1 / 18

Polymorfismy DNA a jejich využití ve forenzní genetice

Polymorfismy DNA a jejich využití ve forenzní genetice. Halina Šimková. CO JE TO POLYMORFISMUS?. = existence více variant (alel) téhož místa (lokusu) v DNA. počet alel může být 2, 3…………ale také stovky lokus pak označujeme jako vysoce polymorfní a daný jev jako mnohotný alelismus.

sundari-chirag
Download Presentation

Polymorfismy DNA a jejich využití ve forenzní genetice

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Polymorfismy DNA a jejich využití ve forenzní genetice Halina Šimková

  2. CO JE TO POLYMORFISMUS? = existence více variant (alel) téhož místa (lokusu) v DNA • počet alel může být 2, 3…………ale také stovky • lokus pak označujeme jako vysoce polymorfnía daný jev jako mnohotný alelismus vysoce polymorfní lokus je obecně pro identifikaci osob vhodnější

  3. TYPY POLYMORFISMŮ • alely se mohou lišit • délkou = polymorfismus délkový • sekvencí = polymorfismus sekvenční - CATAGATATAA- - CATAGATTAGATATAA- - CATAGATATAA- - CATAGATTTAA-

  4. Lidská DNA Nekódující 90% Kódující 10% • variabilita nižší • selekční tlak velký • variabilita vysoká • selekční tlak malý či nulový V nekódující DNA najdeme ve větší míře vysoce polymorfní lokusy V kódující DNA najdeme spíše méně polymorfní lokusy

  5. Nejvýznamnější polymorfismy využívané ve forensní genetice Nekódující oblast Kódující oblast • geny dle nichž lze určit DRUHOVOU SPECIFITU • geny dle nichž lze určit FYZICKÉ VLASTNOSTI JEDINCE • geny dle nichž lze určit POHLAVÍ • geny určující krevní a tkáňové skupinové vlastnosti • dlouhé tandemové repetitivní sekvence • krátké tandemové repetitivní sekvence • jednonukleotidové polymorfismy • hypervariabilní oblast mtDNA

  6. URČENÍ DRUHOVÉ SPECIFITY • užívá se nejčastěji analýza genu pro cytochrom b v mtDNA • analýza založena na sekvenaci • referenční sekvence známy u mnoha druhů

  7. URČENÍ FYZICKÝCH VLASTNOSTÍ … blízká budoucnost přinese masový rozvoj molekulárně genetických metod určování fyzických znaků osob! BARVA OČÍ TĚLESNÁ VÝŠKA BARVA PLETI BARVA VLASŮ

  8. STANOVENÍ POHLAVÍ obvykle pomocí genu pro amelogenin, který se nachází na pohlavních chromozómech X a Y…

  9. URČENÍ KREVNÍCH A TKÁŇOVÝCH SKUPINOVÝCH VLASTNOSTÍ • spíše okrajový význam • lze použít u degradovaného materiálu kde již sérologické stanovení skupin není možné • zejména u stanovení HLA haplotypu (tkáňová specifita osob) je riziko zneužití těchto informací vysoké („nedobrovolný dárce orgánů“)

  10. DLOUHÉ TANDEMOVÉ REPETITIVNÍ SEKVENCE (LTR) Metoda zobrazení variabilního počtu repetic (VNTR) byla nazvána „polymorfismus délky restrikčních fragmentů“ (RFLP) neboli „DNA fingerprint“

  11. KRÁTKÉ TANDEMOVÉ REPETITIVNÍ SEKVENCE (STR) • jsou to opakování krátkého základního motivu o délce do 10 bp těsně za sebou, „v tandemu“ : TTC-CACG-CACG-CACG-CACG-CACGGTT • počet opakování motivu může být různý – existuje obvykle mnoho alel, někdy i několik desítek = STR lokusy jsou vysoce polymorfní ( mnohotný alelismus) • v lidském jaderném genomu je známo více než 8000 STR

  12. otestováním několika tandemových repetic a pohlaví vzniká tzv. GENETICKÝ PROFIL

  13. ANALÝZA Y-chromozómu sledování rodokmenů po meči

  14. KRÁTKÉ TANDEMOVÉ REPETITIVNÍ SEKVENCE NA Y-chromozómu (Y-STR) YCAII DYS385I/II DYS393 DYS392 DYS391 DYS390 DYS389II DYS389I DYS19

  15. ANALÝZA mtDNA sledování rodokmenů po přeslici

  16. MITOCHONDRIÁLNÍ DNA – HYPERVARIABILNÍ OBLASTI • nekódující oblast D-kličky • analýza založena na sekvenaci • Andersonova referenční sekvence

  17. JEDNONUKLEOTIDOVÉ POLYMORFISMY (SNP) • rozptýleny v celém genomu • analýza založena na stanovení typu nukeotidu v konkrétní pozici • velmi často využívána analýza pomocí biočipů

  18. PŘEHLED HLAVNÍCH LOKUSŮ UŽÍVANÝCH VE FORENZNÍ GENETICE lokus polymorfismus použití míra identifikace VNTR délkový (sekv.) identifikace osob individuální STR délkový (sekv.) identifikace osob individuální individuální SNP sekvenční identifikace osob Y-STR délkový (sekv.) paternální linie skupinová HVR mtDNA sekvenční maternální linie skupinová amelogenin délkový stanovení pohlaví skupinová HLA / KS délkový + sekv. stanovení KS a HLA skupinová skupinová sekvenční / délkový / regulační stanovení příslušných fyzických znaků zkoumané osoby geny pro fyzické znaky

More Related