoma, genoma completo bacteria Gram negativa Regular 51 14-483H_F02_12 Bacillus paramycoides strain MGAR001 16S ribosomal RNA gene, partial sequence bacterias ubicuas productoras de esporas Bueno 52 15-456NZ_G02_14