650 likes | 1.99k Views
Митохондриальный геном и болезни человека. Лаборатория нехромосомной наследственности Институт генетики и цитологии НАН Б. 1- хп ячмень (ПК) 2- митох ячмень (КМ) 3- хп ячмень (СвЦ) 4 - хп ячмень (СвЦ) 5 –мт ячмень (ЗГ) 6- хп подсолнечник (ПГ).
E N D
Митохондриальный геном и болезни человека Лаборатория нехромосомной наследственности Институт генетики и цитологии НАН Б
1- хп ячмень (ПК) 2- митох ячмень (КМ) 3- хп ячмень (СвЦ) 4 - хп ячмень (СвЦ) 5 –мт ячмень (ЗГ) 6- хп подсолнечник (ПГ) Долог путь от гена к признаку…
Митохондрии в клетке,строение митохондрий
Функции митохондрий • Синтез АТФ – «энергетический центр» клетки (95% синтезируется в мт) • Участие в метаболизме аминокислот, липидов,холестерола, стероидов, нуклеотидов • Инициация процессов апоптоза (программируемой клеточной смерти) • Регуляцияэкспрессииядерного генома • Участие в собственном воспроизведении
2 гена рибосомальной РНК 22 гена транспортной РНК 13 белок-кодирующих генов Митохондриальный геном человека – 37 генов, 16. 569 пар нуклеотидов Молекула ДНК замкнута в кольцо Гены расположены очень плотно, на обеих цепочках ДНК, иногда перекрываются
Репликация митохондриальной ДНК млекопитающих участок Н цепи, оттесняемый 7S ДНК D-петля Н-цепь новая Н-цепь (7S ДНК) HSPLSP L-цепь ОH D-петля • ДНК-репликация в митохондриях связана с транскрипцией; • L- и H- цепи реплицируются с разных точек : ОLи ОH • Молекула мтДНК в области D-петли трехнитчатая. ОH HSP LSP Короткий РНК транскрипт с LSP –праймер для репликацииH-цепи мтДНК ОL
ДНК- полимераза гамма(γ) состоит из двух субъединиц: α - каталитической и β -дополнительной (accessory) 125 -140 kDa35 – 54 kDa Участвует в узнавании РНК-праймеров Экзонуклеазная активностьproofreading:мутация в этой области уменьшает точность репликации Полимеразная активность
Первые митохондриальные заболевания были описаны раньше, чем открыта ДНК в митохондриях 1958 – синдром Кернс-Сейра 1962Болезнь Люфта : не тироидальный гиперметаболизм (всего 2случая за40 лет) 1963 Открыта ДНК в митохондриях 1981 –расшифрован митохондриальный геном человека (Anderson et al) 1988– идентифицированы первые патогенные мутации мтДНК(Holt et al., Wallace et al).
Особености митохондриальной наследственности • Материнское наследование • Мультикопийность геномов (сотни органелл, тысячи ДНК молекул) • Гетероплазмия • Митотическая сегрегация • Пороговый эффект
Ткани с низким порогом мутантной ДНК: мозг сердце скелетная мускулатура сетчатка глаза почечные канальцы эндокринные железы Клетки этих тканей наиболее метаболически активны,энергетически зависимы
В митохондриях 37 генов в тысячах копий каждый В ядре ~70 000 генов в двух копиях каждый Гены составляют менее 1% от всей ядерной ДНК Гены составляют более 92% от всей митохондриальной ДНК
Мутации в митохондриальной ДНК человека происходят в пять раз чаще, чем в ядерной, поскольку Митохондрии поглощают более 90%клеточного кислорода; Образуется большое количествоДНК-повреждающихсвободных радикалов. При этом • геном митохондрий не защищен гистоновыми • белками; • репарационные процессы в митохондриях • менее совершенны, чем в ядре
В настоящее время описано • более190патогенных точечных мутаций митохондриальной ДНК • около200делеций, инсерций и других структурных реорганизациймтДНК
Источники митохондриальных патологий: • Изменения в генах ядерного кодирования (более 1000 генов кодируют мт белки) • Изменения в генах митохондриальногокодирования (37 генов) • Выпадения участков мтДНК (делеции, множественные делеции) • Истощение пуламитохондриальной ДНК
Особенности мутаций митохондриальных генов Одна из важнейших особенностей – клиническое разнообразие сиблингов. Это – отражение «эффекта бутылочного горлышка». Какое количество мутантных молекул попадет в ооцит на раннем этапе оогенеза – дело случая :
Отсутствие механизма точного распределения митохондрий между отдельными клетками
