140 likes | 277 Views
DNA baseret taksonomi?. International Commission on Zoological Nomenclature (ICZN). International Association for Plant Taxonomy (IAPT). Digital information og dermed mere objektive karakterer Sekvenser forbliver med arten uden hensyn til navngivning Værdigfuld for fylogenetiske undersøgelser.
E N D
International Commission on Zoological Nomenclature (ICZN) International Association for Plant Taxonomy (IAPT)
Digital information og dermed mere objektive karakterer • Sekvenser forbliver med arten uden hensyn til navngivning • Værdigfuld for fylogenetiske undersøgelser
DNA Taksonomi System • A. Ekstraheret DNA som arts reference • en eller flere regioner er amplificeret og sekvenseret • resulterende sekvens(er) som standard og ID for arten • B. DNA sekvens database over arterne • navngivning efter numre som refererer til databasen og ikke arten • allerede navngivet arter skal inkluderes
Hvad er der brug for? • Etablering af et udvalg som er ansvarlig for den videnskabelig udførelse af DNA taksonomien • Valg af sekvens(er) • Etablering af nummer og opbevarelses system • Etablering og kontrol af regler for kvalitets bedømmelse og data base forvaltning
Hvad er der brug for? • 2. Udvikling af ny database og software dedikeret til DNA taksonomi • Opbygget som andre taksonomiske databaser med morfologisk, biogeografisk og økologisk information samt relevante litteratur henvisninger • Integreret i nuværende taksonomiske systemer med DNA sekvenser som universal reference
5. Identificere pilot projekter til at hurtigt få informationer i databasen • Start med igangværende projekter Hvad er der brug for? • 3. Etablere faciliteter som er dedikeret til sekvensering af DNA og indtastning af data i databasen • Reduceret omkostninger for forskere uden adgang til sekvenseringslaboratorier 4. Etablere DNA opbevaringsfaciliteter og en standard for DNA kollektioner
“…we feel that a DNA-based taxonomy along the suggested lines would catastrophically retard taxonomic activity, and it would certainly not relieve the need for many more taxonomists…”
DNA fra kun et individ Men hvilke område skal sekvenseres? Fremtidig forandringer? ’Type specimens’ skal destrueres Dyrt og centraliseret Brug det hellere som en ny klasse af karakterer
“To relegate taxonomy, rich in theory and knowledge, to a high-tech service industry would be a decided step backward for science.”
“When species descriptions are based on a broad range of data, they become interesting scientific hypotheses making explicit predictions about the distribution of attributes among organisms. …when nothing is known about organisms except their DNA, there are no evolutionarily interesting patterns to explain – just a tedious pattern of sequence similarity.”