120 likes | 241 Views
Analýza mutace C282Y v genu pro hemochromatózu. PCR – mutace C282Y (hemochromatóza). MASTER MIX – na 1 vzorek 15,8 ul H 2 O 2,5 ul pufr 1,5 ul primer 1 (P1) 1,5 ul primer 2 (P2) 2,0 ul MgCl 2 0,5 ul dNTP 1,0 ul DNA 0,2 ul Taq polymer á za (přidat na ledu).
E N D
PCR – mutace C282Y(hemochromatóza) • MASTER MIX – na 1 vzorek • 15,8 ul H2O • 2,5 ul pufr • 1,5 ul primer 1 (P1) • 1,5 ul primer 2 (P2) • 2,0 ul MgCl2 • 0,5 ul dNTP • 1,0 ul DNA • 0,2 ul Taq polymeráza (přidat na ledu)
RFLP –polymorfizmus délky restrikčních fragmentů restrikční analýza DNA pomocí jejího štěpení restrikčními endonukleázami (RE) ve specifických restrikčních místech pokud sekvenční diference (polymorfizmus) vytváří nebo ruší specifické místo pro RE, vznikají po restrikci fragmenty odlišných velikostí
RFLP –polymorfizmus délky restrikčních fragmentů restrikční analýza DNA pomocí jejího štěpení restrikčními endonukleázami (RE) ve specifických restrikčních místech pokud sekvenční diference (polymorfizmus) vytváří nebo ruší specifické místo pro RE, vznikají po restrikci fragmenty odlišných velikostí
RFLP –polymorfizmus délky restrikčních fragmentů Restrikční endonukleázy (RE) • známo asi 2100 bakteriálních RE • RE rozpoznávají různě krátké sekvence nukleotidů (4,6,8),ve kterých pak štěpí kovalentní fosfodiesterové vazby Princip analýzy • výchozí DNA (genomická DNA, PCR produkt) • štěpení restrikčním enzymem na fragmenty různých velikostí • elektroforetická separace fragmentů
Sekvence oblasti mutace C282Y Primerymísto GTAC štěpí restrikční endonukleáza RsaI místo mutace C282Y změna GTGC na GTAC
RFLP – mutace C282Y • MASTER MIX – na 1 vzorek • 7,0 ul H2O • 2,0 ul pufr • 10 ul PCR produkt • 1,0 restrikční endonukleáza RsaI (přidat na ledu) • Inkubovat 37°C 2 hod
HEMOCHROMATÓZA • hereditární hemochromatóza - relativně časté dědičné onemocnění charakterizované vstřebáváním nadbytku železa, jeho ukládáním v orgánech a z toho pak rezultujícím poškozením organismu • hepatopatie, diabetes mellitus, arthropatie, impotence, amenorhea, kardiomyopatie, endokrinní poruchy • sérové železo, saturace transferinu, sérový ferritin, jaterní biopsie • venepunkční terapie, desferrioxamin