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Uso e valore economico dei test genomici in azienda. Introduzione. La selezione genomica aumenta la risposta alla selezione . I tori sono stati genotipizzati prima per una questione di costi Adesso sono state genotipizzate molte più femmine che maschi .
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Introduzione • La selezionegenomicaaumenta la rispostaallaselezione. • I tori sonostatigenotipizzati prima per unaquestione di costi • Adessosono state genotipizzatemoltepiùfemminechemaschi. • Come usare la genomica per migliorare le propriescelte in azienda?
Moltianimalisonostativalutati 335,929animaligenotipizzati Genotypes Data Valutazione(YYMM)
Perchèsonoimportanti le sceltegiuste? RapportoPrezzo latte\alimento Luglio 2012: Prezzigranaglie Soia: $15.60/bu (€0.46/kg) Mais: $ 7.36/bu (€0.23/kg) Mese M:FP = prezzo di 1 kg di latte/ prezzo di 1 kg of razione al 16% di proteina
Come funziona la selezionegenetica • ΔG = progressogeneticoannuale • reliability =misuradellacertezza con la quale valutiamo un animale(genomica) • selection intensity = quantosiamo“puntigliosi” nel fare le nostrescelteselettive (la gestionepuò) • genetic variance = variabilitàosservatanellapopolazionedovutaallagenetica (non possiamomodificarla molto) • generation interval = tempo chepassatra 2 generazioni (genomica)
Possopermettermi la genomica? Numero di SNP9K 50K 800K Prezzo USA €32 €92 €184 PrezzoInternazionale €41 €100 €192
Quattro modi per usare la genomica • Verificaparentela • E’ davverol’animalechepensosia? • Pre-selezione o eliminazione • Stotenendoglianimaligiusti? • Accoppiamenti • Come produrre i migliorivitelli/e • Identificazionevacche di elite
Probabilità di trovare un ascendentemancante …se l’ascendentemancante è statogenotipizzato: 100% 98% 92% Animale Mancante Mancante Se l’ascendente è statogenotipizzato, lo troviamo!
Manzegenotipizzatenegli USA 73%hannomeno di 15 mesi di età!
Orasappiamo quale manza è la migliore La miglioreha un PTA NM$ di +868 e REL di 73%. PLANETha 3,783figliegenotipizzate– quale voletenellavostraazienda? La peggiore ha un PTA NM$ di +48 e una REL di 68%.
46 US Holsteins – genitorisconosciuti Genetic Merit for NM$ Senza pedigree, sonotutteuguali!
46 US Holsteins – animaligenotipizzati Genetic Merit for NM$
I peggiorianimalipossonoessereeliminati Genetic Merit for NM$
Come sceglieregliaccoppiamenti • Scelte3aziende di US Jersey • Confrontatigliaccoppiamentiesistenti con altripossibili • Avremmopotutosceglieremeglio? • I datisiriferiscono a 220accoppiamentieffettiviottenuti a partire da 142vacche/tori
Confronto con i veriaccoppiamenti • Utilizzate 3 strategienellasimulazione • Piani di accoppiamentocheusano EBV tradizionali e genomici come descritto da Pryce et al. (2012) • Scelta del genitore con DGV + alto • Numeromassimo di figli/e per toro:10
Che tori eranodisponibili? Vacchepresenti Ciascuntorovieneaccoppiato con tutte le vacche Vitellisimulati Tori utilizzati Vitelligenotipizzati Vitellinatidagliaccoppiamentireali.
Indicegenomicoreale e consanguineità Simile distribuzionedeivalorigenomici (DGV) Diverse distribuzionidelleparentele – diversigruppi di tori
Cosaabbiamoimparatodagliesempi • Ciascunadelle3aziendeavrebberopotuto fare sceltemigliori • Le differenzetra I metodisonominime • La consanguineità è sempreunapreoccupazione • Negli USA, moltiallevatori non usano un programma di accoppiamento!
Scegliereglianimali di elite • Genotipizzando le tuevacchesapraiqualianimalipotercontrattare come madri di toro • …sapraiancheilvaloredegliembrioniottenuti da un flushing • Vendereglianimali di elite puòrappresentareunafonte di ricaviaddizionale http://vet.tufts.edu/tas/dairy_farm_services/embryo_transfer_service.html
Conclusioni • Genotipizzarepuòaumentareilprogressogenetico • Glierrori di paternitàpossonoesserecorretti • Le scelteselettivepiù accurate possonofar risparmiaredenaro • Miglioresceltadegliaccoppiamenti produce migliorivitelli • La genetica di elite puòesserecommercializzata http://houston.cowparade.com/cow/large/917
Ringraziamenti Tom Lawlor Holstein Association USA Brattleboro, VT Albert De Vries Department of Animal Sciences University of Florida, Gainesville, FL Paul VanRaden, Dan Null, and Tabatha Cooper Animal Improvement Programs Laboratory, ARS, USDA Beltsville, MD