900 likes | 1.25k Views
VIRUSOLOĢIJA (VĪRUSI UN ĀRPUSHROMOSOMU ĢENĒTISKIE ELEMENTI). PĒTĪŠANAS METODES. Bioloģiskā bīstamība (Biohazard). Bioloģiskās drošības līmeņi. Bioloģiskās drošības līmeņi. http://media.thestar.topscms.com/images/. II drošības klases laminārās gaisa plūsmas bokss.
E N D
VIRUSOLOĢIJA (VĪRUSI UN ĀRPUSHROMOSOMU ĢENĒTISKIE ELEMENTI) PĒTĪŠANAS METODES
Bioloģiskās drošības līmeņi http://media.thestar.topscms.com/images/
II drošības klases laminārās gaisa plūsmas bokss HEPA filtrs high efficiency particulate air III drošības klases laminārās gaisa plūsmas bokss I drošības klases bokss
HEPA filtrs high efficiency particulate air Kritiskais daļiņu lielums -0,3 mm 1,0-0,5 mm >1,0 mm < 0,2 mm
VĪRUSU AUDZĒŠANA Saimniekorganisms vai aizvietotājs Dimitrijs Ivanovskis [Ивановский] (1864. - 1920.) Martins Beijerniks [Beijernick] (1851.-1931.) Tabakas mozaīkas vīruss 1892. un 1898. gadā
VĪRUSU AUDZĒŠANA Saimniekorganisms vai aizvietotājs Frīdrihs Leflers [Loeffler] (1852 -1915) 1898., lielopu mutes un nagu sērgas izraisītāju neaiztur keramikas filtri
VĪRUSU AUDZĒŠANA Saimniekorganisms vai aizvietotājs
VĪRUSU AUDZĒŠANA Saimniekorganisms vai aizvietotājs
VĪRUSU AUDZĒŠANA Saimniekorganisms vai aizvietotājs Felikss d’Errels [d’Herelle] (1873. - 1949.) Frederiks Tvorts [Twort] (1877.-1950.) Bakteriofāgi, 1915. - 1917.g.
VĪRUSU AUDZĒŠANA Saimniekorganisms vai aizvietotājs
VĪRUSU AUDZĒŠANA Saimniekorganisms vai aizvietotājs
Makss Delbruks [Delbruck] (1906. - 1981.) Salvatore Luria [Luria] (1912.-1991.) Vīrusu replikācijas mehānisms 1948./49. g.g., NP - 1969.g.
Saimniekorganisms vai aizvietotājs Fāga titrēšana, negatīvo koloniju tipi
Saimniekorganisms vai aizvietotājs Vistas embrija sistēma Permisīvi un nepermisīvi organismi/audi/šūnas
Vīrusu inokulācija vistas embrija sistēmā Baku vakcīnas un baku vīrusu veidotie mezgli uz vistas embrija horioalantoja membrānas
Šūnu kultūra Barotnes sastāvs Harijs Īgls (Eagle)
Šūnu kultūra Kultivēšanas telpas, invertētais mikroskops
Šūnu kultūra Kultūru tipi
Šūnu kultūra Džons Enders [Enders] (1897. - 1985.) Tomass Vellers [Weller] (1915. – 2008.) Frederiks Robins [Robbins] (1916. – 2003.) Poliomielīta vīrusa audzēšana šūnu kultūrā 1949./50. g.g., NP - 1954.g.
Šūnu kultūra Monoslāņi un daudziedobju plates
Šūnu kultūra Laminārās plūsmas boksi
Šūnu kultūra Pipetēšanas sistēmas
Šūnu kultūras inficēšana ar vīrusa NS (transfekcija) Īslaicīga transfekcijaStabila transfekcija (ar integrāciju genomā) Transfekcija ar ķīmiskām metodēm
Transfekcija ar fizikālām metodēm elektroporācija; optoporācija; transfekcija ar magnētiskām daļiņām; balistiskā transfekcija http://cdn2.bigcommerce.com/
Šūnu kultūra CPE veidi
Renato Dalbeko [Dulbecco] (1914.-2012.) Vīrusu citopātisko un onkogēno īpašību pētījumi šūnu kultūrās; NP - 1975
VĪRUSU IZMĒRI Parvoviruss Mimiviruss
VĪRUSU IZMĒRI 1 mikrometrs
VĪRUSU (PLAZMĪDU) IZDALĪŠANA Šūnu dezintegrēšana Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Vīrusa (plazmīdas) attīrīšana
Šūnu dezintegrēšana • Mehāniskās metodes - saberzšana, samalšana, saspiešana, ultraskaņa, hidrodinamiskā berze. Kavitācijas pūslītis
Šūnu dezintegrēšana • Mehāniskās metodes - saberzšana, samalšana, saspiešana, ultraskaņa, hidrodinamiskā berze. French press
Šūnu dezintegrēšana • Ķīmiskās metodes - lizēšana ar denaturējošu vielu palîdzību (sārmi, virsmas aktīvās vielas) • Fermentatīvās metodes - hidrolītisko fermentu izmantošana - lizocīms, proteāzes, celulāzes
VĪRUSU IEGŪŠANA un ATTĪRĪŠANA Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Filtrēšana (filtrējošies vīrusi) Šamberlēna pudele – keramikas filtrs
VĪRUSU IEGŪŠANA un ATTĪRĪŠANA Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Filtrēšana
VĪRUSU IEGŪŠANA un ATTĪRĪŠANA Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Filtrēšana
VĪRUSU IEGŪŠANA un ATTĪRĪŠANA Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Filtrēšana - membrānu filtri 0,45/0,22 mm
Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Filtrēšana: Amicon ultrafiltri molekulu sadalīšanai pēc masas
Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Precipitācija Daļiņu hidratācijas apvalka noārdīšana, NaCl, CH3CHO2Na, LiCl. (NH4)2SO4
Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Centrifugēšana Relatīvais centrifugēšanas spēks:
Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Centrifugēšana Sedimentācijas koeficientu (s) mēra svedbergos (S) 1S = 10-13 s Molekula ar sedimentācijas koeficientu 10 S (10×10−13 s) pārvietosies 1 mm/s (1x10-6 m) pie 100 K g (106 m/s2) Sedimentācijas koeficients Teodors Svedbergs (1884.-1971.) Ultracentrifūga, NP -1926.
Vīrusu (plazmīdu) attīrīšana Centrifugēšana gradientā Ultracentrifūgas Beckman Optima 1000 100 K rpm, 800 K g Beckman Spinco L5-65 65 K rpm, 400 K g
Vīrusu (plazmīdu) attīrīšana Centrifugēšana gradientā Ultracentrifūgas
Šūnu ekstraktu frakcionēšana un koncentrēšana Centrifugēšana
Vīrusu (plazmīdu) attīrīšana Centrifugēšana gradientā Rotoru tipi Piekaru rotors SW 55 Ti 55; K rpm; 368 K x g Vertikālais rotors VTi-50; 50 K rpm; 242 K x g
Vīrusu (plazmīdu) attīrīšana Centrifugēšana gradientā Gradienta veidi Kāpņveida gradienta iegūšana
Vīrusu (plazmīdu) attīrīšana Centrifugēšana gradientā Gradienta veidi Nepārtrauktā gradienta iegūšana