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FORMATION SUR : PubMed. Préparé par Diane Sauvé, B. Sc., M. Bibl. Avril 2014. PUBMED . Allez au: sdis.inrs.ca A gauche, cliquez dans Bases de données Dans la case Titre, écrivez Pubmed puis cliquez sur Go Cliquez sur Pubmed. PUBMED.
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FORMATION SUR : • PubMed Préparé par Diane Sauvé, B. Sc., M. Bibl. Avril 2014
PUBMED Allez au: sdis.inrs.ca A gauche, cliquez dans Bases de données Dans la case Titre, écrivez Pubmed puis cliquez sur Go Cliquez sur Pubmed
PUBMED • Débuté en 1996 et comprend +23.6 millions de références • + vieilles références de PubMed date de 1809 • 5 sources de références: accès gratuit à Medline, PubMed, PubMed-as supplied by publisher, PubMed-in process and PubMed-OldMedline • Banque de données de références contenant principalement des articles de périodiques dans le domaine des sciences de la vie mais aussi des livres et des rapports qui se retrouvent dans les rayonnages du NCBI • Comprend 2.5 milliards de recherches en 2013 dans Medline/Pubmed • Développé et maintenu par la National Center for Biotechnology Information (NCBI) à l’U.S. National Library of Medicine (NLM)
PUBMED : MEDLINE • Principale partie de PubMed avec + de 21 millions de références • Sujets couverts par MEDLINE : biomédecine et santé, sciences de la vie, sciences comportementales, chimie, et bioingénierie • Depuis 2005, entre 2,000-4,000 références complètes avec leurs MeSH sont ajoutées chaque jour du mardi au samedi • +735,000 références indexées en 2013 • Débute en 1946
PUBMED : MEDLINE • Petit nombre de journaux, de magazines, de bulletins et 5,652 titres de périodiques internationaux (Novembre 2013) • Périodiques en 39 langues (60 langues pour les vieux périodiques) • Références ajoutées pour la période 2010-2012: • environ 93% sont publiés en anglais • environ 84% ont un résumé en anglais écrit par les auteurs des articles
PUBMED : AUTEUR • Entrez le nom de famille suivi d’un espace puis les 2 premières initiales du prénom sans ponctuation suivi d’un espace et mettre les filiations (ex. Vollmer Charles Jr) • PubMed tronque automatiquement un recherche de nom d’auteur, ex.: • o'brien [au] = o'brien ma, o'brien kr, o'brien d • o'brien j [au] = o'brien ja, o'brien jb, o'brien jc jr, o'brien j • Pour désactiver la troncature automatique: mettre le nom de l’auteur entre guillemets suivi de [au]
PUBMED : AUTEUR Estimation de plus de 2880 noms d’auteurs http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24476258
PUBMED : AUTEUR PUBMED : AUTEURS PUBMED : AUTHORS 2 1 3
PUBMED : AUTEUR Le nom complet de l’auteur peut être recherché pour la référence publiée depuis 2002 si le nom de l’auteur apparaît au complet dans l’article
PUBMED : AFFILIATION DE L’ AUTEUR Auteur, auteurs d’entreprise et les affiliations des collaborateurs (24 décembre 2013) En vigueur depuis le 16 décembre 2013, la NLM met maintenant les affiliations d’auteurs pour tous les auteurs, les auteurs d’entreprise et les auteurs collaborateurs dans Pubmed si les données sont fournies par les éditeurs dans leurs soumissions XML pour les périodiques indexés dans Medline
PUBMED : PÉRIODIQUE Entrez le nom au complet du périodique ou son abréviation.
