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Elisa: quantificação de proteínas e moléculas. Elisa: quantificação de proteínas e moléculas. Sistema Duplo-Híbrido de Levedura. Sistema Híbrido-Simples: identificar proteínas que ligam ao DNA. Sistema Híbrido-Simples. Sistema Híbrido-Simples. Sistema Híbrido-Simples.
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Sistema Híbrido-Simples: identificar proteínas que ligam ao DNA
1. Reagents interacting with DNA* (a) Alkylating agents: Dimethyl sulphate, Mitomycin C, Nitrogen and sulphur mustards (b) Intercalating agents: Acridine dyes, Actinomycins, Adriamycin, Anthracenes Benzpyrene, Ethidium bromide, Propidium diiodide (c) Intertwining agents Distamycin, Netropsin 2. Analogues of bases, Acyclovir ,Adenine /3‑1‑D‑arabinoside, Amethopterin Aminopterin, 2‑aminopurine, Aphidicolin, 8‑azaguanine, Azaserine 6‑azauracil, 2'azido‑2'‑deoxynucleosides, 5‑bromodeoxycytidine Cytosine /3‑1‑D‑arabinoside, Diazooxynorleucine, Dideoxynucleosides 5‑fluorodeoxycytidine, 5‑fluorodeoxyuridine, 5‑fluorouracil, Hydroxyurea 6‑mercaptopurine 3. Inhibitors of topoisomerases: Coumericin, Nalidixic acid, Novobiocin, Oxolinic acid 4. Inhibitors of cell division: Colcemid, Colchicine, Vinblastine , Vincristine 2nd messengers/inhibitors dibut cA/GMP: [active] 1mM, Sigma B1381 Ca ionophore: [active] 5mM, Sigma 7272 PMA: [active] 10mM, Froskolin: [active] 10mM, Protein synthesis inhibitors cycloheximide: [active] 20mM, Boe 103675 chloramphenicol: [active] 100mM, Sigma anisomycin: [active] 60mM, Sigma A9789
Actina F nas células da pele do bulbo da cebola: transformação transiente utilizando A actina fundida a proteína gfp Ela está presente nas invaginações e envolta do núcleo
Reconstrução tridimensional da topologia do retículo endoplasmático Nas plantas transgênicas expressando gfp
Planta transgênica Câmera CCD para fluorescencia::: superimposição de imagens Promotor da GA20 ox fundido ao gene da luciferina Pulverização com luciferina
Aequoporina: Estudo das alterações na Concentração de cálcio In vivo e em tempo real, Por um método não-destrutivo
Frio: “manchas” de aumento de calcio em resposta a baixas temperaturas
Efeito Luz vermelha:::protoplasto de folha de trigo:::Fluro-3:::tempo após adição do fluoróforo Tempo após redução do Ca2+ do meio e o citosólico e fechamento do estômato Fluoróforo indo-1 Efeito do GA e do ABA nos níveis de Ca2+ em protoplastos da camada de aleurona da cevada Fura2:::gradiente de Ca2+ citosólico:::abundância canais de calcio na extremidade Fluoróforos utilizados para medir a [Ca2+] intracelular Tipos: 1) Fuoróforos monovalentes (single-wavelenghth dyes): continuam a ter a fluorescência no mesmo comprimento de onda Fluorescência dependente da [fluoróforo]: determinação semi-quantititiva do Ca2+: Ex: fura-3 e “calcio-verde”:semi-quantitativos, precisam de luz de menor intensidade (menos dano) 2) Fuoróforos polivalentes (ratio dyes): mudam o comprimento de onda da fluorescência quanto excitados Fluorescência independente da [fluoróforo]: precisão na determinação do Ca2+: Ex: fura-2 e indo 1 (polivalentes):precisão na determinação do Ca2+: precisam maior intensidade luminosa (maior dano;experimentos mais curtos)
Estudo da expressão diferencial dos genes: Confecção de Bibliotecas de Subtração
Checando a eficiência da subtração
Confirmando a presença de uma proteína em um compartimento citosólico
Hibridização in situ: FISH (Fluorescent In Situ Hybridization) Mapeamento de genes Estudo da estrutura do cromossoma Estudos citogenéticos: translocação, recombinação, etc.
Efeito da liberação do ABA “enjaulado” após microinjeção em células-guarda Manipulação de cálcio Enjaulado: calcio controla a orientação de crescimento do tubo polínico (crescimento só no ápice) Manipulação de substâncias ativas “enjauladas” (caged) Nucleotídeos Queladores Mensageiros secundários Peptídeos Canais de Ca2+ que Respondem ao IP3 no estômato, pólem, etc.
Phiscomitrella GFP-talina
Estudo da Estrutura de um promotor 1) Análise por deleção
Estudo da Estrutura de um promotor 2) Análise por mutagênese
Estudo da Estrutura de um promotor 3) Análise por transativação