1 / 95

Valkude post-translatsiooniline modifitseerimine Valkude degradeerimine

Valkude post-translatsiooniline modifitseerimine Valkude degradeerimine. Valkude modifitseerimine. Proteolüütiline protsessimine. Valkude modifitseerimine. Proteolüütiline protsessimine N-otsa modifitseerimine. Valkude modifitseerimine. Proteolüütiline protsessimine N-otsa modifitseerimine

bliss
Download Presentation

Valkude post-translatsiooniline modifitseerimine Valkude degradeerimine

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Valkude post-translatsiooniline modifitseerimineValkude degradeerimine

  2. Valkude modifitseerimine • Proteolüütiline protsessimine

  3. Valkude modifitseerimine • Proteolüütiline protsessimine • N-otsa modifitseerimine

  4. Valkude modifitseerimine • Proteolüütiline protsessimine • N-otsa modifitseerimine • C-otsa modifitseerimine

  5. Valkude modifitseerimine • Proteolüütiline protsessimine • N-otsa modifitseerimine • C-otsa modifitseerimine • Atsetüleerimine

  6. Valkude modifitseerimine • Proteolüütiline protsessimine • N-otsa modifitseerimine • C-otsa modifitseerimine • Atsetüleerimine • Glükosüleerimine

  7. Valkude modifitseerimine • Proteolüütiline protsessimine • N-otsa modifitseerimine • C-otsa modifitseerimine • Atsetüleerimine • Glükosüleerimine • Metüleerimine

  8. Valkude modifitseerimine • Proteolüütiline protsessimine • N-otsa modifitseerimine • C-otsa modifitseerimine • Atsetüleerimine • Glükosüleerimine • Metüleerimine • Disulfiidsidemete moodustumine

  9. Valkude modifitseerimine • Proteolüütiline protsessimine • N-otsa modifitseerimine • C-otsa modifitseerimine • Atsetüleerimine • Glükosüleerimine • Metüleerimine • Disulfiidsidemete moodustumine • Proliini cis-trans isomerisatsioon

  10. Proteolüütiline protsessimine • valkude splaissing • inteiine leitud ainult ainuraksetel (arhed, pro- ja eukarüoodid) • kiire protsess • valkude autoprotsessimine (hedgehog etc.)

  11. Valkude splaissing Proc. Natl. Acad. Sci. USA Vol. 95, pp. 1356–1357, February 1998

  12. Valkude splaissing TIBS 24 – JUNE 1999, pp. 209-211

  13. Valkude splaissing Cell, Vol. 92, 1–4, January 9, 1998,

  14. N-otsa modifitseerimine • Deformüleerimine

  15. N-otsa modifitseerimine • Deformüleerimine • Metioniini eemaldamine

  16. N-otsa modifitseerimine • Deformüleerimine • Metioniini eemaldamine • Aminohappejääkide lisamine

  17. N-otsa modifitseerimine • Deformüleerimine • Metioniini eemaldamine • Aminohappejääkide lisamine • Müristüleerimine

  18. Deformüleerimine • bakterites, mitokondrites ja kloroplastides on polüpeptiidi sünteesi initsieeriv metioniin N-formüleeritud

  19. Deformüleerimine

  20. Deformüleerimine • bakterites, mitokondrites ja kloroplastides on polüpeptiidi sünteesi initsieeriv metioniin N-formüleeritud • formüülgrupp kantakse metionüül-tRNAfMet'le 10-formüültetrahüdro-folaadilt

  21. Deformüleerimine • bakterites, mitokondrites ja kloroplastides on polüpeptiidi sünteesi initsieeriv metioniin N-formüleeritud • formüülgrupp kantakse metionüül-tRNAfMet'le 10-formüültetrahüdro-folaadilt • reaktsiooni katalüüsib metioniin-tRNAfMet formüültransferaas (fmt)

  22. Deformüleerimine • formüülgrupp eemaldatakse kasvavast peptiidist peaaegu eranditult (ainus teadaolev formüleeritud valk E. coli's on Tsr kemotaksise retseptor valk)

  23. Deformüleerimine • formüülgrupp eemaldatakse kasvavast peptiidist peaaegu eranditult (ainus teadaolev formüleeritud valk E. coli's on Tsr kemotaksise retseptor valk) • reaktsiooni katalüüsib peptiidi deformülaas (def)

  24. Deformüleerimine • formüülgrupp eemaldatakse kasvavast peptiidist peaaegu eranditult (ainus teadaolev formüleeritud valk E. coli's on Tsr kemotaksise retseptor valk) • reaktsiooni katalüüsib peptiidi deformülaas (def) • formüülgrupp peab olema eemaldatud enne metioniini lõikamist

