1 / 36

ASAM NUKLEAT

ASAM NUKLEAT. Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan: a) Menyimpan informasi genetik b) Proses replikasi dan transkripsi. FUNGSI NUKLEOTIDA. Penting untuk semua sel Komponen cofaktor enzim :

nerita
Download Presentation

ASAM NUKLEAT

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. ASAM NUKLEAT DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  2. Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan: a) Menyimpan informasi genetik b) Proses replikasi dan transkripsi DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  3. FUNGSI NUKLEOTIDA • Penting untuk semua sel • Komponen cofaktor enzim : CoA; FAD; NAD; NADP • Pembawa energi kimia (Energy Carriers): ATP, ADP, GTP • Precursor sintesis DNA • Precursor sintesis RNA

  4. -- Except for some animal virus, DNA is genetic material. -- RNAs have more diverged functions: -- structural RNAs: e.g. rRNA -- enzymatic RNAs: e.g. ribozymes -- genetic materials: e.g. HIV virus. -- others: e.g. tRNA, gRNA, etc. -- (deoxy)ribonucleotides are the building blocks of nucleic acids: 3 characteristic components: • -- due to the acidity ofphosphate＝＞ called nucleic “acid” • -- also due to phosphate:DNA and RNA are highlynegatively charged. • -- phosphate and ribose arehydrophilic DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  5. Base PO4 Sugar Nukleotida Asam nukleat dibentuk dari nukleotida yg memiliki suatu gula, basa nitrogen, dan fosfat. Nukleosida DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  6. Molekul Gula pada Nukleotida • Ribosa merupakan molekul gula pada RNA • 2-Deoksiribosa merupakan molekul gula pada DNA Perhatikan: • Ikatan gula ribosa dengan basa nitrogen (pada atom karbon nomor 1). • Ikatan gula ribosa dengan gugus fosfat (pada atom karbon nomor 5). • Gugus hidroksil pada atom karbon nomor 2 DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  7. Penamaan Nukleotida: DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  8. Struktur Primer DNA dan RNA A, G, T, C  DNA A, G, U, C  RNA DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  9. “ Two strands” harus saling komplementer satu sama lain • Pasangan Basa A-T dan G-C yang Berikatan Hidrogen • A-T memiliki 2 ikt. Hidrogen • G-C memiliki 3 Ikt. Hidrogen DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  10. Knowing sequence of one strand, we will know the sequence of the other strand. • e.g. 5’-GCATCGACCTTT-3’ 3’-?????????????????-5’ if 5’-GCATCGACCTTT-3’ ---- Sense, (+), nontemplate, codingstrand 3’-CGTAGCTGGAAA-5’--- Nonsense, (-), template, noncoding strand transcription RNA 5’-GCAUCGACCUUU-3’ DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  11. Model struktur DNA Watson-Crick DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  12. Molekul DNA sirkular dan superkoil supercoiled relaxed DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  13. RNA • mRNA (messenger RNA) • Membawa informasi genetik dari DNA ke ribosom untuk sintesis protein • rRNA (ribosomal RNA) • Penyusun 65 % ribosom, sisanya protein • Mengenali mRNA • tRNA (transfer RNA) • Menterjemahkan kode genetik dari mRNA menjadi asam amino tertentu

  14. RNA

  15. Replikasi DNA Semikonservatif DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  16. Proses Replikasi DNA DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  17. Struktur ribosom pada prokariot dan eukariot DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  18. MetabolismeAsamNukleat 1. AnabolismeAsamNukleat • BiosintesisPurin • BiosintesisPirimidin 2. KatabolismeAsamNukleat • DegradasiPurin • DegradasiPirimidin DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  19. Intermediet untuk baik proses de novo and salvage pathway Berasal dari ribosa 5 phosphat 5-Phospho- -D-ribosyl-1-pyrophosphate (PRPP)

  20. Biosintesis De Novo Purines

  21. IMP synthase GAR synthetase AICAR transformylase GAR transformylase SAICAR lyase FGAR amidotransferase SAICAR synthetase FGAM cyclase AIR karboksilase

  22. Hal-hal penting dalam sintesis de novo purin: • Sangat tergantung pada “pool” ribosa • Gugus amina  didonor oleh glutamin dgn enzim amidotransferase • Glisin dan fumarat  donor ring dlm nukleotida • Daur reaksi  dikontrol secara alosterik dgn AMP, ADP, GMP dan GDP.  bekerja pada PRPP amidotransferase

  23. Daur diawali dgn perubahan PRPP  IMP • IMP = Inosine monofosfat mrpkn bentuk nukleotida purin yang pertama dibentuk dlm daur ini • Sebagai basa adalah hypoxanthin

  24. DAUR dr IMP  AMP & GMP Adenilosuksinat synthetase IMP dehidrogenase XMP aminase Adenilosuksinat lyase

  25. Metabolisme de novo nukleotida pirimidine CP synthetase Aspartat transcarbomoylase Dihidrooratate DH dihydrorotase

  26. Orotat fosforibosiltransferase Orotidilate dekarboksilase CTP synthetase UMP kinase Nukleosida diphosphat kinase

  27. Hal-hal penting dalam sintesis de novo pirimidine: • cincin pirimidine disintesis terpisah dr gula ribosa nya • Daur pirimidine de novo tidak bercabang produk akhir dr daur adalah UMP yang mrpkn bahan dari CMP • Reaksi pertama  pembtkan karbamoyl aspartate dr asp dan carbomoyl-P titik regulasi yg penting dlm daur tsb • Aspartat transcarbomoylase (ATCase)  diaktivasi oleh ATP dan dihambat oleh CTP sbg produk akhir

  28. Degradasi purine • Produk akhir katabolisme purin : asam urat

  29. Vertebrata terestrial  urea ureotelic Burung & reptil  asam urat uricotelic Binatang di air  ammoniaammonotelic

  30. Degradasi pirimidin

  31. Terimakasih DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

More Related