90 likes | 272 Views
ניסוי 4 - שימוש במגשרים כימיים ללמוד מצב האוליגומריזציה של NhaA בממברנה. רוני חזן דניאל שנפלד. 254. ניסוי 1 – טיפול בממברנות עם מגשרים שונים. 388. 319. 245. 152. 205. 225. 178. 288. 119. 352. ניסוי 1 – טיפול בממברנות עם מגשרים שונים. החלבון המטופל הוא NhaA-cys-less-V254C-AXH.
E N D
ניסוי 4 - שימוש במגשרים כימיים ללמוד מצב האוליגומריזציה של NhaA בממברנה רוני חזן דניאל שנפלד
254 ניסוי 1 – טיפול בממברנות עם מגשרים שונים 388 319 245 152 205 225 178 288 119 352
ניסוי 1 – טיפול בממברנות עם מגשרים שונים החלבון המטופל הוא NhaA-cys-less-V254C-AXH מרקר ללא טיפול o-PDM p-PDM BMH kDa 62 דימר 47.5 32.5 מונומר 25
תוצאות ניסוי 1 • ללא טיפול רוב החלבון נשאר במצב מונומרי אולם יש כמות משמעותית הנמצאת כדימר • בשימוש במגשר מס' 2 pPDM (מגשר במרחק של כÅ10) קיבלנו העברה מירבית לצורת הדימר • גם המגשר o-PDM (מגשר כÅ6) נתן דימריזציה גבוהה • המגשר BMH ארוך יותר (Å16), אך גמיש • תוצאות אלה מראות שהמרחק בין שתי היחידות של הדימר הינו בטווח של Å10
254 ניסוי 2 - גילוי שיירים חשופים למדיום 388 319 245 152 205 225 178 288 119 352
ניסוי 2 - גילוי שיירים חשופים למדיום coomassie UV 225 NEM 254NEM 225 NEM 254NEM מרקר 254 225 254 225 הcoomassie ששימש לביקורת מראה שבכל הבאריות כמות זהה פחות או יותר של חלבון
תוצאות ניסוי 2 • מוטנט V254C הפונה לציטופלסמה נשאר מסומן לפני ואחרי הטיפול בNEM כלומר הוא לא נקשר ע"י MTSET בתא השלם • במוטנט H225C הפונה לפריפלזמה חל ירידה בסימון לאחר הטיפול עם NEM כלומר הוא היה חשוף למדיום כשהתא היה שלם • ניתן להסיק מכך שהלולאה המכילה את עמדה 225 פונה לציטופלזמה
ניסוי 3 – מדידת פעילות החלבון המוטנטי V254C לאחר טיפול במגשר p-PDM
מוטנט V254C שלא עבר טיפול עם מגשר מראה גרף פעילות התלוי בpH – פעילותו עולה כאשר הpH עולה. • טיפול במגשר גורם להסטה של פרופיל הפעילות כתלות בpH – גם בpH נמוך הפעילות עדיין גבוהה יחסית • ייתכן והדבר נובע מהקישור הקשיח של המגשר המגביל את שינויי הקונפורמציה שהלולאה יכולה לעבור