80 likes | 158 Views
Pr éda-ragadozó interakciók modellezésének lehetőségei R-ben. Hogyan használjuk az R- t?. Mint más emberek: - adatelemzés - statisztika - grafika Modellezés R-ben: – a lkalmaz ott modellek – „m agya rázó” modellek – demostráló modellek és modellezés. Ökológiai modellek.
E N D
Hogyan használjuk az R-t? • Mint más emberek: - adatelemzés - statisztika - grafika • Modellezés R-ben: – alkalmazott modellek – „magyarázó” modellek – demostráló modellek és modellezés
Ökológiai modellek • Egy ökológiai rendszer vagy alrendszer matematikai modellje • Folyamat (process) modellek: • rendszer megismerés, hipotézis tesztelés (préda-predátor modell, sejtautomaták) • Szintézis (synthetic) modellek: ismeretek összefoglalása, döntéshozás (vízminőség, globális folyamatok)
A feladat(ok)…. • 0. csomagok letöltése(simecol, odesolve), telepítése, ellenőrzése 1. A scriptek letöltése, értelmezése • 1. Néhány példa kiszámítása • 3. jegyzőkönyv elkészítése • 4. jegyzőkönyvek elküldése (*.doc vagy *.odt-ben) az elek.zoltan@aotk.szie.hu címre • 5. elindulni lassan hazafelé…
1. Feladat: egy tipikus sztochasztikus Lotka Volterra-rendszer modellezése • Egyenlő esélyek alacsony egyedszám(20,20), magas egyedszám(200, 200) • Nem egyenlő esélyek (midnkét fajra) alacsony egyedszám(10-100), magas egyedszám(100-10) Ki a ragadozó , ki a préda?
2.feladat: Lotka Volterra-rendszer három paraméterrel, forrás, préda, ragadozó #########predator prey-model with three equations: predator, prey and resource (e.g. nutriens, grassland) library(odesolve) library(simecol) data(lv3) plot(sim(lv3)) solver(lv3) <- "lsoda" parms(lv3)<- list (b=0.1, c=0.5, d=0.1, e=0.4, f= 0.4, g=0.1) init(lv3)<- list (s=0.8, p=0.2, k=0.0) times(lv3)<- c(from=0, to=100, by=0.1), print(sim(lv3)) plot(sim(lv3)) # wrong! integration overlooks internal inputs plot(sim(lv3, hmax=1)) # integration with correct maximum time step
2. feladat • Egyenlő esélyek egyedszám(20,20) • Nem egyenlő esélyek (midnkét fajra) egyedszám(10-100), Resource: 1, 100
http://www.univet.hu/users/zelek/predacio/ • http://simecol.r-forge.r-project.org/ • T.J.Case (2000): An Illustrated Guide to Theoretical Ecology. Oxford University Press, New York.