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NetBioDyn Et la modélisation multiagents

NetBioDyn Et la modélisation multiagents. Application à la modélisation de quelques phénomènes immunitaires. Les ressources?. Le logiciel: un applet Java en ligne ou en local http://acces.inrp.fr/acces/logiciels/externes/netbiodyn/logiciel-et-ressources Les modèles

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NetBioDyn Et la modélisation multiagents

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Presentation Transcript

  1. NetBioDynEt la modélisation multiagents Application à la modélisation de quelques phénomènes immunitaires

  2. Les ressources? • Le logiciel: un applet Java en ligne ou en local http://acces.inrp.fr/acces/logiciels/externes/netbiodyn/logiciel-et-ressources • Les modèles http://acces.inrp.fr/acces/ressources/sante/reponse-immunitaire/ressources/biodyn/ • Les pistes d’exploitation pédagogique: http://acces.inrp.fr/acces/ressources/sante/reponse-immunitaire/enseigner/enseigner-avec-netbiodyn/ • Des didacticiels

  3. Pourquoi modéliser? • Utiliser un modèle pour simuler une manipulation non réalisable in vivo • Utiliser un modèle pour discuter d’un protocole à mettre en œuvre • Utiliser un modèle pour synthétiser des connaissances • Construire un modèle

  4. Principe de la modélisation multiagents Créer un système biologique avec plusieurs agents évoluant au cours du temps Chaque agent • est une entité informatique représentant une entité biologique • possède des comportements • est capable d'interactions avec d’autres entités

  5. 1. Simuler une expérience Le rôle des LT4 On sait: Les LT4 sont les pivots des réactions immunitaires acquises. On a mis en évidence la nécessité des LT4 pour la production d'anticorps.  Par quel moyen les LT4 interviennent-ils dans la différenciation des LB en plasmocytes sécréteurs d'anticorps.

  6. Utilisation du dispositif de Marbrook On extrait des lymphocytes B et T de la rate d’une souris préalablement mise en contact avec un antigène Z soluble.

  7. Tester une hypothèse L’activation des LB se fait par contact avec les LT4 Modèle marbrook

  8. Entités et comportements LT4a --------> LT4a + iL Lba + iL ------->Plasmocyte Lba + iL -------> Lba +LBa

  9. 2. Simuler pour bâtir un protocole Comment mettre en évidence une séropositivité? (Test ELISA) Monter un protocole (avant de le mettre en œuvre)

  10. 3. Un modèle pour synthétiser des connaissances Humeur…

  11. 4. Créer son modèle  Montrer que la phagocytose est plus efficace si des anticorps spécifiques sont présents Définir ses entités Nom Image visible ou non dans le panel Donner un comportement à Chacune

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