170 likes | 315 Views
Nové aminopyrimidínové deriváty ako inhibítory TAM rodiny. ___________________________________ Traoré, T.; Cavagnino, A.; Saettel, N.; Radvanyi, F.; Piguel, S.; Bernard-Pierrot, I.; Stoven, V. Eur J Med Chem . 2013 , 70 , 789-801. Marek Ondruš, 12.2.2014. Cieľ, inšpirácia práce.
E N D
Nové aminopyrimidínové deriváty ako inhibítory TAM rodiny ___________________________________ Traoré, T.; Cavagnino, A.; Saettel, N.; Radvanyi, F.; Piguel, S.; Bernard-Pierrot, I.; Stoven, V. Eur J Med Chem. 2013, 70, 789-801. Marek Ondruš, 12.2.2014
Cieľ, inšpirácia práce • BMS-777607: • - inhibítor proteínu Met • 2 fáza klinických štúdii • východisková látka pre syntézu selektívnych inhibítorov
Schválené inhibítory Imatinib (STI-571)chronická myeloidná leukémia (CML) Erlotinib (Tarceva) Rakovina pľúc (NSCLC)
Aminofenoxypyrimidíny SN redukcia (a) K2CO3, DMF, 80 °C, 3 h, 87 % (5a), 93 % (5b). (b) Raneyov Ni, H2, MeOH, RT, 5 h, 47 % (6a), 75 % (6b).
Kyseliny pyridónkarboxylové Michaelova adícia + vnútromolekulová cyklizácia hydrolýza (a) 1) DMF, 7 h, 0 °C 2) EDCI, DMAP, 12 h, RT. Výťažky: 8a-e (30, 34, 27, 52 a 21 %). (b) LiOH, THF, 3 h, RT. Výťažky: 9a-e (98, 96, 90, 96 a 92 %).
Couplingové reakcie (a) TBTU, DIPEA, DMF, 0 °C. 4 h (b) TBTU, DIPEA, DMF, 60 °C, 4 h. Výťažky: 11a-e (82, 82, 84, 88 a 84 %). (c) p-MeO-benzylamín, Cs2CO3, DME, reflux, 6 h. Výťažky: 12a-e (85, 90, 77, 94, 83 %). (d) TFA, DCM, reflux, 6 h. Výťažky: 13a-e (74, 55, 83, 68 a 91 %). (e) Cs2CO3, DME, reflux, 2 h, amín: 4-(2-aminoetyl)morfolín alebo metylamín. 76 % (14) a 55 % (15).
TBTU O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N´,N´-tetrametylurónium tetrafluoroborát
Aminofenoxypyrimidíny redukcia SN (a) K2CO3, DMF, 80 °C, 3 h. Výťažky: 58 % (17). (b) K2CO3, DMF, 60 °C, 30 min, p-MeOebenzyl-NH2. Výťažky: 26 % (18a) alebo MeNH2, výťažok: 16 % (20). (c) Zn, NH4Cl, MeOH/THF, 1:1, RT, 1 h. Výťažky: 96 % (19a), 99 % (19b).
Vhodná poloha NH2 skupiny? (a) TBTU, DIPEA, DMF, 0 °C, 4 h. Výťažky: 85 % (20a), 40 % (20b). (b) TFA, DCM, reflux, 12 h, Výťažok: 85 % (21).
Vhodná poloha NH2 skupiny? • Prítomnosť NH2 skupiny je veľmi podstatná, predstavuje donor vodíkových väzieb pre väzbu s M606 v Tyro3 a s M1160 v 3F82 štruktúre Met • Veľmi podobné selektívne profily 13d a 21 poloha NH2 skupina nezohráva úlohu v inhibícii • Menej aktívne voči voči Braf a EGFR ako BMS-777607 vyššia selektivita voči HGFR/TAM
Pyridínový či pyrimidínový kruh? - Prítomnosť etoxy skupiny nezohráva úlohu v inhibičnej aktivite - 21 je menej aktívna voči Braf a EGFR ako BMS-777607 vyššia selektivita voči HGFR/TAM
Prítomnosť/neprítomnosť F (a) TBTU, DIPEA, DMF, 0 °C, 4 h, potom 60 °C, 12 h. Výťažok: 72 % (22). (b) 1) p-MeOebenzyl-NH2, DME, reflux, 6 h. 2) TFA, DCM, reflux, 12 h. Výťažok pre 2 kroky: 69 % (23).
Prítomnosť/neprítomnosť F • Veľmi podobné selektívne profily zlúčenín 13d a 23 prítomnosť F nezohráva úlohu v inhibičnej aktivite
Substitúcia terminálneho fenylu? • Pridanie substituentov (F, CH3) do polohy orto nemá vplyv na inhibičnú aktivitu voči Axl a Met, aktivita voči Tyro3 a Mer je zrušená zvýšená selektivita • Pridanie substituentov do polohy meta 13b vedie k strate aktivity voči Tyro3
NH- substituované inhibítory • Zlúčeniny nesúce –NH skupinu na pyrimidínovom kruhu (namiesto NH2) sú neaktívne, pretože substituenty bránia vytvoreniu vodíkových väzieb v ATP väzbovom mieste • výnimkou je zlúčenina 14
Výsledky práce • všetky aktívne testované zlúčeniny majú menšiu účinnosť voči Braf, Abl1, Tyro3 a Mer • nasyntetizované zlúčeniny majú lepšie selektívne vlastnosti ako BMS-777607 • zlúčeniny 13c, 13d, 14 a 21 predstavujú selektívne inhibítory Axl a Met • prítomnosť NH2 skupiny potrebná ako donor vodíkových väzieb 13d, 21 • prítomnosť pyrimidínového kruhu zvyšuje selektivitu 21 • orto substituovaný terminálny fenyl zvyšuje selektivitu voči Axl a Met 13a, 13c • - poloha NH2 skupiny nezohráva úlohu v inhibičnej aktivite 13d / 21 • - prítomnosť F na centrálnom benzéne nezohráva úlohu v inhibičnej aktivite 13d / 23 • meta substituovaný terminálny fenyl ruší inhibičnú aktivitu 13b • NH substituované zlúčeniny sú neaktívne, výnimkou je štruktúra s morfolínom 14