1 / 36

GÖĞÜS HASTALIKLARINDA GENETİK ARAŞTIRMA Prof. Dr. Nejat Akar Ankara Üniversitesi

GÖĞÜS HASTALIKLARINDA GENETİK ARAŞTIRMA Prof. Dr. Nejat Akar Ankara Üniversitesi. DNA. Gen Dizileri, SNPs. Genomik. RNA. Transkriptomik. RNA. Protein. Tüm Protein içeriği. Proteomik. Normal ve değişen koşulda protein farklanmaları. Hücre. Diferansiyel Proteomik. Doku.

emi-melendez
Download Presentation

GÖĞÜS HASTALIKLARINDA GENETİK ARAŞTIRMA Prof. Dr. Nejat Akar Ankara Üniversitesi

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. GÖĞÜS HASTALIKLARINDA GENETİK ARAŞTIRMA Prof. Dr. Nejat Akar Ankara Üniversitesi

  2. DNA Gen Dizileri, SNPs Genomik RNA Transkriptomik RNA Protein Tüm Protein içeriği Proteomik Normal ve değişen koşulda protein farklanmaları Hücre Diferansiyel Proteomik Doku Protein Modifikasyonları; Protein/DNA, Protein/RNA, Protein/Ligand, Protein/Protein Etkileşimleri Fonksiyonel Proteomik Organ Protein Fonksiyonu; Hücre, Doku, Organ, Etkileşimler Metabolomik Farmakogenomik/ Farmakoproteomik Nereden örnek alabiliriz ?

  3. 70 yaş / erkek DVT tanısıyla servise kabul edildi Ailede DVT öyküsü yok 45 yaş / erkek DVT tanısıyla servise kabul edildi Ailede DVT öyküsü var 40 yaş / kadın DVT tanısıyla servise kabul edildi Ailede DVT öyküsü yok

  4. Erken yaşta MI Buerger hastalığı Buerger hastalığı Erken yaşta MI

  5. 70 yaş / erkek DVT tanısıyla servise kabul edildi Ailede DVT öyküsü yok 45 yaş / erkek DVT tanısıyla servise kabul edildi Ailede DVT öyküsü var Faktör V 1691 GA Faktör V 1691 AA 40 yaş / kadın DVT tanısıyla servise kabul edildi Ailede DVT öyküsü yok Faktör V 1691 GG

  6. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Faktör V 1691 A heterozigotluğu veya homozigotluğu • DVT oluşumunda önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * başka bir mutasyon • * başka bir polimorfizm • * başka bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi? • 4. Klinik açıdan önemi var mı? • * tedavide farklılık yaratabilir mi? • * prognozu etkiler mi? • * semptomsuz bir taşıyıcıda önem taşıyor mu?

  7. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Faktör V 1691 A heterozigotluğu veya homozigotluğu • DVT oluşumunda önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * başka bir mutasyon • * başka bir polimorfizm • * başka bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi?

  8. FV 1691 G-A Mutasyonunun Sıklığı n 1691A % Sıklık OR Türkler 324 29 9.0 0.0045 1 (AKAR, Thromb Haemost, 1997) 1

  9. FV 1691 G-A Mutasyonunun Sıklığı n 1691A % Sıklık OR Türkler 324 29 9.0 0.0045 1 DVT 97 20/2 20.6 0.0113 2.3 (AKAR, 1997) 1

  10. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Faktör V 1691 A heterozigotluğu veya homozigotluğu • DVT oluşumunda önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * başka bir gendeki mutasyon • * başka bir polimorfizm • * başka bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi?

  11. FV 1691G-A ve PT 20210 G-A BİRLİKTELİĞİ (AKAR,Thromb Research, 2000)

  12. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Faktör V 1691 A heterozigotluğu veya homozigotluğu • DVT oluşumunda önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * başka bir mutasyon • * başka bir polimorfizm / gen içi • * başka bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi?

