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Abondance et diversité génétique des parasitoïdes marins appartenant aux Syndiniales ( Alveolés )

L. Guillou, M. Viprey , A. Chambouvet , R. M. Welsh , A. R. Kirkham , R . Massana , D. J. Scanlan and A. Z. Worden. Widespread occurrence and genetic diversity of marine parasitoids belonging to Syndiniales ( Alveolata ). Abondance et diversité génétique des parasitoïdes marins

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Abondance et diversité génétique des parasitoïdes marins appartenant aux Syndiniales ( Alveolés )

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Presentation Transcript

  1. L. Guillou, M. Viprey, A. Chambouvet, R. M. Welsh, A. R. Kirkham, R. Massana, D. J. Scanlan and A. Z. Worden Widespread occurrence and genetic diversity of marine parasitoids belonging to Syndiniales (Alveolata) Abondance et diversité génétique des parasitoïdes marins appartenant aux Syndiniales (Alveolés) Baffreau Alexandrine Couet Pauline M1 Océanographie BEM

  2. Les objectifs des auteurs • Améliorer la phylogénie des Alvéolés via les nouvelles séquences ARNr 18S et réaliser la phylogénie précise des groupes I et II des Syndiniales • Comparer la diversité génétique obtenue aux connaissances actuelles sur la taxonomie des Syndiniales • Elargir les milieux d’habitats des Dinoflagellés à travers leur séquences dans les banques de gènes • Extraire des informations générales sur l’écologie de certains membres des Syndiniales

  3. Echantillons récoltés : • à des saisons différentes • issus de milieux avec des conditions environnementales très différentes • Profondeur • Lumière • Disponibilité en nutrients et dioxygène • Séquençage • Banques de séquences • Analyses phylogénétiques : • Neighbour-Joining • Maximum de vraisemblance • Maximum de parcimonie • Test Bootstrap

  4. Autres Dinophycées Groupe II Dinoflagellés Groupe IV Syndiniales Groupe III Groupe I Groupe V Perkinsea AY665063 SCM38 C14, AF133909 Parvilucifera Colpodellidae Apicomplexes Ciliés Groupes externes Phylogénie des Dinobiontes parmi les Alvéolés

  5. HT Clade 3 HT Clade 6 HT Clade 5 HT HT Clade 8 Clade 1 HT Clade 4 HT Clade 2 Clade 7 Phylogénie du groupe I des Syndiniales

  6. HT Clade 23 Clade 22 Singleton Clade 12 Clade 15 HT Singleton Clade 31 HT Singleton Clade 21 HT Clade 24 HT Clade 14 Clade 19 Proche de 10+11 ? Clade 34 HT Clade 18 Singleton Clade 32 Clade 16 Clade 37 HT Clade 28 Singleton Singleton Singleton Singleton Clade 10+11 Clade 38 Clade 44 Clade 17 Singleton Singleton Clade 30 Clade 13 Clade 9 Clade 26 Clade 8 Phylogénie du groupe II des Syndiniales

  7. Amoebophrya Clade 3 Clade 7 Clade 29 Clade 2 Clade 43 Clade 33 Singleton Singleton Clade 4 Clade 40 Clade 42 Clade 36 Clade 27 Clade 25 Singleton Clade 39 Clade 20 Clade 5 Clade 35 Clade 6 Clade 1 Phylogénie du groupe II des Syndiniales Clade 41

  8. Guillou & al (2008) : 8 clades du groupe II 1, 2, 3, 4, 5, 25, 33, 39, 41 et 42 Kim & al (2008) : 9 sous-groupes Clade 1 + une séquence du clade 25 Biaisée par une séquence chimère Clade 4 Clade 3 Clade 5 Clade 2 Clade 33 Chimère probable Sous-groupe 1 Sous-groupe 2 Sous-groupe 3 Sous-groupe 4 Sous-groupe 5 Sous-groupe 6 Sous-groupe 7 Sous-groupe 9 Sous-groupe 8

  9. Diversité des habitats des Syndiniales

  10. Clades présents sur toute la colonne d’eau Clades spécialistes d’un milieu

  11. Mode de vie des Syndiniales : exemple d’Amoebophrya

  12. Montagnes 2008, modifié

  13. Saldarriaga 2003, modifié 60 90 75 Heterocapsatriquetra DINOFLAGELLES 100 100 100 Oxyrrhis marina OXYRRHIS 100 99 100 Perkinsusmarinus PERKINSUS 83 87 93 Plasmodium falciparum 94 100 99 Toxoplasmagondii APICOMPLEXES Cryptosporidiumparvum 100 100 100 Parameciumcaudatum Tetrahymenathermophila CILIES Stylonychialemnae 0,1

  14. Bloom à Noctilucascintillans, près de Cape Rodney, Hauraki Gulf, Nouvelle-Zélande

  15. Bibliographie Chambouvet A, Guillou L (2009) Les Amoebophrya, parasitoïdes de dinoflagellés toxiques. Consulté sur http://www.sb-roscoff.fr/Phyto/index.php?option=com_content&task=view&id =82&Itemid=136#Pub2009 en novembre 2010 Guillou L, Viprey M, Chambouvet A, Welsh RM, Kirkham AR, Massana R, Scanlan DJ, Worden AZ (2008) Widespread occurrence and geneticdiversity of marine parasitoidsbelonging to Syndiniales (Alveolata). Environ Microbiol 10: 3349-3365 Kim, S., Park, M.G., Kim, K.-Y., Kim, C.-H., Yih, W., Park, J.S., and Coats, D.W. (2008) Geneticdiversity of parasiticdinoflagellates in the genusAmoebophrya and itsrelationship to parasite biology and biogeography. J EukaryotMicrobiol 55: 1–8 Montagnes DJS, Chambouvet A, Guillou L, Fenton A (2008) Responsibility of microzooplankton and parasite pressure for the demise of toxicdinoflagellate blooms. AquatMicrobEcol 53: 211-225 Saldarriaga, J.F., McEwan, M.L., Fast, N.M., Taylor, F.J.R., and Keeling, P.J. (2003) Multiple proteinphylogenies show thatOxyrrhis marina and Perkinsusmarinus are early branches of the dinoflagellatelineage. Int J SystEvolMicrobiol 53: 355–365. Images : Diapositive de présentation : http://www.smhi.se/oceanografi/oce_info_data/plankton_checklist/dinoflagellates/amoebophrya_ceratii.gif Diapositive de conclusion : http://citoyen.onf.ca/blogs/wp-content/uploads/2008/08/red_tide_generav3.jpg

  16. Merci de votre attention ! Amoebophrya ceratii

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