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TRADUCCIÓN NOMBRES: CRISTIAN VELASCO ELKIN BONET LEIDY LORENA DIAZ JHON CARRASCAL LICENCIADA: EDNA DAVID MANUEL GERMAN CUELLO GUTIEREZ VALLEDUPAR CESAR 2008. Lic. Edna Margarita David Giraldo. Insulina. Simulación de la traducción. Bases
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TRADUCCIÓN NOMBRES: CRISTIAN VELASCO ELKIN BONET LEIDY LORENA DIAZ JHON CARRASCAL LICENCIADA:EDNA DAVID MANUEL GERMAN CUELLO GUTIEREZ VALLEDUPAR CESAR 2008
Lic. Edna Margarita David Giraldo Insulina Simulación de la traducción
Bases nitrogenadas Instrucción: Te desplazarás por las diapositivas de manera automática. Si necesitas pausar la diapositiva lo puedes hacer presionando la tecla hacia adelante o hacia atrás Producto: simular la traducción de la insulina humana en las bacterias
Enzimas de restricción Plásmido recombinado ADN Plásmido Enzimas ADN de enlace Plásmido 4 3 Bacterias con el plásmido recombinado 5 6 Bacteria Colonias de bacterias 7 Filtro para aislar a las colonias 2 8 La sonda deja una marca negra Con la posición de la colonia exacta 9 Las bacterias con el ADN de las hormonas del crecimiento se colocan en un medio de cultivo, en el que introducirán una cantidad de hormonas mucho mayor que la producida por la hipófisis. 10 El filtro se pone en contacto con una sonda radioactiva, esta es un fragmento de ADN capaz de localizar el ADN homologo 1
Tarea: simular la traducción de la insulina humana en las bacterias fmet fen val asn gln his leu cis NH2_ _COOH Intrucciones Simula la fabricación de la hormona insulina en el ribosoma de la bacteria pero solamente para la traducción de los cinco primeros aminoácidos que conforman la proteína. Una vez fabricada la proteína, resalta la unión mediante el enlace peptídico con su estructura primaria. Para ello utiliza la plantilla que te servirá de modelo y las herramientas de apoyo en la sección de química video que te guían para hacer la animación y su explicación oral. siguiente
1 Plantilla Modelo de la simulación de la traducción Modelo El modelo de la simulación corresponde a un trabajo presentado por los estudiantes Cristian, Elkin y leidy Díaz de lo grado 1102. En este modelo, se fabrica la insulina y se presentan los cinco primeros aminoácidos que conforman esta proteína. fmet fen val asn gln his leu cis NH2_ _COOH ala: alanina arg: arginina asn: asparagina asp: ácido aspártico cis: cisteína gln: glutamina gli: glicina Glu: glutamato his: histidina ile: isoleucina leu: leucina lis: lisina met: metionina fmet: metioninaformilada (bacterias) fen: fenilalanina pro:prolina ser: serina tre: treonina tri: triptófano tir: tirosina val: valina Otra abreviatura term: terminación siguiente Abreviaturas de los aminoácidos
2 Plantilla Iniciación: La subunidad pequeña del ribosoma se une a la región líder del ARNm y el ARNm se desplaza hasta llegar al codón AUG, que codifica el principio de la proteína. Se les une entonces el complejo formado por el ARNt-metionina formilada (fmet). La unión se produce entre el codón del ARNm y el anticodón del ARNt que transporta la formilmetionina (fmet). Subunidad menor del ribosoma P A 3’ 5’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A U A C Codón Anticodón ARNt ARNm fmet Siguiente (i) 1er aminoácido
3 A A A fen Plantilla Elongación I: A continuación se une la subunidad mayor a la menor completándose el ribosoma. El complejo ARNt-aminoácido2, la fenilalanina (fen) [ARNt-feni] se sitúa enfrente del codón correspondiente (UUU). La región del ribosoma a la que se une el complejo ARNt-fense le llama región aminoacil (A). Subunidad menor del ribosoma P A 3’ AAAAAAAAAAA 5’ A U G U U U G U U A A U C A A U A C fmet Siguiente (i)
4 Plantilla Elongación II: Se forma el enlace peptídico entre el grupo carboxilo de la Formilmetionina (fmet) y el grupo amino del segundo aminoácido, la fenilalanina (fen). P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G C U A A U C A A U A C A A A fen-fmet Siguiente