  13. FV A4070G polimorfizminin DVT’de etkisi (AKAR,TJH, 2002)

  14. DVT’DE FV 1691 A & FV4070 G SIKLIĞI n 1691 A 4070G İkisi OR • Kontrol(%) 144 10.4 9.7 1 • DVT (%) 129 20.1 11.6 6 • OR 1.9 1.2 6.7 (Akar , Am J Hematol, 1999, 2000 )

  15. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Faktör V 1691 A heterozigotluğu veya homozigotluğu • DVT oluşumunda önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * başka bir mutasyon • * başka bir polimorfizm / başka bir gen • * başka bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi?

  16. MTHFR 677 C-T n 677T TT % Sıklık OR Kontrol 106 37 6 5.6 0.023 1 DVT 88 37 8 9.0 0.030 1.6 (AKAR,Tromb Research, 1998)

  17. Ankara Üniversitesi Pediatrik Moleküler Genetik

  18. SNP array 10 K Ankara Üniversitesi Bioteknoloji Enstitüsü

  19. SNP array 250K Ankara Üniversitesi Bioteknoloji Enstitüsü

  20. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Faktör V 1691 A heterozigotluğu veya homozigotluğu • DVT oluşumunda önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * başka bir mutasyon • * başka bir polimorfizm • * başka bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi?

  21. PC Va Pro EPCR Vi T FVII Va TM A P C Va T A P C Xa PC S EPCR SO4 ENDOTEL ? sEPCR MMP

  22. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Faktör V 1691 A heterozigotluğu veya homozigotluğu • DVT oluşumunda önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * başka bir mutasyon • * başka bir polimorfizm • * başka bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi?

  23. RNA Ekspresyonu

  24. Transkriptom 250 K Ankara Üniversitesi Bioteknoloji Enstitüsü

  25. MİKRO RNA

  26. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Faktör V 1691 A heterozigotluğu veya homozigotluğu • DVT oluşumunda önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * başka bir mutasyon • * başka bir polimorfizm • * başka bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi? • 4.Tedavi takibinde farmakogenetik

  27. Genom aynı, proteom farklı

  28. Tıp’da Karşılaştırmalı Proteomiks Normal Birey - Hasta Tedavi Verilmeyen Hasta - Tedavi Verilen Hasta Tedavi-I Verilen Hasta - Tedavi-II Verilen Hasta

  29. 70 yaş / erkek DVT tanısıyla servise kabul edildi 45 yaş / erkek DVT tanısıyla servise kabul edildi Faktör V 1691 GA Faktör V 1691 AA 40 yaş / kadın DVT tanısıyla servise kabul edildi Ailede DVT öyküsü yok Faktör V 1691 GG Reviparin-sodium : 100 IU/kg

  30. Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization (MALDI) ile PROTEOMIKS Ankara Üniversitesi Bioteknoloji Enstitüsü

  31. Proteomik Analiz(2D) (Plazma-pH 3-10,Sypro Ruby/HED) Ankara Üniversitesi Bioteknoloji Enstitüsü

  32. Proteomik Analiz (2D)(Plazma-pH 3-10,Sypro Ruby/HED) Ankara Üniversitesi Bioteknoloji Enstitüsü

  33. Protein Mikroarray

  34. 70 yaş / erkek Astım tanısıyla servise kabul edildi Ailede Astım öyküsü yok 45 yaş / erkek Astım tanısıyla servise kabul edildi Ailede Astım öyküsü var 40 yaş / kadın Astım tanısıyla servise kabul edildi Ailede Astım öyküsü yok

  35. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Astım oluşumunda genetik faktörler önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * bir mutasyon • * bir polimorfizm • * bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi? • 4. Klinik açıdan önemi var mı? • * tedavide farklılık yaratabilir mi? • * prognozu etkiler mi? • * semptomsuz bir taşıyıcıda önem taşıyor mu?

  36. ÖNGÖRÜ / HİPOTEZ • Kanser oluşumunda genetik faktörler önemli mi? • başka bir faktör rol oynayabilir mi? • * bir mutasyon • * bir polimorfizm • * bir protein • 2. RNA’da bir değişim olabilir mi? • 3. Proteomda bir değişim olabilir mi? • 4. Klinik açıdan önemi var mı? • * tedavide farklılık yaratabilir mi? • * prognozu etkiler mi? • * semptomsuz bir taşıyıcıda önem taşıyor mu?

More Related