Espèce et spéciation : problématique générale

1. Espèce et spéciation : problématique générale Sarah Samadi & Anouk Barberousse

2. Consommation de plantes sauvages en Ethiopie (Balanites aegyptiaca) Indien Kapayos du Brésil Connaissances des vertus médicinales des plantes La perception intuitive des espèces

3. Biodiversité • Une tâche d’inventaire • Un objectif de reconstruction des processus qui l’ont produite • Avec Darwin, la perception de la biodiversité, instantanée, s’explique comme le produit d’une histoire continue

4. La révolution darwinienne Variation + descendance  évolution

5. Décrire vs. Expliquer • Etudier les espèces et les mécanismes de spéciation, ce n’est donc pas seulement dérouler le film de l’évolution, c’est surtout comprendre les causes de cette histoire. • Il s’agit donc de proposer des modèles explicatifs.

6. Exemple : Pasteur et la réfutation de la génération spontanée • Le phénomène à expliquer : e.g. apparition d’asticots sur de la viande • Le modèle couramment accepté : la génération spontanée • L’expérimentation apporte la réfutation du modèle • Ce qui permet de proposer un nouveau modèle • Les données accumulées depuis confortent le modèle

7. La Sélection Naturelle : un modèle explicatif général • Les faits : diversité actuelle et fossile et sa structuration (pattern discret à un instant et pattern continu dans le temps) • Le modèle existant : chaque espèce résulte d’un événement unique de génération (création) • Les données expérimentales qui permettent de proposer un modèle : la sélection artificielle (expérimentation peu contrôlée) • Les données accumulées ont permis de conforter et d’affiner le modèle (par exemple en introduisant des raisonnements probabilistes)

8. Les modèles particuliers Pour conforter le modèle général, on évalue sa capacité à expliquer des ensembles circonscrits de faits grâce à un modèle particulier c’est-à-dire restreint aux paramètres propres au cas étudié • Tectonique des plaques = explication générale • Collision Inde / Asie = un modèle particulier pour expliquer la formation de l’Himalaya • C’est un nouveau modèle (pas une dérivation triviale du modèle général) • Il est réfutable

9. modèle alternatif Barrière Extrinsèque Sélection Naturelle Espèces sœurs Espèces sœurs Barrière d’Isolement Reproducteur Application à la biologie évolutive Exemples de modèles généraux : spéciation allopatrique, écologique etc… modèle canonique

10. espèce X Espèces soeurs espèce Y Allopatrie Sympatrie espèce Z outgroup Application à la biologie évolutive • Pattern (phylogénie, données fossiles, structure génétique) = ensemble d’hypothèses descriptives des faits à expliquer • À partir de ce pattern, proposition d’un modèle particulier qui peut être une combinaison des modèles généraux

11. Thèse Magalie Castelin Alcithoe Cancellopollia Chicoreus

12. Thèse Magalie Castelin

13. D'après "Classification phylogénétique du vivant" G. Lecointre et H. Le Guyader, Editions Belin Patterns On reconstruit des patterns On s’appuie sur de tels patterns pour proposer des modèles explicatifs Mais ces patterns sont eux-mêmes des hypothèses réfutables Typiquement, les clades sont des hypothèses sur l’histoire évolutive D'après "Au commencement était l'homme - De Toumaï à Cro-Magnon" Pascal Picq

14. Patterns: clades et espèces De même, les espèces décrites sont des hypothèses sur la réalité biologique et non directement cette réalité. Lucanus cervus. Les espèces, au même titre que les organismes, interagissent individuellement avec leur environnement biotique et abiotique Les clades décrits ne peuvent que témoigner des processus qui ont agi dans le passé sur les espèces

15. Conclusion • Cela montre que les approches « pattern » et « process » ne doivent pas être opposées. • Au contraire, la justification de la recherche de patterns est qu’ils permettent de comprendre les processus.