250 likes | 745 Views
Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund. Proteiner. Aminosyror. Enklaste. Aminogrupp -NH 3 + Karboxylsyragrupp -COO - Väte Variabel sidogrupp 20 olika. Primärstruktur Vilka aminosyror och vilken ordning. Peptidbindning. Dipeptid. Aminosyror. Kovalent bindning
E N D
Biokemi MNXA10/12Hans-Erik Åkerlund Proteiner
Aminosyror Enklaste Aminogrupp -NH3+ Karboxylsyragrupp -COO- Väte Variabel sidogrupp 20 olika
Primärstruktur Vilka aminosyror och vilken ordning Peptidbindning Dipeptid Aminosyror Kovalent bindning Specialfall av Amidbindning Riktning Amminoterminal / N-terminal Karboxyterminal / C-terminal Stommen N - C - C
a-helix (Sekundärstruktur)er Vätebindningar Vätebindning Vätebindning
b-veckstruktur(Sekundärstruktur) Utsträcktstruktur Vätebindnigarmellankedjor Antiparalellaellerparalella R-grupperuppochner
Opolära grupper inne Polära grupper på ytan FA binding protein Lysozym Ferritin Tertiärstruktur Trediminsionell veckning
Störande molekyler opolära Den hydrofoba effekten Vattenstruktur
Cysteinbryggor = SS Bryggor = Disulfidbryggor Stabiliserartertiärstrukturen
Ex. Hemoglobin frånmänniska fyrasubenheter Kvartärstruktur Antal och arrangeman av subenheter
Enzymer,KatalysochKinetik Hastighet Påskyndarreaktionerutanattsjälvförbrukas. Kaningåidelreaktioner men återbildasalltid Påverkarintejämvikten, K likasomutanenzym. Påskyndarattjämviktenställer in sig Specificitet Reglerbarhet
Varför påskyndas reaktioner? Aktiveringsenergi Enzymer -gör att det krävs mindre aktiveringsenergi. -påverkar inte energiskillnaden mellan substrat och produkt
Enzymkatalyseradreaktion Upvisarmättnad Karaktäristisktförenzymkatalyseradreaktion.
Michaelis-Menten Avsätt v0somfunktionav [S] v = Vmax*[S]/(KM+[S])
Ex. Karboanhydras Zn2+ prostetiskgrupp Metalljonkatalys Aktiveringavvatten pKa=7 (jfrt med 15.7 förfrittvatten) ca7 miljonerggr snabbareänutankatalys
Nukleinsyror: DNA ochRNA
Nukleotider som byggstenar Fosfat – Socker -Kvävebas
Sockret R i RNA D i DNA Syre saknas Deoxy
Kvävebaser: Adenin Guanin Cytosin Uracil (i RNA)/Thymin (i DNA)
DNA struktur. 1) polynukleotid, kvävebaser A,G,C,T 2) har polaritet: 5´ o 3´ ändar 3) basparning mellan två antiparella strängar 4) H-bindingar, 2 st mellan A o T, 3 st mellan G o C 3´ 5´ A G C T C T C G A G 3´ 5´ 5´ 3´ 3´ 5´
DNA dubbelhelix 5´3´ 10 nukleotider eller Baspar (bp) Stor fåra (major groove) Liten fåra (minor groove) Mörk färg: fosfodiester o socker (huvudkedja) Ljus färg: basparade kvävebaser 3´5´
Cellulära processer Replikation Transkription Translation DNA RNA PROTEIN Process Huvudsaklig funktionell enhet/ enzym Replikation DNA polymeras. (DNA templat, mall) Transkription RNA polymeras. (DNA templat eller ) Translation Ribosom, består av rRNA, protein. (mRNA templat)