130 likes | 293 Views
MODERNÍ BIOTECHNOLOGIE. GENOMIKA. PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B1. PŘEHLED VÝUKOVÝCH PREZENTACÍ. Obecná část: Specifická část: Doplňková část:. Struktura DNA. Genomika. Klonování DNA. Transgenní rostliny. GMO v zemědělství. GMO: historie a zákony.
E N D
MODERNÍ BIOTECHNOLOGIE GENOMIKA PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B1
PŘEHLED VÝUKOVÝCH PREZENTACÍ Obecná část: Specifická část: Doplňková část: Struktura DNA Genomika Klonování DNA Transgenní rostliny GMO v zemědělství GMO: historie a zákony PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B2 Slovník Opakování
VÝUKOVÉ CÍLE • Genomika jako vědní obor • Genom • Sekvenování DNA • Gelová elektroforéza • Měření koncentrace DNA PF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B3
GENOMIKA Vědní obor zabývající se mapováním a sekvenováním genomů organismů Genom = kompletní genetická informace v DNA organismu, která sestává z: Kódující sekvence DNA, podle kterých se tvoří v průběhu translace bílkoviny Nekódující sekvence DNA, které se neúčastní translace EXONŮ PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B4 INTRONŮ http://www.osel.cz/popisek.php?popisek=556&img=1114247735.jpg
GENOMIKA PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B5 http://www.osel.cz/popisek.php?popisek=557&img=1114247836.gif
SEKVENOVÁNÍ DNA • Kompletní sekvence genomu se provádí za účelem: • Získání základního materiálu pro studium genů • Identifikace vztahů mezi geny • V oblasti moderních biotechnologií ve výzkumu GMO PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B6
GELOVÁ ELEKTROFORÉZA • Elektroforéza • Separační (sekvenční) metoda založena na různé pohyblivosti látek (iontů) ve stejnosměrném elektrickém poli • Gelová elektroforéza • Nejrozšířenější sekvenční metoda k analýze nukleových kyselin • Dělení molekul DNA na základě jejich rozdílných rychlostí pohybu v gelu • Pohyblivost látky v gelu závisí na: • Náboji molekuly • Molekulové hmotnosti molekuly • Intenzitě elektrického pole • Typ gelu PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B7
GELOVÁ ELEKTROFORÉZA - + PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B8 Těžší fragmenty DNA Lehčí fragmenty DNA
GELOVÁ ELEKTROFORÉZA PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B9 http://opvk2011.ptacisvet.cz/texty_cz/popis_metod-gelova_elektroforeza-obr04.png
MĚŘENÍ KONCENTRACE DNA • Nejčastější způsoby: • 1. Spektrofotometricky • Měření intenzity absorpce UV – záření, které pohlcují aromatické báze nukleových kyselin PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B10 Spektrofotometr http://www.irmeco.com.pl/katalog/2/spektrofotometry/spektrofotometr_nanocolor_linus.htm
MĚŘENÍ KONCENTRACE DNA • Nejčastější způsoby: • 2. Fluorimetricky • Metoda založena na obarvení fluorescenčním barvivem (nejčastěji ethidium bromid nebo Hoechst 33258). • Fluorimetrem změříme intenzitu fluorescence barviva , jež odpovídá množství molekul barviva. • Toto množství pak odpovídá množství molekul nukleových kyselin, na které se barvivo váže. PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B11
MĚŘENÍ KONCENTRACE DNA Struktura molekuly ethidium bromidu Fluorimetr PřF UP Bc. Milan Glabazňa, diplomová práce 2012 B12 http://biologie.upol.cz/metody/Slovnik/EtBr.htm