Struktura kurzu

1. Doktorský studijní program 2013/2014Lékařská fakulta Univerzity Palackého v OlomouciPRÁCE S LITERÁRNÍMI DATABÁZEMIAktualizaceleden2014Garant kurzu:Mgr. J. Potomková, Ph.D.jarmila.potomkova@upol.czOborováknihovna LF UP v Olomouci & Ústav lékařské biofyzikyOdborný poradce: Prof. MUDr.V. Mihál, CSc.Dětská klinika LF UP v OlomouciE-learningové materiályhttp://biomedicina.upol.cz/moodle

2. Struktura kurzu • Úvod • Kontakty • Internetové adresy • Elektronické informační zdroje na UP v Olomouci • Vzdálený přístup • Klinický případ, formulace informační otázky • Multizdrojové vyhledávání online • Výklad • Interaktivní cvičení. • Diskuze, dotazy– průběžně • Závěr – zápočet.

3. Kontakty Mgr. Jarmila Potomková, Ph.D. Vedoucí Oborové knihovny Lékařské fakulty UP v Olomouci Odb. as. Ústavu lékařské biofyziky jarmila.potomkova@upol.cz Prof. MUDr. Vladimír Mihál, CSc. Přednosta Dětské kliniky LF UP a FN Olomouc mihalv@fnol.cz Oborová knihovna Lékařské fakulty UP v Olomouci http://www.lf.upol.cz -- Knihovna Portál DSP „QAKOM“ http://biomedicina.upol.cz/moodle -- Kurzy

4. Doporučujeme: internetové adresy • Knihovna Univerzity Palackého v Olomouci http://knihovna.upol.czKatalog; Součásti knihovny / Oborová knihovna LF • Vědecká knihovna Olomouc http://www.vkol.cz Od 1.1.2005 lze jako čtenářský průkaz v knihovně používat identifikační kartu Univerzity Palackého v Olomouci. Aktivaci karty lze provést ve volném výběru knihovny (­­1. patro). Případné dotazy směrujte na ­­is@vkol.cz . • Národní lékařská knihovna Praha http://www.nlk.cz – Kmpletní informace http://www.medvik.cz – Portál MEDVIK http://www.medvik.cz/bmc – Česká lékařská bibliografie BMČ • NationalLibraryofMedicine (USA) http://www.locatorplus.gov – Katalog knih http://www.pubmed.gov – Databáze MEDLINE • Mezinárodní souborný katalog publikací http://www.worldcat.com • Internetové vyhledávače Google http://www.google.com - Všeobecný vyhledávač http://www.scholar.google.com - Vyhledávač odborných článků http://books.google.com - Vyhledávač knih s dílčím fulltextovým náhledem

5. Elektronické informační zdroje (EIZ) na UP v Olomouci • Přehled podle abecedy, fakult, oborů http://ezdroje.upol.cz/ezdroje/ • Lékařské databáze http://www.lf.upol.cz/ Knihovna LF Databáze • Volně dostupné (PubMed http://www.pubmed.gov) • V počítačové síti • UP v Olomouci (Dynamedhttp://search.epnet.com) • FN Olomouc (Uptodatehttp://www.uptodate.com/online) • Vzdálený přístup • VPN • Shibboleth / eduID • Heslo

6. Vzdálený přístup k licencovaným EIZ 1. VPN - VirtualPrivate Network Navigace: http://portal.upol.cz Návody a nápovědy Počítačová síť UP Přístup do počítačové sítě UP prostřednictvím VPN 2. EduID – Česká akademická federace identit http://eduid.cz • dříve Shibboleth • více na: http://knihovna.nkp.cz/knihovna91/pavlik.htm Navigace pro ověření vlastní identity: http://portal.upol.cz--- Kontakty – UPOL hledání studentů Username: portálové ID Password: rodné číslo bez lomítka, pokud jste je nezměnili na jiné heslo.

7. Klinický případ Formulace informační otázky

8. Klinický případ (autor: V. Mihál) Chlapec, 2 roky • Zánět středního ucha (otitis media); • Horečka, bolest ucha, nespal celou noc; • Matka přichází do ordinace PLDD; • Farmakologická anamnéza • antibiotika v posledním půlroku neguje; • pneumokoková vakcína nebyla • Matka chce vědět, zda antibiotická léčba je doporučována okamžitě?