Особенности мутаций митохондриальных генов Мутации могут затрагивать: специфические белки – при точечных мутациях и малых делециях структурных генов, а также митохондриальный геном в целом: • большие делеции; • мутации в генах тРНК; • мутации в генах рРНК. В результате мутациий наблюдается: • Уменьшение синтеза АТФ • Нарушение кальциевого баланса клетки • Повышение количестваROS (reactive oxygen species)
Некоторые мутации ядерной ДНК могут приводить к мутациям митохондриальной ДНК: ген ДНК-полимеразы гамма (осуществляет синтез мтДНК); ген тимидинфосфорилазы (нарушает метаболизм тимидина); ген Twinkle(участвует в поддержании целостности митохондриального генома). Информация о мутациях в этих генах накапливается стремительно
Особенности мутации митохондриальных генов Строгая связьмежду сайтоммутациии клиническимфенотипомчастоотсутствует: Одна и та же мутация может вызывать разные симптомы. Один и тот же клинический фенотип могут формировать разные мутации Исключения: MERRFсиндром - мутации всегда в тРНКLysгене;LHON – мутации вгенахND
2/3 известных точечных мутациймтДНК сосредоточены в тРНК генах(9% генома) Больше всегомутантных точек выявленов лейциновой тРНК
Примеры некоторых синдромов Синдром Лебера: LHON (1871 г.) • наследуемая по материнской линии потеря зрения происходит у людей 20-30 лет вследствие • атрофии зрительного нерва и • дегенерации ганглиозного слоя клеток ретины Заболевание связано с передаваемой от матери мутацией митохондриальной ДНК в одном из ND генов (комплекс I). В 70% случаев это G11778A(ND4), а в Японии в 90% в 13% случаев G3460A (ND1); в 14% случаевT14484C (ND6) Мутация находится в гомоплазматическом состоянии
745 п.н. 634 п.н. ДНК-диагностика синдрома Лебера в семье Nпроведена нами впервые в 2006 году G11778 G11778A замена пробанд с синдромом Лебера здоровый сестра мать человек пробанда
Загадки синдрома Лебера: ?? В 80-85% случаев поражаются мужчины (Х хромосома несет какой-то локус чувствительности ?) Лишь у 50% мужчин и 10% женщин носителей патогенных мутаций комплекса I в действительности происходит потеря зрения ?? Чаще всего мутации, ведущие к синдрому Лебера, встречаются в мтДНК гаплогруппы J; эту группу несут около 15% европейцев ?? В формировании заболевания участвуют какие-то дополнительные факторы ( ???)
Мутации генов транспортной РНК Самая часто встречающаяся точечная мутация: А3243Gв лейциновой тРНК Обнаружена у большинства больных с синдромом MELAS инсультоподобные(stroke-like) эпизоды Миопатия лактат-ацидоз энцефалопатия Мутация встречается исключительно в гетероплазматическом состоянии В одних семьях А3243Gвызывает преимущественно кардиомиопатию, в других – диабет и глухоту, в третьих PEO, в четвертых - энцефалопатию ???
Впервые ДНК-диагностика синдрома MELAS была проведена нами в 2007 году Мама: фенотипически здоровая женщина очень маленького роста I брак II брак 2ой ребенок 1991-2007 Менингоэнцефалит Умерот ишемического инфаркта обоих полушарий мозжечка 3ий ребенок родился в 1998 Прогрессирующая миопатия, миокардио-дистрофия 1ый ребенок 1988-2000 Кардиопатия, ЗПР, ЗФР. Умерла скоропостижно после травмы Митохондриопатия?? Обнаружена мутация MELAS у сына (80% мутантных молекул в крови) у мамы(40% )
Мутации генов транспортной РНК(продолжение) Мутация А8344Gв гене лизиновой тРНК при уровне мутантных молекул > 85% приводит к синдрому MERRF: Миоклонус-эпилепсия; «рваные» красные мышечные волокна; задержка умственного развития; атаксия; атрофия мышц и др. Матери больных обычно фенотипически здоровы или несут слабо выраженные симптомы Мутация резко снижает эффективность трансляции в мт и тем самым провоцирует дефицит дыхательной цепи
Мутации генов рибосомальной РНК Чаще всего встречается мутация гена 12S рРНК A1555G Вызывает несиндромную потерю слуха из-за чувствительности носителей мутации к ототоксическим аминогликозидам Другие мутации генов 12S и 16S вызывают кардиомиопатию, атаксию, MELAS, диабет mellitus, сенсорно-невральная потерю слуха
