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Western blot 实验技术. Western 免疫印迹( Western Blot )是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。 Western 实验是一项连贯的有多个步骤的实验技术,在实验过程中会遇到很多的问题,每一个环节出现问题都可能导致最后结果的失败。. 实验流程. √. 蛋白提取 SDS 凝胶配制 电泳 电转 封闭及一抗 显色. 蛋白提取. 稀盐和缓冲系统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂. 变性裂解液. 非变性裂解液.
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Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测。对已知表达蛋白,可用相应抗体作为一抗进行检测,对新基因的表达产物,可通过融合部分的抗体检测。 • Western实验是一项连贯的有多个步骤的实验技术,在实验过程中会遇到很多的问题,每一个环节出现问题都可能导致最后结果的失败。
实验流程 √ 蛋白提取 SDS凝胶配制 电泳 电转 封闭及一抗 显色
蛋白提取 稀盐和缓冲系统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂 变性裂解液 非变性裂解液
细胞和组织的处理 • 问题一. RIPA裂解液裂解细胞,离心后,还有很多粘稠物质 ? RIPA裂解细胞后的粘稠物质主要是DNA,10000rpm以上离心五分钟就可以沉淀, 取上清液。如果一次离心后还有粘稠可重复一次。
细胞和组织的处理 • 问题二.组织应该如何裂解最合适? 1、对于有韧性的组织比如血管,神经等,不能选用玻璃匀浆器,可以选择手动匀浆器和液氮研磨 2、对于一般较柔软的组织比如脑,肝脏等,使用上述三种方法均可。
细胞和组织的处理 • 问题三.液氮研磨后离心样本不能分层 • 研磨的时候不充分,会形成絮状的液态物质,如有手动匀浆器可以再进行处理 注意: • 裂解时抑制剂的添加非常重要,做一般的蛋白加入PMSF即可,个别蛋白需要加Aprotinin, Leupeptin ,做磷酸化的蛋白需要加入磷酸酶抑制剂(cocktail)
细胞和组织的处理 • 问题四.提取的蛋白样本如何保存最合适? 解答:温度越低越好 1、液氮 2、-80度冰箱 3、-30度冰箱 4、加入loading buffer煮后保存于-20度。
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SDS-PAGE电泳 • (1)清洗玻璃板:一只手扣紧玻璃板,另一只手蘸点洗衣粉轻轻擦洗。两面都擦洗 • 过后用自来水冲,再用蒸馏水冲洗干净后立在筐里晾干。 • (2)灌胶与上样 • 1、玻璃板对齐后放入夹中卡紧。然后垂直卡在架子上准备灌胶。 • 2、按前面方法配10%分离胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。然后胶上加一层水,液封后的胶凝的更快。(灌胶时开始可快一些,胶面 • 快到所需高度时要放慢速度。操作时胶一定要沿玻璃板流下,这样胶中才 • 不会有气泡。加水液封时要慢,否则胶会被冲变型。) • 3、当水和胶之间有一条折射线时,说明胶已凝了。再等3min使胶充分凝固 • 就可倒去胶上层水并用吸水纸将水吸干。 • 4、按前面方法配5%的浓缩胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。将剩余空间 • 灌满浓缩胶然后将梳子插入浓缩胶中。灌胶时也要使胶沿玻璃板流下以免 • 胶中有气泡产生。TEMED原溶液N,N,N’N’四甲基乙二胺催化过硫酸铵形成自由基而加速两种丙稀酰胺的聚合。
加足够的电泳液后开始准备上样。(电泳液至少要漫过内测的小玻璃板。)用微量进样器贴壁吸取样品,将样品吸出不要吸进气泡。将加样器针头插至加样孔中缓慢加入样品。(加样太快可使样品冲出加样孔,若有气泡也可能使样品溢出。加入下一个样品时,进样器需在外槽电泳缓冲液中洗涤数次,以免交叉污染)加足够的电泳液后开始准备上样。(电泳液至少要漫过内测的小玻璃板。)用微量进样器贴壁吸取样品,将样品吸出不要吸进气泡。将加样器针头插至加样孔中缓慢加入样品。(加样太快可使样品冲出加样孔,若有气泡也可能使样品溢出。加入下一个样品时,进样器需在外槽电泳缓冲液中洗涤数次,以免交叉污染)
SDS凝胶配制 • 问题一.胶凝的效果不好是什么原因? 1、AP时间过长,重新配制AP 2、可以适当多加入TEMED 3、室温低 4、混合不均匀
SDS凝胶配制 问题二、丙烯酰胺母液可以储存多久? 1、丙烯酰胺隔月重新配制 2、配制完分离胶要覆盖一层0.01%的SDS溶液,防止表面与空气接触。如果加一层水也可以,但由于水具有表面张力,会使胶不平。