5 Plantilla Elongación III: El ARNt del primer aminoácido, la Formilmetionina (fmet) se libera. P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A A A A U A C fen-fmet Siguiente
6 Plantilla Elongación IV: El ARNm se traslada, de tal manera que el complejo ARNt fen-fmet queda en la región peptidil del ribosoma, quedando ahora la región aminoacil (A) libre para la entrada del complejo ARNt-aa3 P A 5’ ARNm AAAAAAAAAAA 3’ A U GU U U G U U A A U C A A A A A fen-fmet Siguiente
7 C A A val Plantilla Elongación V: Entrada en la posición correspondiente a la región aminoacil (A) del complejo ARNt-val, correspondiente al tercer aminoácido, la valina (val). P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A A A A fen-fmet Siguiente
8 Plantilla Elongación VI: Unión del péptido fmet-fen () a la valina (val). P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A C A A A A A val-fen-fmet Siguiente
9 A A A Plantilla Elongación VII: Se libera el ARNt correspondiente al segundo aminoácido, la fenilalanina (fen). P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A C A A val-fen-fmet Siguiente (i) (i)
10 Plantilla Elongación VIII: El ARNm corre hacia la otra posición, quedando el complejo ARNt3-val-fen-fmet en la región peptidil del ribosoma. P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A C A A val-fen -fmet Siguiente
11 Plantilla Elongación IX: Entrada del complejo ARNt-asn correspondiente al 4º aminoácido, la asparagina. P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A C A A U U A val-fen-fmet Siguiente asn
12 Plantilla Elongación X: Este se sitúa en la región aminoacil (A). P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A C A A U U A asn val-fen- fmet Siguiente
13 C A A Plantilla Elongación XI: Unión del péptido fmet-fen-val con el 4º aminoácido, la asparagina(asn). Liberación del ARNt la asparagina. El ARNm se desplaza a la 5ª posición P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A U U A asn-val-fen-fmet Siguiente
14 Plantilla Elongación XII: Entrada del ARNt del la glutamina, el 5º aminoácido, la gln (ARNt-gln). P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA A U GU U U G U U A A U C A A U U A G U U asn-val-fen-fmet gln Siguiente
15 U U A Plantilla Elongación XIII:Unión del péptido fmet-fen-val-asn con el 5º aminoácido, la glutamina (gln). Liberación del ARNt de glutamina (gln). El ARNm se desplaza a la 6ª posición, se trata del un codón de finalización o de stop. P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA 5’ A U GU U U G U U A A U C A A G U U asn-val-fen-fmet Siguiente
16 G U U U U A Plantilla Finalización I: Liberación del péptido o proteína. Las subunidades del ribosoma se disocian y se separan del ARNm. P A 5’ ARNm 3’ AAAAAAAAAAA 5’ A U GU U U G U U A A U C A A gln-asn-val-fen-fmet Siguiente (i)
17 A U A U U U G U G U A A C A U Plantilla Finalización II: Después unos minutos los ARNm son digeridos por las enzimas del hialoplasma. ARNm 3’ AAAAAAAAAAA 5’ Siguiente (i)
18 Plantilla Descifrar el código genético Finalizar la simulación Instrucciones De acuerdo al marco de lectura de las tripletas de bases nitrogenadas en la cadena de ARNm. Se indica el tipo de aminoácido que corresponde cada uno. Guíate de la tabla de código genético. 5’ 3’ AAAAAAAAAAA A U G U U U G U U G U U A A U C A A C A U C U U U G U fmet fen val asn gln his leu cis NH2_ _COOH ala: alanina arg: arginina asn: asparagina asp: ácido aspártico cis: cisteína gln: glutamina gli: glicina Glu: glutamato his: histidina ile: isoleucina leu: leucina lis: lisina met: metionina fmet: metioninaformilada (bacterias) fen: fenilalanina pro:prolina ser: serina tre: treonina tri: triptófano tir: tirosina val: valina Otra abreviatura term: terminación Instrucciones siguiente Abreviaturas de los aminoácidos
19 Plantilla Tabla del código genético Anterior siguiente
FIN de la presentación Bases nitrogenadas instrucciones Producto: simular la traducción de la insulina humana en las bacterias Salir