Inducción de proteína recombinante

1. Inducción de proteína recombinante Antecedentes y experimento

2. Objetivos • Conocer el fundamento de la inducción de la síntesis de proteínas recombinantes en E. coli. • Realizar la inducción de una proteína recombinante (-lactamasa). • Obtener la curva temporal de inducción de una proteína recombinante. • Interpretar el patrón electroforético de producción de una proteína recombinante. • Conocer las aplicaciones biotecnológicas de las proteínas recombinantes.

3. Tecnología del DNA recombinante, clonación génica o ingeniería genética Estudio de una secuencia específica de DNA que suele encontrarse en un conjunto heterogéneo de secuencias. Aislamiento, amplificación, secuenciación y expresión de un fragmento de DNA específico

4. Propiedad básica del DNA que permite su manipulación: • El acoplamiento de cadenas por complementariedad. La extraordinaria especificidad del reconocimiento entre secuencias de bases complementarias constituye un poderoso instrumento para la identificación, aislamiento, clonación de fragmentos de DNA complementarios a uno dado

5. Tecnología de DNA recombinante: Aislamiento de un gen de un organismo para introducirlo en otro

6. Características de las proteínas que se pueden producir en un organismo transgénico • Compartimento en el que la proteína se expresará ¿necesita una secuencia señal? • Si es un proteína membranalhay que considerar que la proteína completa no se pueda expresar • Si la proteína tiene puentes disulfuro, el huésped debe ser capaz de formar los puentes disulfuro • Modificaciones pos-transduccionales. El huésped debe ser capaz de hacer las modificaciones post-traduccionales • Complejo proteico, hay que considerar la estrategia de co-expresión • La posible toxicidad de la proteína, utilizar un huésped resistente o un sistema libre de células

7. Proteínas recombinantes-fusionadas a otra proteína

8. Otras señales que se pueden introducir a una proteína

9. Vector híbrido o recombinante Clonación del DNA • DNA foráneo (secuencia que se desea clonar) • Vector de clonación (vehículo) • Organismo huésped • (E. coli) • Selección de vectores

10. Vector de recombinación pET-TEM-1 • Un vector de recombinación es la molécula que resulta de la unión de un DNA vector con el DNA de interés (inserto en nuestro caso la -lactamasa). • Un DNA vector es un vector de clonación que permite introducir en una célula hospedera un fragmento de DNA que se pretende clonar; en esta célula hospedera el vector se replica y expresa, en su caso.

11. Vector de clonación pET-24a(+)

13. La resistencia adquirida a los aminoglucósidos se debe a 3 mecanismos básicos: • Presencia de enzimas que modifican aminoglucósidos: Es el mecanismo más común y ha sido detectado en diferentes bacilos gramnegativos, Staphylococcusaureus y Enterococcusspp.Se trata de diversas enzimas (acetilasas, adenilasas y fosfatasas) que modifican grupos sustituyentes de la molécula, lo que resulta en un compuesto de baja afinidad por el ribosoma bacteriano. Además no ocurre la segunda fase de ingreso acelerado de la droga a la célula. • Alteraciones en los sitios de unión. Se debe a mutaciones en los genes que codifican los sitios de unión a estas drogas. Es un mecanismo poco frecuente y ha sido hallado en E. coli y N. gonorrhoeae. • Disminución del ingreso: Determinado por alteraciones a nivel de la membrana externa para el caso de Pseudomonasaeruginosa, que dificultan la entrada de la droga a la bacteria.

