1 / 31

Podstawy mikrobiologii środowiska

Podstawy mikrobiologii środowiska. Związek ewolucyjny pomiędzy Archea, Bacteria i Eukarya. Różnice pomiędzy Archea, Bacteria i Eukarya. Elementy struktury komórki bakteryjnej, roślinnej i zwierzęcej. Bakterie – rodzaje ściany komórkowej. Megabakteria.

cullen
Download Presentation

Podstawy mikrobiologii środowiska

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Podstawy mikrobiologii środowiska

  2. Związek ewolucyjny pomiędzy Archea, Bacteria i Eukarya

  3. Różnice pomiędzy Archea, Bacteria i Eukarya

  4. Elementy struktury komórki bakteryjnej, roślinnej i zwierzęcej

  5. Bakterie – rodzaje ściany komórkowej

  6. Megabakteria Bakteria Epulopiscium fishelsoni jest największą znaną bakterią. Komórka tego drobnoustroju, będącego składnikiem flory bakteryjnej ryb żyjących w Morzu Czerwonym, ma długość dochodzącą do 0.6 mm.

  7. Glony (algi) Mikroalgi Chlorella Haematococcus pluviatus Makroalgi (wodorosty)

  8. GRZYBY Zygomycetes – grzyby pleśniowe, sprzężniaki Grzybnia zbudowana z niepodzielnego mycelium. Rozmnażanie płciowe poprzez zarodniki zwane zygosporami lub bezpłciowe poprzez spory w sporangium. Ascomycetes – workowce Grzyby jednokomórkowe lub tworzące grzybnię w postaci podzielnych strzępek. Rozmnażanie płciowe poprzez askospory lub bezpłciowe przez konidia. Do tej klasy należą m.in. Neurospra, Penicillium. Mucor racemous Aspergillus fumigatus Penicillium chrysogenum

  9. Basidomycetes – podstawczaki Grzyby jednokomórkowe lub rozgałęzione. Rozmnażanie płciowe poprzez basidospory lub bezpłciowe poprzez konidia. Do tej klasy należą grzyby kapeluszowe. Deuteromycetes – grzyby niedoskonałe Grzyby jednokomórkowe lub rozgałęzione. Cecha charakterystyczna – brak rozmnażania płciowego. Amanita phalloides Candida albicans

  10. Morfologia wzrostu grzyba na podłożu utwardzonym

  11. Sposoby wzrostu komórek drobnoustrojów

  12. Pierwotniaki Na poziomie komórkowym dość bliskie zwierzętom; Jednokomórkowce niefotosyntetyzujące; Brak ściany komórkowej; Rozmnażanie wegetatywne (podział) lub seksualne poprzez połączenie haploidalnych gamet; Główne znaczenie: czynnik etiologiczny chorób infekcyjnych po spożyciu wody oraz w aerobowym oczyszczaniu ścieków Paramecium

  13. Metody pomiaru ilości biomasy lub liczby komórek • Określenie wilgotnej lub suchej masy • Określenie objętości upakowanej biomasy • Pomiar gęstości optycznej zawiesiny komórek • Cytometria przepływowa • Hemocytometria • Licznik Coultera • Określenie CFU metodą posiewową lub poprzez wybarwienier

  14. Komora do pomiaru liczby komórek drobnoustrojów

  15. Schemat licznika Coultera

  16. Schemat cytometru przepływowego

  17. Określanie liczby żywych komórek (CFU)

  18. Metody analizy in situ populacji drobnoustrojów • Mikroskopia elektronowa i konfokalna (CLSM) • Testy ELISA • Analiza lipidów (PLFA) • Analiza rRNA • Technologia PCR • In situ hybrydyzacja

  19. Mikroskopia konfokalna Optyczne cięcie sfery przez płaszczyzny konfokalne Obraz CSLM matrycy kolagenowej z rosnącymi fibroblastami wybarwionymi fluorescencyjnymi przeciwciałami rozpoznającymi tubulinę W technice CSLM próbka naświetlana jest spolaryzowanym promieniem lasera podawanym pod różnymi kątami. Emitowana fluorescencja jest poddawana „filtracji” w szczelinie dla wyeliminowania promieniowania pochodzącego z innych płaszczyzn. W efekcie otrzymuje się serię obrazów dla kilkudziesięciu płaszczyzn, których suma daje praktycznie trójwymiarowy obraz próbki. Zasada działania konfokalnego mikroskopu skanującego

  20. Testy ELISA • Zasada: • Otrzymuje się przeciwciała rozpoznające • antygeny obecne w ścianach komórkowych • drobnoustrojów. • Konstruuje się koniugaty przeciwciał • z markerami fluorescencyjnymi • Koniugaty immobilizuje się w studzienkach • mikropłytek • Do studzienek dodaje się próbki • Odmywa się komórki niezwiązane • Mierzy się intensywność afektu optycznego, • który jest miarą ilości komórek danego gatunku • obecnych w próbce

  21. Analiza lipidów (PLFA) Ekstrakcja składników lipidowych z próbek środowiskowych

  22. Analiza rRNA Ekstrakcja kwasów nukleinowych z próbek środowiskowych w celu izolacji i identyfikacji sekwencji rRNA

  23. In situ hybrydyzacja Obraz populacji drobnoustrojów w biofilmie uzyskany w wyniku zastosowania techniki FISH

  24. Pośrednie metody pomiary tempa wzrostu

  25. Warunki wzrostu bakterii umiarkowanie i silnie halofilnych

  26. Podział drobnoustrojów w zależności od optymalnych temperatur wzrostu

  27. Wpływ obecności tlenu na wzrost różnych grup drobnoustrojów

  28. Fazy wzrostu drobnoustrojów

  29. Struktura biofilmu

  30. Tworzenie endosporu i kiełkowanie sporu

More Related