170 likes | 296 Views
Påvisning af latente angreb af Fusarium og Phoma i lagrede kartoffelpartier. Steen Lykke Nielsen, Mogens Nicolaisen og Annemarie Fejer Justesen Danmarks JordbrugsForskning, Afdeling for Plantebeskyttelse, Forskningscenter Flakkebjerg,. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri
E N D
Påvisning af latente angreb af Fusarium og Phoma i lagrede kartoffelpartier. • Steen Lykke Nielsen, Mogens Nicolaisen og Annemarie Fejer Justesen • Danmarks JordbrugsForskning, Afdeling for Plantebeskyttelse, Forskningscenter Flakkebjerg, Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Baggrund. • Problemer med Phoma- og Fusarium-råd i lagrede kartofler. • Et forprojekt bevilget af Kartoffelafgifts-fonden i 2003. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Disposition • Symptomer. • Faktorer, der påvirker udvikling af Phoma- og Fusarium-råd. • Sårings-tests. • Test baseret på real time PCR. • Test baseret på kunstig næse. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Symptomer af Phoma • Mørk rund tommelfingeraftryks-lignende rådplet. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Symptomer af Fusarium Mørk indsunken plet med indskrumpede koncentriske ringe. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Phoma- og Fusarium-råd 1. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Phoma- og Fusarium-råd 2. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Phoma- og Fusarium-råd 3. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Phoma- og Fusarium-råd 4. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Sårings-test til at bestemme latente Fusarium-infektioner. • Princip: Knolden såres og inficeres med den påhæftede jord. • Eksempel: ”Skæringstesten”: Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Sårings-test til at bestemme latente Phoma-infektioner. • Princip: Knolden såres og inficeres med den påhæftede jord. • Eksempel: ”Knack-testen”. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Test baseret på real-time PCR 1 • Princip: Knoldenes påhæftede jord afvaskes. • Der ekstraheres totalt DNA fra jorden. • Der køres ”real-time” PCR på DNA’et. • Testen er ikke udviklet endnu. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Test baseret på real-time PCR 2 • Eksisterende elementer: • Ekstraktion • Primere • Udstyr tilgængeligt Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Test baseret på real-time PCR 3 • Manglende elementer: • Nye primere • Korrelation mellem DNA- og såringstests • Indre og ydre latent Phoma • Korrelation mellem DNA og % knolde Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Test baseret på kunstig næse 1 • Princip: Måling af flygtige organiske forbindelser, der udskilles af knoldene. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Test baseret på kunstig næse 2 • Der udskilles specifikke flygtige organiske forbindelser, når svampen metaboliserer knold-vævet. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning
Konklusion. • Der eksisterer allerede standardiserede tests til at påvise og kvantificere latent smitte af Phoma- og Fusariumråd. • Testen tager 2 uger for Fusarium og 6-9 uger for Phoma. • Det vil antageligt være muligt at udvikle en hurtigere test baseret på real-time PCR, men det vil kræve et stort udviklingsarbejde. • Anvendelse af kunstige næser vurderes til ikke at være velegnet til at påvise latent smitte. Ministeriet for Fødevarer, Landbrug og Fiskeri Danmarks JordbrugsForskning