14. Gene que da resistencia a kanamicina • Aminoglycoside 3'-phosphotransferase (APH). The APH subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other kinases, such as the typical serine/threonine/tyrosine protein kinases (PKs), RIO kinases, actin-fragmin kinase atgagccatattcaacgggaaacgtcttgctctaggccgcgattaaattccaacatggatgctgatttatatgggtataaatgggctcgcgataatgtcgggcaatcaggtgcgacaatctatcgattgtatgggaagcccgatgcgccagagttgtttctgaaacatggcaaaggtagcgttgccaatgatgttacagatgagatggtcagactaaactggctgacggaatttatgcctcttccgaccatcaagcattttatccgtactcctgatgatgcatggttactcaccactgcgatccccgggaaaacagcattccaggtattagaagaatatcctgattcaggtgaaaatattgttgatgcgctggcagtgttcctgcgccggttgcattcgattcctgtttgtaattgtccttttaacagcgatcgcgtatttcgtctcgctcaggcgcaatcacgaatgaataacggtttggttgatgcgagtgattttgatgacgagcgtaatggctggcctgttgaacaagtctggaaagaaatgcataaacttttgccattctcaccggattcagtcgtcactcatggtgatttctcacttgataaccttatttttgacgaggggaaattaataggttgtattgatgttggacgagtcggaatcgcagaccgataccaggatcttgccatcctatggaactgcctcggtgagttttctccttcattacagaaacggctttttcaaaaatatggtattgataatcctgatatgaataaattgcagtttcatttgatgctcgatgagtttttct

15. Vector de recombinación pET- TEM-1

16. f1 Ori o F1phage origin. • gcattaagcgcggcgggtgtggtggttacgcgcagcgtgaccgctacacttgccagcgccctagcgcccgctcctttcgctttcttcccttcctttctcgccacgttcgccggctttccccgtcaagctctaaatcgggggctccctttagggttccgatttagtgctttacggcacctcgaccccaaaaaacttgattagggtgatggttcacgtagtgggccatcgccctgatagacggtttttcgccctttgacgttggagtccacgttctttaatagtggactcttgttccaaactggaacaa • El ori que se encuentra tanto en E. coli como en los plásmidos son para hacer copias de DNA doble cadena. Pero el ori del fago o f1 ori hace una copia simple del DNA de cualquier secuencia que se encuentre colocada cerca en la orientación adecuada. • De hecho la región de la secuencia del fago contiene el origen de replicación para la síntesis y empaquetamiento del DNA cadena sencilla del bacteriofago. Por lo que cuando es incorporado en un plásmido, convierte al plásmido en una entidad que puede activamente vivir como DNA de cadena sencilla o doble.

17. Un gene siempre tiene que ir flanqueado por una zona promotora y otra terminadora de la transcripción

18. trangene Secuencia de unión de la proteína represora Secuencia que codifica para la proteína represora

19. Además el vector PET tiene la secuencia del promotor T7 y de LacO cerca de la secuencia del transgene

20. Operón lac • El operón lac consta de tres genes estructurales (lacZ, lacY, y lacA), que codifican enzimas metabólicas implicados en la utilización de la lactosa como fuente de carbono. • Lac I codifica para una proteína represora • Operador es una secuencia a la que de manera específica se puede unir la proteína represora. • En presencia de una molécula que se una a la proteína represora se reprime la expresión de los genes

21. Además el vector PET tiene la secuencia del promotor T7 y de LacO cerca de la secuencia del transgene • Promotor T7 lugar en donde se une la RNA polimerasa • Si el represor se une no hay transcripción del transgene. • Cuando hay inductor como el IPTG, se forma el complejo IPTG-represor y entonces la RNA polimerasa transcribe al transgene. • En presencia de una molécula como lactosa o un análogo se forma un complejo con la proteína represora y entonces el complejo no se une al operador y entonces la RNA polimerasa transcribe el gene.

22. El inductor del operón lac que utilizaremos será el isopropiltiogalactósido (IPTG). • El IPTG suele utilizarse como inductor artificial del operón lac, ya que es capaz de unirse al represor LacI, pero no es un sustrato para la β-galactosidasa y no puede ser metabolizado por la bacteria

23. Vector con inserto o

24. El experimento • Medio saturado • Inocular una alícuota en medio nuevo • Alcanzar la absorbancia en donde las células se encuentren en la fase log • Añadir el inductor • Tomar alicuotas (curso temporal de indución de proteína recombinante • Separación y visualización en un gel de poliacrilamida-SDS • Determinación del tiempo óptimo de inducción