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Complessi d'inizio. IRES di EMCV. IRES di HCV. eIF3. 40S. Fattori necessari per la traduzione. IRES di CrPV. Sequenze IRES virali. IRES negli mRNA cellulari. Strutture secondarie delle IRES. Fattori trans-agenti delle IRES. Ruolo delle IRES. Meccanismi di traduzione negli eucarioti.
E N D
IRES di HCV eIF3 40S
Regolazione della traduzione • generale • specifica
Meccanismi virali d'inibizione della fosforilazione di eIF2a
Regolazione eIF2a • Fosforilazione su ser 51 in risposta a stress da parte di 4 chinasi: PKR, GCN2, PERK, HRI • La fosforilazione impedisce il riciclo da parte di eIF2B • La traduzione di alcuni mRNA è stimolata da bassi livelli di eIF2a attivo • Molti virus hanno sistemi per impedire la fosforilazione di eIF2a
Regolazione eIF4E • Fosforilazione su ser 209 da parte di Mnk1 (e Mnk2) correlata con attivazione • Mnk interagiscono con eIF4G e sono attivate dalla via delle MAP chinasi • Doppio KO per Mnk1 e 2 è normale • eIF4E è inibito dall’interazione con 4E-BP (1, 2 e 3) • 4E-BP sono inibite da fosforilazione dipendente dalla via di mTOR
Regolazione della traduzione • generale • specifica
Transcriptional control Translational control gene mRNA protein • Slow • Lasting • Transcription-dependent • Rapid • Short-lived • Transcription-independent
Indicazione di controllo traduzionale northern western +Fe -Fe +Fe -Fe mRNA ferritina ferritina actina mRNA actina
METODI PER STUDIARE IL CONTROLLO TRADUZIONALE • Confronto tra la variazione della quantità di mRNA e quella del prodotto proteico • gel poliacrilammide 2D (DIGE) • western blot • Analisi della stabilità delle proteine mediante l'uso di inibitori della traduzione • Analisi della quantità di mRNA sui polisomi (distribuzione)