280 likes | 488 Views
Detektion af HIV med hhv. ELISA og GPAT (gelatin partikel agglutinations test). Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH. Disposition:. Teori: Retrovirus/Lentivirus ELISA GPAT Materiale/Metode: Kriterier Gennemgang af PubMed søgning
E N D
Detektion af HIV med hhv. ELISA og GPAT (gelatin partikel agglutinations test) Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Disposition: Teori: Retrovirus/Lentivirus ELISA GPAT Materiale/Metode: Kriterier Gennemgang af PubMed søgning Præsentation af artikler Resultater: Resultatskema Diskussion: Konklusion: Statistik i Danmark: Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Problemformulering: ”Hvilken af de to følgende tests, gelatin partikel agglutinationstest (GPAT) eller ELISA, opnår den højeste specificitet, sensitivitet og er mest økonomisk til at påvise HIV antistoffer i blodet?" Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Teori Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
HIV-familie: (Human Immunodeficiency Virus) • Retrovirus (-viridae): • RNA-virus. • Danner revers transcriptase. • RNA DNA. • Enzym integrase. • DNA integreres i cellens eget DNA. • Produktion af nye viruspartikler. • ”Skjuler” sig for immunforsvaret. http://www.bioquest.org/bedrock/ problem_spaces/hiv/ Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
HIV-art: • Lentivirus: • Gruppe af såkaldt kompleks retrovirus. • Effektivt til at inficere: • Ikke-delende celler • Delende celler. • HIV udvikler sig hurtigt: • Ved at mutere og derved ændre udseende Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
ELISA:(Enzym-Linked Immunosorbent Assay) • Bruges til påvisning af antistoffer. • Efter 3 måneder • Påviser anti-p24 • Direkte sandwich • Coatning af brønd med primært antistof. • Blokering. • Prøve tilsættes. • Antistofkonjugat tilsættes. • Substrat tilsættes. • Reaktion stop. • Absorbans måles. http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/ BiologyPages/E/Elisa.html Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
GPAT: Binding mellem antigener og antistoffer. Bindes til en partikel (latex). Specifikke antigen-antistofbindinger. Styrken af bindingerne og hastigheden afh. mængden af antistof. Foretages manuelt. Der kan foretages en rensning af serum. Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Materiale og metode Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Materiale og metoder: • Søgemaskiner: • PubMed • SweMed+ • EMBASE • Web of Science • Blackwell Synergy • Scirus • Google scholar • Kriterier: • Maksimalt 10 år gamle • Metodesammenligning mellem GPAT og ELISA eller anden metode • Søgning foretaget to gange • Søgte efter citerende artikler Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
PMID: 14562593Titel: Validation of a simple …Forfatter: Mashange et al, 2003 Søgeord: ”HIV and ELISA”Resultater: 2406 poster, 72 reviews.Handling: Max 10 år gamle. Søgeord: ”HIV and ELISA and GPAT”Resultater: 1 post.Handling: Max 10 år gamle. Eks. på søgning i PubMed: Søgeord: ”HIV”Resultater: 109270 poster, 14184 reviews.Handling: Max 10 år gamle. Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Hele søgningen i PubMed: Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Præsentation af artikler: • Metode sammenligninger: • Mashange et al: GPAT vs. ELISA • Poljak et al: GPAT vs. EIA og Western Blot • Huang et al: GPAT vs. ELISA og Western Blot • Hong et al: Fortynding af GPAT vs. ufortyndet GPAT Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Præsentation af artikler: • Andre artikler: • Frank et al: HIV-hjemmetest i USA. • Goodstein, J: HIV-hjemmetest i Danmark. Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Resultater Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Metode: Mashange et al: Partiklerne er coatede med HIV-1 Ag 5 ml blod opsamles Prøverne blandes Aflæses dagen efter Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Metode: Poljak et al: • 3 forskellige coatninger • Prøverne tilblandes partiklerne i 3 brønde • Aflæses efter 2 timer Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Metode: Huang et al: • Partiklerne er coatede med HIV-1 Ag • Tilsæt 20 µl af prøve • Fortynd 2-fold • Aflæses efter 2 timer Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Metode: Hong et al: • Modificering (S/LS) • Forskellige fortyndinger anvendt • Partiklerne coatede med HIV-1 Ag • Forskellige kriterier for hvert forsøg • Kontrol på positive prøver • Aflæses efter 6-48 timer Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Resultater: Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Diskussion Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Poljak et al vs. Mashange et al: Hvorfor mindre usikkerhed på Poljak et al resultater i forholdet i Mashange et al? Antal prøver Poljak et al 3311 Antal prøver Mashange et al 379 Poljak et al 1 falsk positivt resultat Mashange et al 2 falsk positive resultater Poljak et al specificitet 99,97 % Mashange et al specificitet 99,2 % Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Huang et al vs. Poljak et al: • Forskellen mellem Huang et al vs. Poljak et al: • Huang et al fik i GPAT 10 falsk positive resultater • Poljak et al kun 1 falsk positivt resultat • Årsagen er ulemper ved GPAT • Huang et al specificitet 95,0 % i GPAT (antal prøver 565) • Poljak et al specificitet 99,97 % i GPAT (antal prøver 3311) Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Huang et al vs. Poljak et al: • Huang et al fik i GPAT 1 falsk negativt resultat • Poljak et al fik 0 falsk negative resultater • Årsagen er ulemper ved GPAT • Huang et al sensitivitet 99,5 % GPAT • Poljak et al sensitivitet 100 % GPAT • Huang et al specificitet 21,6 % i ELISA • Høj-risiko gruppen • Årsagen kan være ELISA’s affinitet Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Mashange et al vs. Huang et al: • Forskellen i Mashange et al og Huang et al resultater skyldes de tidligere nævnte årsager: • Antal prøver (Mashange 379, Huang 565) • Falsk positive og falsk negative resultater Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Konklusion: GPAT er ligeså sensitiv som ELISA. Vi kan ikke sige om GPAT er ligeså specifik som ELISA. GPAT er billigere end ELISA. Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Statistik i Danmark: • Pris for ELISA: ca. 150.000 prøver gange ca. 300 kr. = 45.000.000 kr. • Pris for GPAT: ca. 150.000 prøver gange ca. 20 kr. = 3.000.000 kr. Besparelse ved GPAT: 42.000.000 kr. www.ssi.dk Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.
Camilla H., Thomas L., Nadia M. & Emel K. 5. semester projekt Bioanalytikeruddannelsen KBH.