Примеры некоторых синдромов NARP (neuropathy ataxia and retinitis pigmentosa) Мутация в генеATPase6– трансверсияТ – G в нуклеотиде 8993 (70-90% мутантной ДНК) T8993G:лейцин замещаетсянааргинин вATPase6, чтоприводит к нарушению синтеза АТФ Если доля мтДНК больше 90%, клиническое проявление наблюдается раньшеи симптомы более тяжелые:подострая некротизирующая энцефалопатия с чертами синдрома Лея (LS)
Синдром Лея – тяжелейшее нейродегенеративное заболевание: - симметричные некротические повреждения в субкортикальных областях ЦНС – базальных ганглиях, таламусе, стволе мозга, спинном мозге; - демиелинизация, сосудистая пролиферация и «глиозис»; - моторная и умственная регрессия, атаксия, дистония, аномальное дыхание Заболевание начинается в раннем детстве, редко во взрослом состоянии; Смерть наступает обычно через два года после начала заболевания
2/10случаев – мутации митохондр. ДНК (MILS) 7/10 cлучаев – рецессивные мутации ядерных аутосомных генов, кодирующих субъединицы дыхательной цепи или белки, участвующие в ее сборке ATPase 6 LS 1/10 cлучаев – мутации Х-хромосомы PDHC
Синдром Кернс-Сейра (KSS) Причина – крупная делеция 5 т.п.н. Утрачиваются 5 генов тРНК и 5 белковых генов KSS –фатальная мультисистемная патология, проявляется в возрасте 4-18 лет:CPEO, пигментный ретинит, атаксия,глухота, эндокринная дисфункция, атриовентрикулярная блокада сердца, повышение уровня белка в цереброспинальной жидкости выше 100 мг/дл, «рваные» волокна в скелетных мышцах Делеция не наследуется
Та же делеция 5 т.п.н. вызывает еще 2 синдрома: Синдром Пирсона –PS Гипопластическая анемия, нарушение экзокринной функции поджелудочной железы Синдром PEO– Прогрессирующая наружная офтальмоплегия Все три синдрома являются спорадическими, формиуются в зависимости от сегрегации мутантных мтДНК с накоплением в разных тканях
В случае этой же делеции в 5 тыс п.н. вместо фатального KSS может наблюдаться PEO Прогрессирующая наружная офтальмоплегия, птоз Патология связана с параличом наружных глазодвигательных мышц Процент мутантных молекул в этом случае меньше, чем при KSS синдроме, синдром не связан с угрозой для жизни больного Биохимически в мышцах обнаруживаются дефекты ферментов дыхательной цепи, особенно цитохромоксидазы
Синдром митохондриальной деплеции -МDS В клетках остается 1 - 30% от нормального количества мтДНК Синдром проявляется в первые недели после рождения: фатальная гепатопатия; миопатия с генерализованной гипотонией; кардиомиопатия с судорогами (синдр. де-Тони-Дебре-Фанкони); атрофия проксимальных групп мышц; утрата сухожильных рефлексов. Смерть наступает в тяжелых случаях в первый год жизни
Патологии, вызванные изменением генов дыхательной цепи LHON LHON+дистония Спорадическая миопатия Спорадическая миопатия Энцефаломиопатия Спорадическаямиопатия NARP MILS FBSN М Я Синдром Лея Лейкодистрофия Синдром Лея Кардиоэнцефалопатия Лейкодистрофия/тубулопатия Синдром Лея Параганглиома
Как диагностировать митохондриальную аномалию? При ясных симптомах – выделить кровь из вены и сделать ПЦР-анализ на точечные мутации или делеции Если результат анализа крови отрицательный, это еще не значит отсутствия заболевания (гетероплазмия!) Нужно взять биопсию: мышечную или кожную пробу у взрослых у детей Для неинвазивного тестирования используют седимент мочи, соскоб внутренней поверхности щеки, реже волосяные фолликулы
Как диагностировать митохондриальную аномалию? (2) Свежую мышцу анализируют гистологически и гистохимически Проводятся измерения активности отдельных звеньев комплексов дыхательной цепи «Рваные» мышечные волокна выявляются при окраске на сукцинатдегидрогеназную активность или с помощью Гомори “trichrome stain” культура фибробластов свежая мышца Если обнаруживается дефект в одном звене, это указывает на мутацию соответствующей субъединицы (я или м), если дефекты множественные – возможен дефект мт тРНК либо ядерных генов, участвующих в работе митохондрий
