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Determinacion de secuencia de ADN usando Bioedit
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BIOTECNOLOGIA Determinación de secuencia de ADN en BioEdit INTEGRANTES Anco Martínez, Salma Gabriela Apaza Mayta, Liz de Flor Karito Capia Choque, Eduard Jair Huamantuma Chire, Tatihana Karolay DOCENTE Dr. Hebert Hernán Soto Gonzales ILO 2023
NOMBRE DE ARCHIVO CALIDAD DE SECUENCIA TIPO DE ORGANISMO N° GRUPO CORRESPONDE A: Bacteria 1 H_10_16_16 Buena Enterobacter sp. IICDBZ9 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Bacteria 2 G10_15_14 Regular Enterobacter asburiae cepa CCMM_B1216 gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 3 E10_13_10 Mala Escherichia coli cepa 804533 cromosoma, genoma completo ------- 4 F10_14_12 Mala No se encontro similitud ------- 5 H09_8_15 Buena No se encontro similitud G1 Bacteria 6 G09_7_13 Regular Enterobacter sp. clon F2feb.59 gen RNA ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 7 E09_5_09 Mala Enterobacter ludwigii cepa PR16 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 8 F09_6_11 Regular Klebsiella pneumoniae cepa 156070 cromosoma, genoma completo ------- 9 H07_8H_15 Buena No se encontro similitud Bacteria 10 F07_6H_11 Regular Enterobacter ludwigii cepa P6 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 11 G07_7H_13 Buena Kosakonia radicincitans cepa SPTVE4 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial B11_18_03 Mala Pseudomonas sp. cepa VWK3 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 12 C07_3H_05 Regular Enterobacter sp. cepa C7-5A gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 13 C08_11H_06 Mala Enterobacter sp. Gen NA10140 para ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 14 C09_3_05 Mala Phytobacter diazotrophicus cepa UAEU22 cromosoma, genoma completo Bacteria 15 C10_11_06 Regular Pseudomonas plecoglossicida cepa VITKSSJ1 gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 16 C11_19_05 Regular Enterobacter aerogenes cepa IEY 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 17 G2 D07_4H_07 Regular Clon de bacteria sin cultivar nbu186h08c1 gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 18 D08_12H_08 Mala Staphylococcus sp. US-13 Gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 19 D09_4_07 Mala Phytobacter diazotrophicus cepa UAEU22 cromosoma, genoma completo Bacteria 20 D10_12_08 Regular Pseudomonas guariconensis cepa LE3 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 21 E07_5H_09 Mala No se encontro similitud ------- 22 E08_13H_10 Regular Paraburkholderia silvatlantica cepa NRB111 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 23 E09_5_09 Mala Enterobacter sp. cepa MBWS19.(20) gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 24 01_A03_01 Regular Pectobacterium atrosepticum cepa JB87_16s 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 25 02_B03_03 Mala Clon de bacteria del suelo sin cultivar GO0VNXF07IGBIA gen de ARN ribosómico 16S Clon de Bacteria 26 03_C03_05 Mala Klebsiella pneumoniae cepa L1 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 27 04_D03_07 Mala Kosakonia oryzae cepa R5-326-1 gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 28 05_E03_09 Buena Enterobacter sp. cepa AAUGM-14 gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 29 06_F03_11 Mala No se encontro similitud ------- 30 G3 07_G03_13 Mala No se encontro similitud ------- 31 08_H03_15 Regular Erwinia sp. ZFGT-4 Gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 32 09_A04_02 Mala No se encontro similitud ------- 33 10_B04_04 Buena Achromobacter xylosoxidans cepa MBGIPS 12 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 34 11_C04_06 Regular Enterobacter cloacae cepa B1 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 35 12_D04_08 Regular Enterobacteriaceae bacteria HGH0104 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 36 13_E04_10 Mala No se encontro similitud ------- 37 526Y1_F01_11 Mala Klebsiella pneumoniae cepa SJC153 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 38 419Y1_G01_13 Mala Enterobacter sp. WF14-6 Gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 39 375H_H01_15 Mala Klebsiella oxytoca cepa ac1w1-1 gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 40 419YZ_A02_02 Regular Enterobacter cloacae cepa RAT2 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 41 419NZ_A01_01 Mala Klebsiella oxytoca PS10 gen para 16S rRNA, secuencia parcial Bacteria 42 526NZ_B01_03 Buena Klebsiella pneumoniae cepa FF1009 cromosoma, genoma completo Bacteria 43 419AZ_C01_05 Buena Klebsiella sp. cromosoma MPUS7, genoma completo Bacteria 44 G4 88NZ_D01_07 Buena Klebsiella pneumoniae cepa CEMTC_3772 gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 45 88AZ_E01_09 Buena Klebsiella pneumoniae cepa KP18E 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 46 88H_B02_04 Mala Clon bacteriano no cultivado ncd490h11c1 16S gen de ARN ribosomal, secuencia parcial Bacteria 47 375NZ_C02_06 Mala Pantoea agglomerans cepa Art_E4 gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 48 526YZ_D02_08 Mala Klebsiella variicola cepa FH-1 cromosoma, genoma completo Bacteria 49 483NZ_E02_10 Regular Enterobacter sp. Gen NA10140 para ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 50 483H_F02_12 Regular Enterobacter hormaechei cepa AMS-38 cromosoma, genoma completo Bacteria 51 456NZ_G02_14 Buena Bacillus cereus cepa JSM 05182068 Gen de ARN ribosomal 16S, secuencia parcial Bacteria 52