Núcleo de Pesquisa em Biodiversidade e Computação BioComp

1. Núcleo de Pesquisa em Biodiversidade e ComputaçãoBioComp Reunião geral 19/12/12

2. Agenda proposta • 9:00 - recepção e adoção da agenda • 9:10 - apresentações (< 5´ cada) • 10:00 - Perguntas e discussão sobre as atividades propostas • 10:40 - café • 11:00 - Discussão sobre as atividades propostas: consolidação e calendário • 11: 30 - Informações gerais do BioComp • 11:40 - Encerramento

3. Objetivos • Balanço das ações e resultados em 2012 • Propostas para 2013 • Reunião do Conselho

4. Objetivo do BioComp • Criar um fórum onde pesquisa, educação e extensão sobre conservação e uso sustentável da biodiversidade são realizadas segundo um enfoque multidimensional envolvendo Biologia, Computação, Engenharia, Agricultura, Economia, entre outras áreas. • Criar conhecimento e aplicá-lo para o benefício da sociedade é nossa meta final.

5. Fórum • Promover a interação entre as partes é o ponto principal • Novas idéias, propostas e parcerias • Pesquisa e projetos • Educação e orientação • Publicações • Extensão • Treinamento • Divulgação • Eventos

6. Há muita atividade em curso ! • Nem sempre amplamente visíveis • Envolvendo grupos menores • Apenas parte da equipe original • Mas com novas adesões • BioComp = grupo consolidado • Pré-existência de projetos e atividades (contrapartida) • São parte do BioComp !

7. Desafios • Divulgar melhor as atividades • Aumentar as interações e a transdisciplinaridade • Em pequena escala • Em grande escala • Aumentar as atividades e a participação • comprometimento ≠ envolvimento

8. Exemplos - projetos

9. Exemplos - projetos • Classificação de abelhas baseada em imagens • Tiago, Anna, Fabiana, André • Modelagem de distribuição de espécies: estudos de caso • Cris Giannini, André Acosta, Vera, Saraiva • Abordagem semântica para padrões de dados de biodiversidade • Anarosa, Fabiana, Saraiva • Classificação de plantas baseada em imagens • Carlos, Anna, Luis Otávio • Redes de interação biológicas e aplicações • Tatiana, Juliana, Nancy, Saraiva

10. Exemplos - projetos • Inventário e gestão ambiental & RFId • Márcia, Carlos, Kleber, Jade, • Digitalização de dados de biodiversidade • Allan, Danilo, Lucas, Etienne, Saraiva • Qualidade de dados de biodiversidade • Allan, Saraiva • Interação Abelha-planta • Garófalo, Cláudia, Hipólito, Michelle

11. Exemplos - projetos • Sistemas de informação e redes de sensores • Wilian, Fabiana, Carlos e Saraiva • Comunicação e divulgação • Bruno Nunes Silva et all • Outros exemplos a relatar ??

12. Exemplos – pesquisadores visitantes

13. Pesquisadores visitantes • Friedrich Recknagel • Universidade de Adelaide - AU • 5 a 24/mar/2012 • Palestra “Área de pesquisa em Informática Ecológica: Estado da Arte e Desafios”, 8/3/12 • Disciplina de Pós-graduação - Tópicos Especiais em Computação e Biodiversidade • 13 a 15/3/12 • Interação com pesquisadores em SP • Preparação do ISEI 2012 (International Conference on Ecological Informatics)

14. Pesquisadores visitantes • Rolf A. de By • University of Twente – Netherlands • Dept of Geoinformation Processing (GIP) ITC • Faculty of Geo-information Science and Earth Observation • 15/Junho/2012 • Seminário “Opportunities for research collaboration on biodiversity informatics • Poli – SP • Outros participantes • Andrea Pignatari Drucker – Embrapa monitoramento ambiental • Laurindo Campos e Andrea Albuquerque - INPA • Dilvan Moreira -ICMC-USP • Pedro Correa e Antonio Saraiva