9. Informační otázka Formát PICO Patient(pacient/problém/populace • Otitis media u dětí mladších 2 let Intervention (intervence/expozice) • Okamžitá antibiotická léčba (např. amoxicilin) Comparison (srovnání intervencí) • Placebo; observace Outcome (výsledek) • Účinnost zvolené intervence

10. Odborná terminologie P • Otitis media • Middle ear inflammation • Middle ear infection(s) I • Antibiotic(s) • Antimicrobial • Wait/Watch and see • Otitis media • Otitida • Zánět středního ucha • Zánět středouší • Středoušní zánět • Antibiotika • Observace

11. Co je to otitis media? Velký lékařský slovník http://lekarske.slovniky.cz/ Merck Manual of Diagnosis and Therapy http://www.merckmanuals.com Vybrat: MMDT Hledat: otitis media

12. Kde vyhledávat? • Multizdrojový přístup

13. Elektronické knihovní katalogy Odborné databáze pro medicínu a zdravotnictví : výběr

14. Elektronické knihovní katalogy (1) Národní lékařská knihovna Praha/Medvik http://www.medvik.cz Navigace a funkce: Prohledej Medvik/ Rozšířené Heslo MeSH: otitis media Hledat Datum vydání/ sestupně Vybrané do schránky Schránka / Text / Zobrazit ?MeSH = Medical Subject Headings Řízený slovník tezaurového typu

15. Elektronické knihovní katalogy (2) National Library of Medicine (USA)/LocatorPlus http://www.locatorplus.gov Navigace a funkce: LocatorPlus / Find Books …. Advanced Menu Search otitis media phrase/Title AND antibiotic antibiotics any of these/Title Search Sort results /Publish date descending Detailed view Ctrl+F/otitis/Hledej

16. Elektronické knihovní katalogy (3) Mezinárodní katalog Worldcat http://www.worldcat.org Navigace a funkce: AdvancedsearchTitle/ otitis media Keyword/ antibiotics Year/ 2000-2014 Content/ Thesis/Dissertation Search

17. Elektronické knihovní katalogy (4) Projekt Google Books http://books.google.com Navigace a funkce: Hledat knihy: otitis media antibiotics Rozšířené vyhledávání S přesnou frází/ acute otitis media Alespoň s jedním/ antibioticantibioticsamoxicillin O této knize – bibliografické údaje

18. Internetové zdroje Rozmanitost forem, obsahu a kvality

19. Kvalita zdravotnických webových stránek eEurope 2002: Dokument volně dostupný online Quality Criteria for Health related Websites Communication from the Commission to the Council, the European Parliament, the Economic and Social Committee and the Committee of the Regions

20. Kvalita zdravotnických webových stránekZákladní kritéria • Transparentnost obsahu, důvody pro zveřejnění, příp. zdroje financování; • Autorství obsahu včetně citací použitých informačních zdrojů; • Ochrana pacientských dat; • Aktualizace obsahu; • Zajištění validity a spolehlivosti pacientských informací; • Technická podpora přístupu k informacím s ohledem na cílovou skupinu.

21. INTERNETNástroje „hlubokého webu“ Navigace a funkce: Rozšířené vyhledávání služby Scholar Fráze: otitis media Alespoň jedno slovo: antibioticantibioticsamoxicillin Výskyt: v názvu článku Datum: 2000-2014 • http://www.scholar.google.com • Jen články z časopisů • Různé verze • Citační ohlasy

22. Odborné databáze pro medicínu a zdravotnictví: výběr MEDLINE/PubMed • Mezinárodní článková bibliografie • Volný přístup • Navigace do fulltextů BMČ – BibliographiaMedicaČechoslovaca • článková bibliografie českých/slovenských autorů • Volný přístup • Tvorba digitální knihovny fulltextů DynaMed • Synoptická databáze • Přístup v síti LF UP v Olomouci/VPN/heslo UpToDate • Syntetická/znalostní databáze • Přístup v síti LF UP a FN Olomouc/VPN

23. MEDLINE/PubMed http://www.pubmed.gov Advanced Search

24. MEDLINE/PubMed „Zlatý standard“pro medicínu a zdravotnictví Bibliografické citace a autorské souhrny • >5000časopisů publikovaných v USA a 80 dalších zemích • přes23 mil.záznamů od r. 1950 Většina záznamů z anglicky psaných zdrojů (nebo s anglickým abstraktem) MEDLINE na platformě PubMedwww.pubmed.gov • originálním obsahem je citace + abstrakt • plné texty dokumentů jsou poskytovány hypertextově od nakladatelů (LinkOut – More Resources) Přístup k citacím + abstraktům zdarma • Plné texty • zdarma • licence • absence

