160 likes | 389 Views
Biologické funkcie a aktivácia TAM receptorov tyrozín kinázy. ________________________________________________________________________________________________________________________________ Linger , R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83.
E N D
Biologické funkcie a aktivácia TAM receptorov tyrozín kinázy ________________________________________________________________________________________________________________________________ Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83. Marek Ondruš, 3BX-ORBO, ondrus.uniba@gmail.com, 26.11.2013
OBSAH • Molekulárna biológia • Receptory TAM • Ligandy Gas6 / Proteín S • Komplex [proteín-ligand] • Aktivácia receptorov • Nomenklatúra • Expresia • Signálne dráhy receptorov TAM • Regulácia aktivity
Štruktúrna podobnosť receptorov rodiny TAM (A) s adhéznymi molekulami nervových buniek (NCAM) • odlišné na základe sekvencie KW (I/L) A (I/L) ES • 2 IG a 2 FNIII domény, dôležité pre bunkový kontakt • podobné funkcie s MET rodinou • gény receptorov 3 – 5 kb • podobnosť genomickej štruktúry Tyro-3/Axl • 31-36 % zhoda AMK, 54-59 % zhoda sekvenie TAM receptorov • _____________________________________________________________________________________________________________________ • Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83. • http://en.wikipedia.org/wiki/File:Protein_NCAM1_PDB_1epf.png • http://www.esrf.eu/files/live/sites/www/files/decouvrir/quelques-resultats/chimie/NCAM.jpg
Štruktúra ligandov (B) a väzba [proteín-ligand] (C) • B) Štruktúra ligandov • C)2:2 izomérny komplex [proteín- • ligand] zloženýz 2 LG a 2 Ig domén: • I (pohľad zboku) • ii (pohľad zhora) • odlišené trombínovým štiepnym • miestom • žiadne interakcie protein-protein, • receptor-receptor • _____________________________________________________________________________________________________________________ • Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83.
Komplex [proteín-ligand] _____________________________________________________________________________________________________________________T. Sasaki et al. The EMBO Journal (2006) 25, 80–87.Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83. C • E) Pohľad zhora F) pohľad zboku
Kontakty v komplexe [proteín-ligand] _____________________________________________________________________________________________________________________T. Sasaki et al. The EMBO Journal (2006) 25, 80–87. LG1 (Gas6) / Ig 1 (Axl) = majoritný kontakt LG1 (Gas6) / Ig 2 (Axl) = minoritný kontakt
Spôsoby aktivácie TAM receptorov - ligandovo nezávislá dimerizácia - ligandovo závislá dimerizácia - heterodimerizácia dvoch rôznych receptorov rodiny TAM - heterodimerizácia s receptorom inej rodiny - trans-bunková väzba extracelulárnych domén • _____________________________________________________________________________________________________________________ • Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83.
Proteín S vz. Gas6 • Proteín S: • ligand pre ľudský Tyro-3 • ligand pre myšací Tyro-3 a Mer • zdiela s Gas6 43 % zhodu sekvencie AMK • obsahuje trombínové štiepne miesta • Gas6: • ligand pre ľudské Axl, Tyro-3 aj Mer • _____________________________________________________________________________________________________________________ • http://en.wikipedia.org/wiki/File:Protein_PROS1_PDB_1z6c.png • http://en.wikipedia.org/wiki/File:Protein_GAS6_PDB_1h30.png
Nomenklatúra receptorov TAM Axl – „anexelekto“ (nekontrolovateľné) – „UFO“ (neznama funckia proteinu) • _____________________________________________________________________________________________________________________ • Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83.
Expresia v ľudských rakovinách • _____________________________________________________________________________________________________________________ • Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83.
Signálne dráhy receptora Axl • _____________________________________________________________________________________________________________________ • Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83.
Signálne dráhy receptora Mer • _____________________________________________________________________________________________________________________ • Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83.
Signálne dráhy receptora Tyro-3 • _____________________________________________________________________________________________________________________ • Linger, R. M. A.; Keating, A. K.; Earp, H. S.; Graham, D. K. Adv Cancer Res. 2008, 100, 35-83.