ASAM NUKLEAT & PROTEIN

1. ASAM NUKLEAT & PROTEIN FARMASI – FMIPA, UHAMKA 2007 Priyo Wahyudi

2. Bahasan • Asam Nukleat: DNA dan RNA • Struktur dan fungsional protein

3. DNA

4. Asam nukleat DNA RNA

5. Satu Nukleotida Struktur DNA • DNA adalah suatu polinukleotida yang terbangun atas struktur yang berulang dari Nukleotida, tersusun sebagai rantai ganda. • Kata kunci: • Bentuk polimer yang berantai ganda (double stranded polymer) • Monomer disebut Nukleotida (deoksinukleotida)

6. Basa Nitrogen : Phosfat : Deoksiribosa : Gula beratom C5 siklik, C berlabel 1’ hingga 5’ Struktur Nukleotida DNA Terbangun atas 3 Komponen:

7. dNTP Nukleosida Nukleosida & dNTP

8. Timin (T) : Guanin (G) : Cytosin (C) : Adenin (A) : Purin Pirimidin Basa Nitrogen DNA Gula & Posfat adalah tetap dalam suatu nukleotida, yang bervariasi adalah Basa Nitrogen, yang terdiri atas 4 jenis, yaitu: Pirimidin : molekul berbentuk cincin 6 atom, terdiri atas atom C dan N Purin : molekul yang merupakan gabungan molekul bentuk cincin 5 atom dan 6 atom, yang terdiri atas C dan N

9. Struktur Basa DNA Purin Nucleoside Pyrimidin

10. Basa Komplemen

11. Satu pita DNA dibentuk dari nukleotida yang saling bersambung, melalui suatu ikatan Fosfodiester 1 nukleotida 1 nukleotida Struktur DNA ss Nukleotida terbentuk jika Posfat berikatan pada atom C5’ dari gula deoksiribosa, dan pada atom C1’ berikatan basa Nitrogen Ikatan Fosfodiester

12. Pita tunggal DNA 5’ end Nukleotida memanjang dari ujung 5’ ke arah ujung 3’ - P04 pada ujung 5’ (atom C5’) - OH pada ujung 3’ (atom C3’) 3’ end

13. Pita ganda DNA Dikemukakan oleh Watson & Crick (1953) • Pita ganda (double stranded) • Berpilin spiral (helical structure) • Bersifat anti-paralel • Gula-fospat menjadi backbone di bagian luar • Pasangan basa di bagian dalam • Pasangan basa komplementer: • A berpasangan dengan T - 2 ikatan Hidrogen • G berpasangan dengan C - 3 ikatan Hidrogen

14. Model pita ganda DNA Basa Nitrogen Gula - Posfat

15. 3’ 5’ 5’ 3’ Anti-paralel

16. Model DNA ds

17. Latihan

19. RNA

20. Satu Nukleotida RNA Urasil Timin Deoksiribosa Ribosa Struktur RNA RNA adalah suatu polinukleotida rantai tunggal yang terbangun atas struktur yang berulang dari Nukleotida RNA. RNA berbeda dari DNA pada: Gula ribosa bukan deoksiribosa Basa Nitrogen Pirimidin Timin, diganti Urasil

21. Tiga Macam RNA • Messenger RNA (mRNA) Hasil proses transkripsi DNA yang membawa informasi DNA ke ribosom (tempat terjadi proses sintesa protein) • Ribosom RNA (rRNA) RNA penyusun ribosom (>60%) • Transfer RNA (tRNA) Berperan dalam proses translasi dengan membawa asam amino yang sesuai dengan kodon pada mRNA

22. Overview: From gene to protein

23. Protein

24. PROTEIN Protein adalah makromolekul yang mempunyai banyak peranan dan fungsi dalam sel, seperti: membangun sel, menyimpan, transport, pertahanan diri dan enzim katalisis. Struktur protein terbangun atas unit-unit asam amino Satu Asam amino Satu asam amino terbangun atas: atom Carbon yang berikatan dengan atom Hidrogen, sebuah gugus Carboksil, suatu gugus amino dan suatu rantai samping R

25. Asam aspartat : asam Glisin : non polar Sistein : polar Asam amino Terdapat 20 jenis asam amino. Rantai samping R menjadi bagian variabel yang membuat asam amino satu berbeda dengan asam amino lainnya. Sifat gugus Rantai samping R pula yang menentukan bagaimana asam amino tersebut saling berinteraksi satu sama lain.

26. Ikatan Peptida Ikatan Peptida Polipeptida Asam-asam amino bersambungan membentuk suatu polipeptida melalui ikatan peptida. Urutan (sekuens) asam amino dari suatu rantai menjadi struktur primer suatu protein Rantai Polipeptida Ikatan peptida menghubungkan gugus karboksil dari satu asam amino dengan gugus amino dari asam amino lainnya

27. Ikatan Peptida

28. Struktur Primer Struktur Sekunder Struktur Tersier Struktur Kuarterner Struktur Protein

29. Binding of Protein

30. Selamat Belajar ....