25. Booleovské operátory Symbolicky vyjadřují vztahy mezi pojmy AND, OR, NOT Dokumenty obsahují alespoň dva (nebo více) zhledaných terminů • otitis media AND antibiotics Dokumenty obsahují některý (nebo všechny) zhledaných termínů. • otitis media OR middleearinflammation Vylučuje daný termín • otitis media NOT surgery

26. PubMed: postup vyhledávání Navigace: http://www.pubmed.gov --- Advanced SearchBuilder (příprava) Booleovské operátory OR (a/nebo), AND(a), NOT(ne) Pravostranné rozšíření * (odvozená slova) Krok #1 Title:otitis media (výskyt termínů v názvu) OR Title/abstract: middleearinflammation (výskyt termínů v názvu anebo abstraktu) Add to History(vyhledání + archivace postupu) Krok #2 Title: antibiotic*(výskyt termínu v názvu) OR Title/abstract: antimicrobial* (výskyt termínu v názvu anebo abstraktu) Add to History(vyhledání + archivace postupu) Krok #3 History #1 AND #2 (kombinace množin) Search Show additionalfilters: Ages – Show: Infant birth-23 months

27. PubMed : Práce s citacemi • Summary (citace) • Abstract • Related articles • Send to : • File (uložení) • E-mail (požadavek do knihovny) • Article types, MeSH Terms (Medical Subject Headings – tezaurus) • Typologie dokumentů • Deskriptory obsahu článku • Linkout – more resources • Přístup do plných textů • Free fulltext • Poskytovatelé (licence, předplatné)

28. Funkce Send to == Email Pole Additional text musí být vyplněno (kontakt na odesílatele, zpráva pro adresáta). Jinak je zásilka anonymní.

29. BMČ – Bibliographia Medica Čechoslovaca http://www.medvik.cz/bmc Pokročilé hledání

30. BMČ Navigace: http://www.medvik.cz/bmc --- Pokročilé hledání Booleovské operátory OR (a/nebo), AND(a), NOT(ne) Pravostranné rozšíření * (odvozená slova) Krok #1 otiti* ORzánět* střed* /Název Krok #2 antibiotik* /Kdekoliv Krok #3 KombinovatAND

31. Syntetické a znalostní databáze pro medicínu založenou na důkazu (evidence basedmedicine – EBM) DynaMed UpToDate

32. Navigace a funkce http://search.epnet.com • Počítačová síť LF UP v Olomouci + vzdálený přístup (VPN nebo heslo na vyžádání jarmila.potomkova@upol.cz) • Vyhledávání: otitis media antibioticsSearch • Výsledek • Strukturovaný synoptický dokument na základě analýzy a hodnocení publikovaných studií + citace/PubMed+ plné texty • Vyhledávání klíčových slov uvnitř dokumentu Searchwithin text • Značky kvality • „Levelsof evidence“ – úrovně důkazu • Referencesincludingreviews and guidelines

33. Výsledek : Acute otitis media (AOM) Treatment overview

34. Navigace a funkce Přístup - http://www.uptodate.com/online • V síti LF UP v Olomouci • V síti FN Olomouc • VPN – vzdálený přístup Přehledy založené na důkazu (tj. aktuálních literárních pramenech po jejich kritické interpretaci) Asi 8000 témat (specifické otázky) • 14 lékařských oborů • 80 000 stran (text, grafika, prolinkování na abstrakta PubMedu) • 260 000 literárních citací • Léková databáze • Aktualizace 4x ročně

35. New Search: otitis media antibiotics Search

36. Výsledek: Acute otitis media in children: Treatment

37. Doporučení a odpověď na informační otázku Summary and Recommendations Thechoiceofinitialtreatmentwithantibioticsorobservationdependsupon theageofthechild and the laterality and severityofillness: • Werecommendthatchildrenwith AOM who are <6 monthsbetreatedwithantibiotics • Wesuggestthatchildrenwith AOM who are betweensixmonths and twoyearsbetreatedwithantibiotics ATD. Chlapec, 2 roky, akutní zánět středního ucha

38. Diskuze a závěr • Dotazy • Zápočet