1.18k likes | 2.53k Views
Farmasi. Bakteri (Kuliah 2). Alamat kontak: E-mail : maitreya1uk@yahoo.co.uk HP : 081391550071 Laboratorium Mikrobiologi, Fak. Biologi UNSOED. Diversitas Mikroorganisma I. Bakteria (Sing. Bakterium) Kecil, bersel tunggal, disebut sebagai Prokaryota: “Before nucleus”.
E N D
Farmasi Bakteri (Kuliah 2) Alamat kontak: E-mail : maitreya1uk@yahoo.co.uk HP : 081391550071 Laboratorium Mikrobiologi, Fak. Biologi UNSOED
Diversitas Mikroorganisma • I. Bakteria (Sing. Bakterium) • Kecil, bersel tunggal, disebut sebagai Prokaryota: “Before nucleus”. • Sel tidak memiliki: • Membran inti • Mitokondria • Kloroplas • Aparat Golgi • Retikulum endoplasmik • Lisosom
Eubakteria – organisma terkecil dan paling melimpah • Bentuk dasar • Bacilli • Batang • Cocci • Sferik/bulat • Spiral • Panjang dan spiral • Berkelompok • Staph- buah anggur • Strep - rantai
Struktur Sel Bakteria 1. Membran sitoplasma 2. Dinding sel a. Dinding sel Gram-Positive b. Dinding sel Gram-Negative c. Dinding sel Acid-Fast
Bungkus/amplop sel bakteri • Membran dalam: • - berperan dalam homeostasis • - semipermeable terhadap nutrien • - menjaga kestabilan pH dalam sitoplasma • ruang periplasmik: • - ruangan yang terisi materi semacam lendir yang • tersusun dari sekret protein dan protein yang • berperan dalam transport gula-gula dan nutrien • Dinding sel: • - memberi bentuk yang tetap dan melindungi sel • dari lisis osmotik • - tersusun oleh polisakarida kompleks • (peptidoglycan) • membran luar: • - melindungi sel dari senyawa toksik • - komponen proteinnya berperan dalam transport • nutrien
Transport materi ke dalam sel (endositosis) • Transport aktif: a.l. fagositosis, pinositosis, endositosis yang diperantarai reseptor • Pasif: a.l. osmosis, difusi
Dinding sel Gram Positif dan Negatif • Peptidoglikan • Ekso-polisakarida
Dinding sel Gram-Positif • Mengandung berlapis-lapis peptidoglikan • Mengandung asam teikhoat (teichoic acid) yang tersusun aa\ntara lain oleh gliserol dan fosfat • Asam teikhoat bermuatan negatif, ada 2 tipe: • asam lipoteikhoat merupakan transmembran yang berhubungan dengan membran • Teikhoat dinding sel yang berhubungan dengan peptidoglikan
Dinding Sel Gram-Negatif • Memiliki 1-2 lapis peptidoglikan • Memiliki membran luar • Peptidoglikan berhubungan dengan lipoprotein pada membran luar • Membran luar mengandung: • lipopolisakarida • Lipoprotein • Fosfolipid
Dinding sel mycobacteria sangat hidrofobik, memiliki lapisan kuat penghambat permeabilitas berupa asam-asam lemak rantai panjang (C60 - C90)(asam mikolat/mycolicacid), sehingga menjadi resisten terhadap beragam antibiotik. Molekul hidrofilik sebenarnya masih mampu masuk ke dalam sel melalui kanal yang terbentuk oleh protein porin sebagaimana pada Gram negatif. Pada mycobacteria jumlah kanal hanya 1/100 hingga 1/1000 jumlah porin bakteri Gram-negatif (Escherichia coli). • Tipe asam mikolat digunakan untuk pembeda spesies • Asam mikolat dan asam-asam lemak rantai pendek (lipid asil/ acyl lipid) menyusun membran luar palsu yang bertanggung jawab terhadap karakter pewarnaan sel (acid fast)
Fiksasi: proses membunuh sel secara cepat tanpa merusak strukturnya • Pengawetan gambaran utuh eksternal dan internal sel • Enszim seluler diinaktivasi • Struktur sel dikuatkan • Organisma mati dan menempel erat pada gelas benda