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电泳 • 电泳时间一般2~3 h,电压为根据分子量需要,电泳至溴酚兰刚跑出即可终止电泳,进行转膜。
电 泳 • 问题一.如果所做蛋白分子量很大,比如220KD,大分子的Marker跑不下去,怎么办?小分子量的蛋白如10KD左右应该注意什么? 大分子:使劲跑;小分子:谨慎跑
电 泳 • 问题二.跑电泳的时候配的胶总是“缩”是什么原因呢?是有的成分不对吗?胶里的水分被蒸发了。过夜时拿保鲜膜包起来,在里面加点水保持湿度就可以了。 也可能母液(30%聚丙烯酰胺)有问题,你可以重新配制一份观察
电 泳 • 问题三.怎样才能把胶跑的非常漂亮,泳道和band都能很直,是不是上样的量很重要,灌胶有什么技巧吗?想跑漂亮,是不是应该先小电压,再高电压? 影响跑胶跑的质量,有以下几个因素: 1、电压,小的电压会使胶的分子筛效应得到充分发挥。电压越小,条带越漂亮,浓缩胶80v,分离胶100v就能跑得很好。 2、胶的均匀度,胶越均匀,条带越窄,分离越均匀。倒胶之前,一定要充分混匀,玻璃板一定要干净,双蒸水隔离时,一定要比较轻地加上去,避免稀释上层的分离胶,使胶不均匀。
电 泳 • 问题四:电泳时上样量应为多少? 这个没有确切的定值,一般来说20微克就可以,但是如果你的样品中目的蛋白含量很少,可以加大上样量到60微克甚至更高(进行预实验)
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电 转 • 问题一.电转选择什么样的膜最好? PVDF膜价格较贵,可重复使用,特别适合蛋白印迹,结合能力较强,但价格比较昂贵。 NC膜价格比较便宜,应用较广,结合牢固性差一些,韧性也不如PVDF,不能重复使用。
电 转 • 膜的选择还要考虑到目的蛋白分子量的大小,如果目的蛋白分子量为20KD以下,最好用0.22微米的膜,大于20KD可以选择0.45微米的膜。
电 转 • 问题二.电转时膜、滤纸、胶大小有何讲究? 如果是用的是半干转,顺序为:阴极-》滤纸-》胶-》膜-》滤纸。滤纸的长宽分别比胶小1-2mm,而膜的长宽分别比胶大1-2mm。 绝对禁忌:上下两层滤纸因为过大而相互接触,这样会短路,电流不会通过胶和滤纸。
电 转 • 问题三.不能很好地将大分子量蛋白转移到膜上, 转移效率低怎么样解决?可以考虑:转移缓冲液中加入20%甲醇,因为甲醇可增加蛋白质和膜的结合能力,甲醇可以防止凝胶变形,甲醇对高分子量蛋白质可延长转移时间 转移缓冲液加入终浓度0.1%SDS,也是为了增加转移效率;用优质的转移膜,或使用小孔径的膜(0.2微米)
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封闭及一抗 • 问题一.封闭,一抗,二抗时的温度有没有什么规定呢,比如在室温里做,或者要在4度下? 均可在室温进行,如果时间不够,一抗孵育可以先在室温进行一个小时,然后4度过夜。
封闭及一抗 • 问题二.一抗的浓度为多少合适? 不同的抗体效价是不一样的,一些好的公司的抗体可以稀释到1:1000或更多,一般的抗体稀释比例为1:200——1:500,如果低于这样的稀释比例,说明抗体质量太差。
封闭及一抗 • 问题三.洗脱的时候用PBST还是TBST,也有人用PBS和TBS,到底用那个合适? 都可以,最好用加tween-20的缓冲液,也就是PBST和TBST。
封闭及一抗 • 问题四.封闭液的选择有什么区别吗? 一般用BSA或者脱脂奶粉 脱脂奶粉封闭后背景比较干净,而检测磷酸化蛋白则用BSA(因脱脂牛奶含有较多的磷酸化蛋白,会形成干扰)
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显 色 • 问题一.发光液用DAB显色好还是用ECL好? 一般的说,ECL比DAB更灵敏,从实验的结果来看,个人认为ECL更好一些。(选择进口发光液)
显 色 • 问题二.加上ECL发光液能看到很亮的条带,而放入显影液和定影液洗完后,却发现条带很模糊,这是为什么? 显影液使用次数太多,已经失效。更换新的显影液。显影液在使用数次后会发黄,这时要及时更换。而定影液只要是清亮的就可以一直用。(注意避光保存)
显 色 • 问题三.背景很脏是什么原因? 1.没有洗干净(使用PBST或者TBST) 2.一抗浓度过大,可以降低一抗浓度 3.二抗浓度过大 4. 封闭时间短 5. 抗体稀释液效果不好
显 色 • 问题四.同一张膜如何进行蛋白的反复检测? 使用膜修复液洗15-30分钟,再用PBST或TBST洗3×10min。然后再封闭,加一抗。一般每张膜可以反复检测4-5次。
显 色 • NC膜是通过疏水作用来和蛋白质相连,这样的话,反复洗几次后,蛋白容易掉下来,结果较差。 • PVDF膜主要通过它膜上的正电荷和蛋白接合,虽然也有疏水作用,但相对较弱。这样的话,PVDF膜和蛋白接合较牢,不易脱落,结果较好。
实验流程 蛋白提取 SDS凝胶配制 电泳 电转 封闭及一抗 显色
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