计算机科学与生命科学（ 11 ）生物信息学基础 2013 年秋季学期通选课程上课时间：周一 18:30 点上课地点：软件园 4 区 502d 主讲人：魏天迪

计算机科学与生命科学（11） 生物信息学基础 2013年秋季学期通选课程上课时间：周一 18:30点上课地点：软件园4区502d 主讲人：魏天迪讲义网址：http://www.mbtech.sdu.edu.cn/biocomp/

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氨基酸基本结构 氨基酸根侧链

氨基酸性质 疏水亲水负电正电

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多序列比对 常用的多序列比对工具包： • EMBL ClustalW http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2 • (*) 绝对保守的位点 • (:) 拥有大致相同大小的氨基酸并且这些氨基酸的亲属水性相似。 • (.) 拥有大致相同大小的氨基酸或亲属水性相似的氨基酸。

多序列比对 常用的多序列比对工具包： T-coffee是近几年发表的多序列比对软件，很准确，速度相对慢一些。 http://tcoffee.crg.cat/apps/tcoffee/play?name=regular

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多序列比对 常用的多序列比对工具包： MUSCLE是一个运算速度较快的多序列比对软件。 Home page : http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/

多序列比对结果的查看编辑器 http://www.jalview.org/

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