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Streptocoques, pneumocoque, entérocoques. Cours bactériologie Faculté de Pharmacie de Strasbourg Dr Ph. RIEGEL Institut de Bactériologie. Introduction. Bactéries commensales de l’homme et des animaux: muqueuses, (peau) Muqueuses oropharyngées: Streptocoques et pneumocoques +++
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Streptocoques, pneumocoque, entérocoques Cours bactériologie Faculté de Pharmacie de Strasbourg Dr Ph. RIEGEL Institut de Bactériologie
Introduction • Bactéries commensales de l’homme et des animaux: muqueuses, (peau) • Muqueuses oropharyngées: • Streptocoques et pneumocoques +++ • Entérocoques + • Muqueuses digestives: • Streptocoques et pneumocoques + • Entérocoques +++ • Pathogènes opportunistes
Caractères généraux • Cocci à Gram positif • Formation de chaînettes (ou diplocoques) • Croissance aérobie et anaérobie • 2 genres bactériens: • Genre Streptococcus (incluant S. pneumoniae) • Genre Enterococcus (incluant la majorité des streptocoques dits entériques)
Classification • Pouvoir hémolytique: • Bêta complète • Alpha incomplète (dite verdissante) • Non hémolytique • Groupes antigéniques • Paroi: A, C, F ou G • Capsule: B • Membranes cytoplasmiques: D • Espèces: caractères biochimiques et génétiques
Groupes antigéniques • Paroi: A, C, F ou G • Capsule: B • Membranes: D • caractères biochimiques:
Streptococcus pyogenes (1) • Bêta-hémolytiques du groupe A • Facteurs de virulence: • Hémolysines, streptokinase, hyaluronidases, toxine érythrogénique • Infections locales: • Angines et otites (enfants), sinusites, adenophlegmons • Impétigo • Erysipèle (dermo-hypodermite) • Fasciites, myosites • Traitement: • Pénicillines (toujours sensibles), macrolides (parfois résistants)
Infections locales: • Angines et otites (enfants), sinusites, adenophlegmons • Impétigo • Erysipèle (dermo-hypodermite)
Streptococcus pyogenes (2) • Infections systémiques: • Choc toxique streptococcique(origine cutanée +++) • Scarlatine (toxi-infection, origine pharyngée +++) • Syndromes post-streptococciques : • Rhumatisme articulaire aiguë (m. de Bouillaud) • Glomérulonéphrite aiguë • Chorée aiguë de Sydenham • Erythème noueux
Diagnostic • Prélèvements: • Frottis de gorge, aspiration de pus, ponctions de liquides internes (hémocultures) • Test de détection directe de S. pyogenes (frottis pharyngé) • Examens bactériologiques: • Examen direct (cocci Gram + chaînettes, culture) • Colonies bêta hémolytiques, groupage, tests biochimiques • Sérologie: • ASLO: 8 à 10 jours après, infection pharyngée • Antistreptodornases: 3 semaines après, origine pharyngée ou cutanée
S. pyogenes • Traitement: • Pénicillines (toujours sensibles), macrolides (parfois résistants)
Streptococcus agalactiae (1) • Streptocoque bêta hémolytique groupe B • Il existe des souches non hémolytiques • Présence d’une capsule (non opsonisé) • Colonise le tube digestif • Présence dans le tractus urogénital • Portage vaginal chez femme enceinte (30 %) • Présence pharyngée et cutanée moins fréquente
S. agalactiae (2) • Infection materno-fœtale in utero: • Dés les premiers jours de la naissance • NN: septicémie, méningite, pneumonie • Infection du NN lors de l’accouchement: • 1 semaine à 3 mois après la naissance • Surtout méningite • Autres infections (enfant ou adulte) • Infections urinaires • Fasciites, méningites ou pneumonies (personne âgée ou immunodéprimée) • Diagnostic: • Liquide gastrique, placenta, LCR (Ag), hémocultures
Autres streptocoques bêta hémolytiques • S. dyslagactiae • Groupe en C ou G • Infections pharyngées ou cutanées • GNA possible • S. anginosus (ancien S. milleri) • Complexe: S. anginosus, S. intermedius, S. constellatus • Groupes C, G, F ou non groupables • Suppurations profondes (digestives, hépatiques, cérébrales) • Espèces animales pouvant contaminer l’homme: • S. porcinus: peut grouper en B, inf. materno-fœtale • S. canis: groupe G, infections cutanées, septicémies
Streptocoques alpha ou non hémolytique • Streptocoques oraux: • Cavité buccale, adhérence aux muqueuses • Endocardites +++, abcès cérébraux • Groupe mitis/oralis/gordonii et groupe mutans/sobrinus • Complexe Streptococcus bovis (entériques) • Groupe souvent en D • Plusieurs espèces: S. bovis, S. gallolyticus • Bactériémie à point de départ digestif, endocardites ++ • Pathologies coliques sous-jacentes • Streptocoques déficients • Genres Abiotrophia ou Granulicatella • Endocardites ++
Pneumocoque (S. pneumoniae) • Streptocoques oraux du groupe mitis • Présence de capsule, IgA protéase, pneumolysine inhibant la phagocytose • Saprophyte de la cavité buccale • Infections: • Sinusites et otites moyennes • Pneumonie franche lobaire aiguë • Méningites (enfant, adulte souvent immunodéprimé) • Endocardites très délabrantes
S. pneumoniae (2) • Diagnostic bactériologique: • Cocci Gram + en diplocoques ou courtes chaînettes • Colonies souvent muqueuses, alpha hémolytiques • Identification basée sur des tests biochimiques ou génomiques • Recherche d’antigènes capsulaires (LCR +++, urines +/-) • Traitement: • Amoxicilline ou macrolides si souches sensibles • Nombreuses souches de sensibilité diminuée ou résistantes aux pénicillines. Traitement par céphalosporines ou vancomycine suivant la sensibiklité in vitro.
Entérocoques (1) • Genre Enterococcus (majorité des anciens streptocoques entériques) • Cocci Gram + en longues chaînettes • Croissance en présence de sels biliaires ou de NaCl • Groupe souvent en D, alpha ou non hémolytique, rarement bêta hémolytique • Espèces les plus fréquentes: • E. faecalis (urines +++, hémocultures +) • E. faecium (urines +, hémocultures +++)
Entérocoques (2) • Saprophytes du tube digestif • Infections urinaires • Infections biliaires, lésions suppuratives abdominales • Septicémie, endocardite • Souvent isolés en association avec d(autres bactéries de la flore digestive (entérobactéries, anaérobies) • Sensibilité modérée ou résistance aux pénicillines • Résistance rare aux glycopeptides • Nécessite souvent des associations d’antibiotiques
Genres apparentés aux streptocoques • Catalase négative (sauf Alloiococcus, catalase faible) • Peuvent être soit en formation de chaînette, soit en formation d’amas ou de tétrades • Certains sont résistants à haut niveau à la vancomycine • Aerococcus viridans: ubiquiste • Aerococcus urinae: infections urinaires, septicémies • Alloiococcus otitidis: otites chroniques • Leuconostoc et Pediococcus: R à la vancomycine