  25. Deformüleerimine • def ja fmt on ko-transkribeeritud

  26. Deformüleerimine • def ja fmt on ko-transkribeeritud • def mutatsioonid on letaalsed

  27. Deformüleerimine • def ja fmt on ko-transkribeeritud • def mutatsioonid on letaalsed • fmt mutatsioonid mõjutavad kasvukiirust

  28. Deformüleerimine • def ja fmt on ko-transkribeeritud • def mutatsioonid on letaalsed • fmt mutatsioonid mõjutavad kasvukiirust • def fmt on elujõulised, kuid aeglase kasvuga ja ei kasva kõrgetel temperatuuridel

  29. Deformüleerimine • N-formüleerimine ei ole elutegevuseks hädavajalik, vaid optimaalne

  30. Deformüleerimine • N-formüleerimine ei ole elutegevuseks hädavajalik, vaid optimaalne • N-deformüleerimise puudumine takistab: • valkude voltumist • valkude protsessimist (metioniini eemaldamist)

  31. Metioniini eemaldamine • metioniini aminopeptidaas (MAP) on inaktiivne N-formüül-metionüül peptiidil in vitro

  32. Metioniini eemaldamine

  33. Metioniini eemaldamine

  34. Metioniini eemaldamine • metioniini aminopeptidaas (MAP) on inaktiivne N-formüül-metionüül peptiidil in vitro • kui: • teises positsioonis on Gly, Ser, Ala - eemaldatakse metioniin ~100% • teises positsioonis on Arg, His, Trp, Tyr, Phe, Glu - metioniini ei eemaldata • rusikareegel (peaaegu) - kui teises positsioonis oleva AH güratsiooniraadius on <=1,29A, siis N-metioniin eemaldatakse

  35. Metioniini eemaldamine • map mutatsioonid on letaalsed: • nuklefiilsed hüdrolaasid: • vajalik N-terminaalne nukleofiilne AH (Cys, Ser või Thr) • N-formüleeritud valkude akumuleerumine

  36. Müristüleerimine • toimub eukarüootides, ko-translatsiooniliselt

  37. Müristüleerimine • toimub eukarüootides, ko-translatsiooniliselt • müristaat (C14:0) liidetakse amiidsidemega N-terminaalse glütsiini külge

  38. Müristüleerimine • toimub eukarüootides, ko-translatsiooniliselt • müristaat (C14:0) liidetakse amiidsidemega N-terminaalse glütsiini külge • reaktsiooni katalüüsib müristüül-CoA:protein N-müristüültransferaas (NMT)

  39. Müristüleerimine • teises positsioonis on eelistatud mittelaetud AHd

  40. Müristüleerimine • teises positsioonis on eelistatud mittelaetud AHd • kolmandas ja neljandas on eelistatud neutraalsed AHd

  41. Müristüleerimine • teises positsioonis on eelistatud mittelaetud AHd • kolmandas ja neljandas on eelistatud neutraalsed AHd • viiendas positsioonis on konserveerunud Ser

  42. Müristüleerimine • teises positsioonis on eelistatud mittelaetud AHd • kolmandas ja neljandas on eelistatud neutraalsed AHd • viiendas positsioonis on konserveerunud Ser • kuuendas positsioonis on tavaliselt Lys

  43. Palmitüleerimine • palmitaat (C16:0) liidetakse tioester-sidemega tsüsteiini sulfhüdrüülgrupi külge • Sonic hedgehog - N-terminaalse tsüsteiini aminogrupi küljes

  44. Palmitüleerimine • palmitaat (C16:0) liidetakse tioester-sidemega tsüsteiini sulfhüdrüülgrupi külge • Sonic hedgehog - N-terminaalse tsüsteiini aminogrupi küljes • palmitüleeritud tsüsteiinid paiknevad üle kogu valgu

  45. Müristüleerimine • stabiliseerib ruumilist struktuuri

  46. Müristüleerimine • stabiliseerib ruumilist struktuuri • membraan-seondumine • vajalik, kuid mitte piisav

  47. Müristüleerimine • stabiliseerib ruumilist struktuuri • membraan-seondumine • vajalik, kuid mitte piisav • lokalisatsioon membraanis

  48. Müristüleerimine

  49. Müristüleerimine

  50. C-otsa modifitseerimine • Prenüleerimine • farnesüleerimine • geranüülgeranüliseerimine • Fosfatidüülinositool lisamine

More Related