120 likes | 357 Views
Efteruddannelse i Bioteknologi. Kursus A Genomisk DNA. Kursus indhold. Isolering af genomisk DNA. Dyrk eller indsaml celler/væv Riv væv og lyser celler med kemiske, enzymatiske eller fysiske metoder Fjern cellerester Fjern resterende proteiner Isoler gDNA Koncentrer DNA
E N D
Efteruddannelse i Bioteknologi Kursus A Genomisk DNA
Isolering af genomisk DNA • Dyrk eller indsaml celler/væv • Riv væv og lyser celler med kemiske, enzymatiske eller fysiske metoder • Fjern cellerester • Fjern resterende proteiner • Isoler gDNA • Koncentrer DNA • Analyser for koncentration og renhed
Lysis af celler • Lysisbuffer: • Buffer (puffer) • EDTA • Detergent • SDS • Sarcocyl • Triton X-100 • CTAB (cetyl trimethyl ammonium bromid) • PVP (polyvinylpyrrolidon) • Protease • RNAse
Isolering af DNA Silica-baseret isolering Silica Diatomert jord Glas Glasfiberfilter Chaotropisk salt Guanidinium hydrochlorid Guanidinium thiocyanat Natriumiodid Natriumperchlorat Ammoniumsulfat Vaskeopløsning KPO4 pH 8.0 + 80% EtOH
Isolering af DNA • Ionbytning på minikolonne • Ekstraktion med organisk opløsningsmidler • Phenol • Phenol/chloroform • Chloroform • Diethylether
Koncentrering af DNA opl. • Fældning • pH 4 • Høj [salt] • NaCl • KAc • NaAc • Ethanol eller isopropanol • -20°C
Koncentration og renhed • Koncentration • Absorbans ved 260nm (OD260 ≈ A260) • A260 = 1 => [DNA]= 50µg/mL • Renhed • A260:A280 = 1,8 => rent DNA • A260:A280 < 1,8 => DNA forurenet med protein • A260:A280 > 1,8 => DNA forurenet med RNA
Gennemgang af forsøgsvejledning Se i mappen