15. Pesquisadores visitantes • Lucas Garibaldi • Universidade Nacional de Rio Negro – AR • Julho/2012 • Palestra ‘Marginal contribution of ecosystem services to agricultural productivity’, 25/7/12 • Interação com pesquisadores em SP e RP, 19 a 27/7/12 • 28/novembro a 1/dezembro/2012 • Disciplina de Pós-graduação - PCS-5026 • Regresion Lineal en el software R, 29 e 30/11/12 • Interação com pesquisadores em SP

16. Pesquisadores visitantes • Jacobus Biesmeijer • Naturalis Biodiversity Center, Leiden-Netherlands • Julho/2012 • Palestra “Changes in plant-flower visitor communities through time and space” • Encontro sobre Abelhas – 25/7/12 • Interação com pesquisadores em RP, 24 a 28/7/12

17. Pesquisadores visitantes • Andrew Townsend Peterson • University of Kansas • 9/agosto/2012 • Palestra “New Developments and Insights in Ecological Niche Modeling ” • Interação com pesquisadores em SP • Discussão sobre proposta de projeto temático em Modelagem de distribuição de espécies

18. Pesquisadores visitantes • Jesús Aguirre Gutiérrez, • Naturalis Biodiversity Center, Leiden-Netherlands • 9/outubro/2012 • Palestra “Fit-for-purpose: Species distribution model performance depends on evaluation criteria: Dutch hoverflies as a case study” • Eco-Encontros (IB-USP) • Interação com pesquisadores em SP (8 a 11/10/12)

19. Pesquisadores visitantes • Armando Geller • Scensei, EUA • 18/outubro/2012 • Palestra “Multiagent modeling and simulation for and with stakeholders in areas affected by armed conflict ” • CCE-USP

20. Pesquisadores visitantes • Enrique Martínez-Meyer • Instituto de Biología, • Universidad Nacional Autónoma de México • 29/11 a 7/12/2012 • Palestra “The Use of Primary Biodiversity Data and Informatics Tools for Scientific Research and Decision Making” • Poli - SP • Interação com pesquisadores em SP (29/11 a 1/12) • Participação no ISEI 2012 com apoio do BioComp

21. Eventos • Simpósio “Ferramentas computacionais para pesquisa em polinizadores” • X Encontro sobre Abelhas, 25/Julho/2012 • Jacobus Biesmeijer • Changes in plant-flower visitor communities through time and space • Humberto Ribeiro da Rocha • Avaliação dos serviços ambientais de polinização e qualidade do habitat • Milton Cezar Ribeiro • Modelos de simulação: Desafios e possibilidades para explorar efeitos da paisagem sobre as abelhas • Lucas Alejandro Garibaldi • Marginal contribution of ecosystem services to agricultural productivity • Antonio Mauro Saraiva / Tereza Cristina Giannini • The Research Center on Biodiversity and Computing BioComp

22. Eventos • ISEI - International Conference on Ecological Informatics • 3 a 7/dezembro/2012 • Apoio à vinda de Enrique Martinez-Meyer • Comissão Organizadora (Pedro L.P. Correa) • participação de pesquisadores no evento

23. Disciplinas de Pós-graduação • Computação e Biodiversidade • PCS – 5023 • BIE – 5789 • Oferecida em 2º sem 2011 • Tópicos especiais em Computação e Biodiversidade • PCS – 5026 • Oferecida 2 vezes em 2012 • Fred Recknagel (1º sem) • Lucas Garibaldi (2º sem)

24. Outros eventos ou atividades ??

25. Administração • Técnico Procontes: Analista Administrativo • Sra. Lourdes Keiko Nagae Takigami (Fev/12) • Apoio administrativo / financeiro • Execução e acompanhamento financeiros • Recursos Pró-Reitoria de Pesquisa - USP • Recursos de outras fontes (ex.: FUSP, FDTE) • Apoio aos eventos locais, cursos, recepção visitantes • Organização do laboratório

26. GT NAPs • Grupo de trabalho dos Núcleos de Apoio à Pesquisa • Criado pela Pró-Reitoria de Pesquisa e Vice-Reitoria Executiva para Assuntos Administrativos • Portaria CODAGE, nº 574, de 13.07.2012, DOE 18.07.2012

27. GT NAPs • “propor medidas para regular as formas de apoio à gestão dos projetos dos Núcleos de Apoio a Pesquisa, de modo a estabelecer procedimentos e rotinas, desburocratizados e eficientes, mais adequados à realização da atividade-fim”, abrangendo precipuamente as áreas tecnologia da informação e comunicação, organizacional e jurídica.