Как диагностировать митохондриальную аномалию? (3) Иногда дефект проявляется при нагрузке (NARP синдром при мутации гена ATPase6) –нужно клиническое тестирование: физические нагрузки с замерами лактата, магнитно-резонансной или инфракрасной спектроскопией Наконец, в случае еще не описанных, редких «private» мутаций проводят прямое секвенирование мтДНК
Типичны для митохондриальных заболеваний вовлеченность разных органов и одновременное проявление внешне не связанных между собой аномалий Наружная офтальмоплегия с нарушением проводимости сердечной мышцы и мозжечковой атаксией Мигрени с мышечной слабостью Энцефало- миопатия с диабетом Тошнота, рвота с оптической атрофией и кардиомиопатией Диабет с глухотой Глухота с наружной офтальмоплегией, птозом и ретинопатией Низкорослость с миопатией и инсультоподобными эпизодами Экзокринная дисфункция поджелудочной железы с сидеробластной анемией Задержка развития или потеря навыков и офтальмоплегия, офтальмопарез
Насколько часты митохондриальные болезни? Частота митохондриальных энцефалопатий определяется примерно как 1 : 11.000 Общая частота митохондриальных заболеваний – как 1 : 8.000 Возраст манифестациимитохондриальных заболеваний сильно варьирует ~ 50 % после 5 лет ~ 50% - до 5 лет Смертность от митохондриальных заболеваний составляет 5-20% в год от даты манифестации
Если у больного митохондриопатия, то после перенесенных инфекционных заболеваний его состояние может резко ухудшиться также отягощают состояние стресс, голодание, переохлаждение, продолжительная обездвиженность, прием седативных средств Осторожно применять местную и общую анестезию!
Лечение митохондриальных болезней –насколько это реально? Фармакологический подход Витамины, кофакторы, «ловцы» свободных радикалов – для предотвращения повреждения дыхательной цепи Наиболее успешный пример – дихлорацетат, применяемый для уменьшения лактоацидоза у пациентов с МELAS Успех частичный и временный, чаще терапия неэффективна
Лечение митохондриальных болезней (2) Другой подход - уменьшить соотношение мутантная:нормальная мтДНК I. Увеличить количество немутантных молекулпутем «сдвига генов» Обычно сателлитные клетки пролиферируют и сливаются со скелетными миофибриллами в ответ на стресс или упражнение У некоторых больных с миопатией % мутантной мтДНК в сателлитных клетках ниже, чем в в скелетной мышце Пропорция нормальных мтДНК молекул в мышце увеличивалась, дефект корректировался Индуцируется пролиферация сателлитных клеток в скелетных мышцах
Лечение митохондриальных болезней (3) II.Уменьшить количество мутантных молекул мтДНК Разработка синтетических молекул, избирательно связывающихся с мутаными ДНК и блокирующих их репликацию Введение в митохондрии фермента рестриктазы, избирательно разрушающего мутантную ДНК Успех достигнут пока только in vitro
Лечение митохондриальных болезней (4) «Молекулярно-внутриклеточная реконструкция» Импорт из цитоплазмы нормальных тРНК вместо дефектных митохондриальных Замена дефектного комплекса дых. цепи на нормальный, полученный из другого организма (дрожжей) Пересадка ядра яйцеклетки из мутантной цитоплазмы в нормальную Все эти подходы - в стадии экпериментальной разработки
Лечение митохондриальных болезней –насколько это реально? Вылечить от митохондриального заболевания сегодня невозможно Применяется симптоматическое лечение: Физическое Физиотерапия, аэробная гимнастика, умеренные и легкие нагрузки Анти-эпилептические препараты, гормоны, витамины, метаболиты, кофакторы Фармакологическое Блефаропластика, имплантация cohlear, трансплантация сердца, почек, печени, подкожная эндоскопическая гастротомия, cricopharyngeal миотомия Хирургическое
Ряд препаратов провоцирует митохондриальные заболевания или отягощает их течение • Вальпроат: увеличивает частоту судорог при MELAS, гепатотоксичен • Аспирин, фенобарбитал • Кортикостероиды • Тетрациклин, хлорамфеникол • Аминогликозидыстрептомицин, гентамицин, амикацин, неомицин, канамицин - ототоксичны • Этамбутол ( провоцирует проявление LHON) • Статин ( провоцирует проявление MELAS) • Антиретровирусные препараты: AZT – zidovudine, doxorubicin вызывают деплецию мтДНК Список далеко не полный!