PUBMED : TERMES RETENUS Latent membrane protein 1 LMP 1 Epstein-Barr virus Apoptosis B cells A AND B AND C AND D
PUBMED : RECHERCHE AVANCÉE 1 2 Sélectionner les expressions que vous désirez 3 4
PUBMED : HISTORIQUE 1 Cliquez bouton gauche 2
PUBMED : HISTORIQUE Latent membrane protein 1 Latent membrane proteins 1 Latent membrane protein1 Latent membrane proteins1 Aucun résultat Latent membrane protein* AND 1
PUBMED : RECHERCHE AVANCÉE Si vous choisissez cette stratégie, vous n’aurez pas de MeSH Provient du: Show index list
PUBMED : MeSH - DESCRIPTEURS • MeSH : Medical Subject Headings • Vocabulaire contrôlé qui est utilisé pour indexer les articles de Medline • Publié depuis 1954 • Les termes du MeSH sont structurés hiérarchiquement (arborescence) par catégories de sujets avec des termes spécifiques qui sont sous des termes génériques • Mise à jour hebdomadaire avec une révision annuelle • MeSH bilingue anglais-français, anglais-suédois et trilingue anglais-espagnol-portugais: HTTP://mesh.inserm.fr
PUBMED : MeSH - DESCRIPTEURS • Donne un résultat de recherche plus complet car il enlève le problème des variations orthographiques, des synonymes et des quasi-synonymes • Donne une plus grande précision en utilisant le descripteur majeur ( MeSH major topic) • Permet de spécifier des aspects particuliers d’un descripteur en utilisant des qualificatifs • Cependant les rérérences qui portent le statut “PubMed-in process” et “PubMed- as supplied by publisher” ou Pubmed ne sont pas retrouvées car elles n’ont pas encore reçu ou n’auront pas de descripteurs • Cependant si la recherche porte sur un nouveau sujet ou ou un sujet très pointu, il se pourrait que vous ne trouviez pas de descripteur ou bien que vous trouviez un descripteur trop générique
PUBMED : MeSH • Le vocabulaire du MeSH comprend 4 types de termes: • Descripteurs • Qualificatifs • Types de publication • Concepts supplémentaires
PUBMED : MeSH - DESCRIPTEURS Le MeSH 2014 comprend 27 149 descripteurs [MeSH Headings] répartis dans les 16 catégories thématiques : Anatomie [A] Organismes [B] Maladies [C] Produits chimiques et pharmaceutiques [D] Techniques et équipements analytiques, diagnostiques et thérapeutiques [E] Psychiatrie et psychologie [F] Phénomènes et processus [G] Disciplines et professions [H] Anthropologie, enseignement, sociologie et phénomènes sociaux [I] Technologie, industrie et agriculture [J] Sciences humaines [K] Sciences de l'information [L] Groupes individualisés [M] Soins de santé [N] Caractéristiques d'une publication [V] Lieux géographiques [Z]
PUBMED : MeSH - DESCRIPTEURS MeSH : Les analystes examinent chaque article et leur donnent les descripteurs les plus spécifiques avec des qualificatifs, si nécessaire. Chaque article reçoit entre 10 et 12 descripteurs [mh] or [MeSH] 11 MeSH
PUBMED : MeSH 3 1 2
PUBMED : MeSH - CONCEPTS SUPPLÉMENTAIRES • Anciennement: “Supplementary chemical records” • 219,266 descripteurs • Utilisé pour indexer les produits chimiques, les médicaments et les autres concepts comme les maladies rares dans Medline • Recherché avec “Substance name” [NM] • Pas d’arborescence • Mise à jour hebdomadaire
PUBMED : HISTORIQUE #7 #6 #9 #5 #4 #8
PUBMED : HISTORIQUE Try: Epstein Barr viruses
PUBMED : MeSH - QUALIFICATIFS Qualificatifs (subheadings) : sont utilisés pour aider à décrire plus complètement un aspect particulier du sujet. Les qualificatifs sont logiquement associés au descripteur 2 lettres peuvent être utilisées pour nommer le qualificatif Qualificatifs
PUBMED : STRATÉGIE DE RECHERCHE Pathogénicité du virus Epstein-Barr = ( A AND B) OR C A C B Epstein-Barr virus EBV … Herpesvirus 4, Human/Pathogenicity • Pathogen*