Dua tipe fiksasi: • Pemanasan : memanaskan film bakteri pada slide, membunuh sel, mengawetkan morfologi luar tetapi tidak mengawetkan bagian internalnya • Fiksasi kimia: senyawa kimia mampu penetrasi ke dalam sel, mengawetkan komponen internalnya, kemikalia tersebut: • Aseton • Ethanol • Asam asetat • Merkuri khlorida • Formaldehyde • Glutaraldehyde
Pengecatan Gram Tahapan: 1. Kristal violet 2. iodine (mordant) 3. pencucian alkohol 4. safranin Positif =purple Negatif =pink
Bakteri Gram Positive Bakteri Gram Negative Bakteri Gram variabel
Hasil Pengecatan Gram menunjukkan perbedaan dinding sel • Pengecatan Gram bermanfaat a.l. • Menentukan efisiensi antibiotik • Menunjukkan toksin yang berbeda • Bereaksi berbeda terhadap disinfektan
Pewarna Acid Fast • Mycobacterium: ~ dinding sel: mycolic acid, peptidoglikan mycobactin (lipofilik) • Mengandung Carbolfuchsin ~ Pewarna Ziehl-Neelsen : Preparat apus difiksasi, diwarna dengan carbolfuchsin pekat, dipanaskan dengan uap air panas, diamkan 5 menit, dicuci dengan air mengalir, selanjutnya dicuci dengan HCl 3% dalam 90% alkohol (H2SO4 3% selama 2 detik menit), cuci dengan alkohol 60%, dicat dengan counter-stain: 0,5% malachite green*, dicuci dengan air mengalir, dikeringkan dalam inkubator. Bakteri acid fast akan terpulas merah, bakteri lain terpulas hijau. * Dapat dengan metilin blue.
Struktur di Dalam Sitoplasma a. Sitoplasma b. Nukleoid c. Plasmid dan Transposon d. Ribosoma e. Endospora (berdinding tebal, berisi khromosom, tahan lingkungan yang buruk, tahan lama) f.Inclusion Bodies dan Organela fotosintetik (spesies tertentu)
Struktur Luar Dinding Sel • Kapsul/glikokaliks (Glycocalyx) • Lapisan luar tersusun oleh polisakarida • Melindungi dari kondisi yang kurang menguntungkan • Pili • penonjolan seperti rambut, berfungsi untuk pelekatan • Flagella • Untuk pergerakan
Plasmid • Plasmid merupakan materi genetik ekstrakromosomal, dalam 1 sel dapat ditemui lebih dari 1 kopi plasmid. • Pada bakteri terdapat 2 tipe berdasar jumlah gen dan fungsi yang dibawanya, yaitu: • plasmid besar yang tersusun oleh molekul DNA (~ 400kb) replikasinya dikoordinasi bersama dengan pembelahan sel • Plasmid kecil (6–10 kb) memuat 6–10 gen • Plasmid membawa sifat yang membantu survivalitas sel seperti tahan logam berat dan antibiotik atau membawa gen penyandi produksi antibiotik
Berdasar fungsi fenotipnya ada 5 kelompok: • plasmid R (R factor) menyandi resistensi terhadap antibiotik, contoh RP4 pada Pseudomonas menyandi ketahanan terhadap Kanamycin, Tetracyclin dan Ampicillin • Plasmid Col menyandi kemampuan produksi polipeptida antibakteri/bakteriosin • Plasmid F bertanggung jawab pada fertilitas dan berperan saat konjugasi • Plasmid degradatif membantu mikroba mampu mendagradasi materi yang sulit didegradasi/ rekalsitran, misal TOL pada Pseudomonas • Plasmid virulens mengkode produksi toksin atau faktor virulensi lainnya
PENCIRIAN/IDENTIFIKASI Insert figure 1.5basic cell and virus structures
Metoda Identifikasi • Ciri morfologi: berguna untuk identifikasi eukaryota • Pewarnaan diferensial: pewarnaan gram, acid-fast • Uji biokimia: menentukan kehadiran enzim-enzim bakteri
Kebutuhan Nutrien (1) • Sumber Energi • Fototrof • Menggunakan cahaya sebagai sumber energi • Khemotrof • Menggunakan energi dari oksidasi senyawa kimia tereduksi