130 likes | 320 Views
Lehninger Oppgave nr. 7 c)-f) s. 42. Phosphoryl Carboxyl Aldehyde Amino Amido Methyl Hydroxyl. c) Phosphoenolpyruvat d) Threonin. e) Pantothenat f) N-glucosamin. Lehninger Oppgave nr. 8 s. 42. angir det (eneste) chirale senteret til isoproterenol.
E N D
Lehninger Oppgave nr. 7 c)-f) s. 42 Phosphoryl Carboxyl Aldehyde Amino Amido Methyl Hydroxyl c) Phosphoenolpyruvat d) Threonin e) Pantothenat f) N-glucosamin
Lehninger Oppgave nr. 8 s. 42 • angir det (eneste) chirale senteret til isoproterenol. • D-isomeren kan interagere med biologisk reseptor (protein). L-isomer binder ikke på grunn av annen stereoisomeri.
Lehninger Oppgave nr. 6 s. 113 a) • Chiralt senter • Mulighet for sammensetning rundt et atom til to former som er speilvendte av hverandre • Karbonatom bundet til fire ulike grupper • Antall chirale sentre = 2 b) • Antall chirale sentre = 2 • 2n der n er chirale sentre • 22 = 4 dvs. fire stereoisomere
Lehninger Oppgave nr. 8 s. 113 • 682 aminosyrer • Gjennomsnitts molekylvekt er 128 g/mol • Mister vann ved dannelse av peptidbinding, 18,6/mol • Ny snittvekt er 128 – 18 = 110 g/mol • 682 * 110 g/mol = 75 020 Da dvs. 75 kDa
Del I Oppgave 1 a) b) +1 pKa1 0 pKa2 -1 pKa3 -2 • Glutamat: pI = (pKa1 + pKa2) / 2 = 2,2 + 4,3 / 2= 3,25 c) HA A- + H+ Start: 1 0 0 Likevekt: 1-x x x pH = pKa + log([A-]/[HA]) 9,7 = 9,7 + log(x/1-x) x = 0,5 Nettoladning: -1(1-x) + -2(x) = -1(1-0,5) + -2(0,5) = -1,5
Del I Oppgave 2 a) +2 pKa1 +1 pKa2 0 pKa3 -1 b) pI = (pKa2 + pKa3) / 2 = 8,95 + 10,53 = 9,74
V01 Oppgave I A 1. pI = (pKahis + pKaNH3) / 2
2. • Hvilke likevekter gjelder? pI = (pKahis + pKaNH3) / 2 • pI = (6 + 9) / 2 = 7,5 3. • Det er 82 hydrofobe og 11 hydrofile aminosyrer i proteinet. Proteinet er hydrofobt. Integrerte membranproteiner er hydrofobe. Perifere membranproteiner er assosiert til membranen, men er i et hydrofilt miljø og er derfor hydrofile. Ut i fra aminosyre sammensetningen er dette er integrert membranprotein.
V00 Oppgave I B 1. 2. Cystein Tyrosin H O H
4. Overvekt av sure sidegrupper som blir negativt ladet ved avgivelse av H+. Proteinet har derfor pI lavere enn 7 og er surt. 3. Serin Strukturelt lik og polar sidekjede
H00 Oppgave 1 I A: met-leu-leu-ile-ile-val-val-phe-ile-ile-leu-ala-ile-phe-gly B: cys-ser-lys-asn-gln-lys-lys-arg-lys-arg-arg-lys-thr-his C:ser-asp-cys-asp-ser-thr-gly-asn-gln-glu-glu-glu-ser-asn D: met-ile-ala-phe-val-ala-ile-leu-val-ile-leu-ala-ile-val-ala-val E: asp-thr-glu-asp-glu-gly-glu-glu-asp-asp-thr-ala-glu-asp-ser Overflate = hydrofil Indre = hydrofob
V00 Oppgave 1 A 4. Lys-Ala vs Val-Ala pH 7 Polaritet og ladning? + Arg-Leu vs His-Leu ved pH 8 Polaritet og ladning? + Asp-Ile ved pH 2 vs Asp-Ile ved pH 7 Polaritet og ladning? -