1 / 30

Bakteriální oxidace uhlovodíků

CH 4. O 2. . . H 2 O. Fe. CH 3 OH. O. H. Fe. B. B. . . . . FAD. Fe 2 S 2. R. 2 e –. H 2 O. Fe 2 IV = O. Fe 2 III + O 2 H –. NADH. H 2 O. PFe V = O. • PFe IV = O. PFe III + O 2 H –. Bakteriální oxidace uhlovodíků. Bakteriální oxidace uhlovodíků. e –. Fe II.

moses
Download Presentation

Bakteriální oxidace uhlovodíků

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. CH4 O2   H2O Fe CH3OH O H Fe B B     FAD Fe2S2 R 2e– H2O Fe2IV=O Fe2III+O2H– NADH H2O PFeV=O •PFeIV=O PFeIII+O2H– Bakteriální oxidace uhlovodíků Bakteriální oxidace uhlovodíků

  2. e– FeII FeIII O2 FeIII –CO 2H+ + H2O FeIV FeII FeII +CO XOOH XOH hem e– FeV H2O R–OH FeIII FeIII H2O R–H Katalytický cyklus oxidace uhlovodíků Katalytický cyklus oxidace uhlovodíků

  3. Ala 13 Cys 14 Gly 12 S Cys 11 Fe S S S Fe S Fe Fe S Ferredoxin

  4. proteiny:— Fdred Fdox /HPred HPox – 0,3až – 0,5V +0,1až +0,3V analoga:[Fe4S4(SR)4]4–*[Fe4S4(SR)4]3–*[Fe4S4(SR)4]2– *[Fe4S4(SR)4]1– Ferredoxin Změny náboje a oxidačních stavů železa ve ferredoxinu: [4Fe–4S]0[4Fe–4S]1+[4Fe–4S]2+[4Fe–4S]3+ 4Fe(II) 3Fe(II)+Fe(III) 2Fe(II)+2Fe(III) Fe(II)+3Fe(III) Fd= ferredoxin HP=„high-potencial“ protein * izolováno

  5. – 2,269 Å RS SR S Fe Fe 2,233 Å S 3– Fe RS S 2,286 Å SR Fe S 2,208 Å SR S Fe RS Fe S 2,354 Å 2– Fe RS S 2,296 Å SR Fe S S SR 2,295 Å Fe Fe 2,267 Å S RS Fe S SR Fe S 2,263 Å RS Fe–S klastryFerredoxin Fe4S4(SR)4– Fe4S4(SR)43– Fe4S4(SR)42–

  6. A B C Transport elektronu přes ferredoxin

  7. Methionin Methionin Tvorba radikálů S-adenosyl methionin

  8. 1 2 3 4 6 5 Fe–S klastry (I)

  9. 8 7 10 9 Fe–S klastry (II)

  10. [FeCl4]2– 4NaSEt,MeCN [Fe(SEt)4]2– 1S;MeCN 1,5S;85ºC;MeCN 1,4S;Me2CO 60ºC,MeCN [Fe2S2(SEt)4]2– [Fe3S4(SEt)4]3– [Fe6S9(SEt)2]4– 80ºC,MeCN 4RSH,MeCN 2RSH,MeCN 1FeCl2,1NaSEt MeCN [Fe4S4(SEt)4]2– [Fe3S4(SR)4]3– [Fe6S9(SR)2]4– Syntézy FeS klastrů

  11. a:R = CH3 b:R = CHO R Mg R’ hydrofobní řetězec Chlorofyl

  12. 2 feofytiny ne-hemové 4 hemy 4 chlorofyly 2 chinonyželezo Chlorofyl Umístění atomů železa v chlorofylu

  13. P700 P680 Fotosyntéza – „Z“-schema

  14. Fotosystém II Fotosystém I Fotosyntéza – „Z“-schema Tok elektronů ve fotosystémech I a II

  15. S0S1S2S3S4 O2 P680 Mn Mn Mn Mn Fotosyntéza 2H2OO2+4H++4e– Klastr čtyř atomů Mn

  16. S0S1S2S3S4 O2 H2O –H+ III III O (S0) H Fotosyntéza 2H2OO2+4H++4e–

  17. S0S1S2S3S4 O2 IV III –H+ –e O O (S1) H Fotosyntéza 2H2OO2+4H++4e–

  18. S0S1S2S3S4 O2 III IV O O –e O O (S2) Fotosyntéza 2H2OO2+4H++4e–

  19. S0S1S2S3S4 O2 III IV O –e –e –2H+ (S3) Fotosyntéza 2H2OO2+4H++4e–

  20. S0S1S2S3S4 O2 +H2O III IV O S0 O (S4) O –2H+ O O Fotosyntéza 2H2OO2+4H++4e–

  21. [Mn4O2ac7bipy2] Modelové sloučeninyklastrů manganu [Mn3O3Cl4ac3py2] [Mn4O2ac6bipy2]

  22. N N N N H Co N N N N Corrin

  23. R a)R= CH3 methylkobalamin . b)R= H2O aquokobalamin . c)R= –CN– kyanokobalamin (vitamin B-12) . d)R= adenosylkobalamin (koenzym B-12) Co+ Vitamín B-12 (kobalamin)

  24. Koenzym B-12

  25. Redukce Ribonukleotid reduktáza + + ribonukleotid deoxyribonukleotid Záměna funkčních skupin Glutamát mutáza – Diol dehydratáza Přenos methylu Methionin syntetáza Příklady reakcí katalyzovaných vitamínem B-12

  26. Obecné schema mechanismu isomerázyzávislé na adenosyl-kobaltaminu

  27. Methionin syntetáza

  28. Methionin syntetáza

  29. Methyl transferáza

  30. Katalytický mechanismus záměny funkčních skupin

More Related