28. GT NAPs • MARIA PAULA DALLARI BUCCI • Procuradora • Designada para Assessoria Técnica do Gabinete • PETER GREINER JR. • Diretor do Departamento de Finanças • LUIS CARLOS CORREA DE SANTANA • Diretor do Departamento de Administração • LUIS NATAL ROSSI • Professor da Escola Politécnica e • Diretor do Departamento de Informática • LUIS MOREIRA GOMES • Departamento de Informática • LUIZ ANTONIO TEIXEIRA • Coordenador de Administração Geral • OSVALDO NAKAO • Professor da Escola Politécnica e • Assessor da Pró-Reitoria de Pesquisa • ANTONIO SARAIVA • Presidente da Comissão de Pesquisa da Escola Politécnica e • Membro do Conselho de Pesquisa

29. Apoio técnico • Edson de Souza • Suzano Bitencourt • Nilton do Carmo • Desenvolvimento dos Web sites • Hospedagem de ferramentas (CCE) • Compras de equipamentos • Manutenção

30. Propostas para 2013

31. Pesquisadores visitantes e eventos • Lucas Garibaldi • Cursos de estatística (cont) até modelos mistos • Pesquisa – avaliação econômica • Jacobus Biesmeijer • Treinamento em modelagem e análise de dados (de polinizadores) • Pesquisa • Pós-docs / doc • Luisa Carvalheiro • Chiara Polce • Jesus Aguirre

32. Pesquisadores visitantes e eventos • Rede de catálogos polínicos • Cláudia Ines • Reunião para discussão dos padrões e formação da rede • TDWG meeting • Firenze, Outubro/Nov 13 • Sessão em qualidade de dados de biodiversidade • Allan, Etienne e Saraiva

33. Pesquisadores visitantes e eventos • Instituto de Estudos Avançados da USP • Grupo de Serviços de Ecossistemas • Vera L.I. Fonseca (coord) • Reuniões • Capítulo de Políticas Públicas e Polinizadores (mar) • Mudanças Climáticas e Polinizadores (1º e 2º sem) • Conservação de polinizadores: apoio de ferramentas moleculares e de coleções biológicas para políticas públicas

34. Pesquisadores visitantes e eventos • Outros? • Critérios • Interesse e aproveitamento mais amplo possível

35. Conselho • Cris Miyaki – IB • Vera Fonseca – IB/UFERSA • Pirani – IB • Kleber – EP • Vitor – EP • Carlos – EP • Tiago – EACH • Garófalo – FFCLRP • Lionel – FFCLRP/UFERSA • Fabiana – UFABC

36. Divulgação • Web site (biocomp.org.br) • Atualização • Pessoas • Projetos • Instituições • Produção e atividades • Multilíngüe • Relatórios • Folder

37. Projetos de pesquisa: financiamento • Novos financiamentos para projetos • Temático FAPESP – Open Modeller ?? • FAPESP – rede de catálogos polínicos (p 2014) • Outros ??

38. Tema 1Redes de sensores aplicados à agrobiodiversidade Coordenadores Carlos Cugnasca - Escola Politécnica Vera Fonseca - Instituto de Biociências

39. Tema 2Caracterização e estudo biológico e computacional de forma, comportamento e comunicação em seres vivos Coordenadores Anna Helena - Escola Politécnica Tiago Francoy- EACH

40. Tema 3Modelagem, análise e tomada de decisão em biodiversidade Coordenadores Cris Arias - Instituto de Biociências Pedro Correa- Escola Politécnica

41. Tema 4Identificação de espécies e interações biológicas: abordagens moleculares e morfológicas Coordenadores Cris Miyaki - Instituto de Biociências André Hirakawa - Escola Politécnica

42. Tema 5Diversificação, biogeografia e conservação da biota neotropical: uma abordagem integrativa Coordenadores Tatiana Torres - Instituto de Biociências Liria Sato- Escola Politécnica

43. Boas Festas ! Um 2013 com muito mais sucesso e resultados !