1 / 14

Aivars C īrulis, LU BF 3. kurss

Aivars C īrulis, LU BF 3. kurss. Vidējo Austrumu elpošanas sist. s indroms (MERS). Nesen aprakstīta cilvēku slimība, pirmoreiz aprakstīta Saūda Arābijā 2012. gada septembrī. To izraisa betakoronavīruss (MERS- CoV ).

dot
Download Presentation

Aivars C īrulis, LU BF 3. kurss

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Aivars Cīrulis, LU BF 3. kurss

  2. Vidējo Austrumu elpošanas sist. sindroms (MERS) • Nesen aprakstīta cilvēku slimība, pirmoreiz aprakstīta Saūda Arābijā 2012. gada septembrī. • To izraisa betakoronavīruss (MERS-CoV). • Līdz 12.09.2013. ir konstatēti 114 infekcijas gadījumi ar 54 nāves gadījumiem. • Visi saslimšanas gadījumi saistīti tikai ar 4 valstīm (Saūda Arābiju, Jordāniju; Kataru; Apvienotajiem Arābu Emirātiem).

  3. Simptomi: • drudzis, • klepus, • elpastrūkums, • krēpas. Izteikti samazinājies plaušu tilpums, “plankumi”.

  4. Betakoronavīruss(MERS-CoV) • Pieder koronavīrusudzimtai. Koronavīrusi inficē putnus un zīdītājus. Tie ir fenotipiski un genotipiski daudzveidīgi. Vīrusu daudzveidību un ātro evolūciju nosaka tas, ka revertāze pieļauj daudz kļūdu, RNS rekombinācija un salīdzinoši lielais genoms (> 30 000). • Evolucionējot vīrusi ieņem jaunas ekoloģiskās nišas un saimniekorganismus. Novērojami zoonotiski gadījumi. • (+)ssRNS vīruss. • Evolūcijas ātrums: 6,3*10-4 uznukleotīdu gadā. • Veids un dzīvnieks, no kura cilvēks ir inficējies, nav zināms. Taču filoģenētiskās analīzes liek domāt, ka SARS-CoV tika mantots no sikspārņiem.

  5. S proteīns

  6. Metodes • Genoma sekvenēšana un molekulārā epidemioloģija ir svarīga, jo ļauj noskaidrot, vai ir noticis viens zoonotisks gadījums un tālāk šis vīruss ir izplatījies cilvēku starpā, vai šie zoonotiskie gadījumi ir notikuši vairākkārt dažādās vietās. • Skrīnings ar RT-PCR (upE un ORF1A) • 50 µl NS tikaiegūtano 200 µl no traheālāaspirātavainazofaringālās vai rīklesuztriepes. • Svītrkodēto bibliotēku veidošana ar Illumina. • Filoģenētiskās analīzes. 13 pilni genomi un 8 (>32%) tika salīdzināti ar 9 iepriekš publicētajiem genomiem.

  7. Filoģenēze

  8. Pārnešanas (transmisijas)analīzes

  9. Ģeogrāfiskais novietojums

  10. Nobeigums • Šis ir pagaidām lielākais pētījums (paraugu skaits). • 2012. gada oktobrī Rijādā bija sastopami vismaz 2 šī vīrusa celmi. • Pētījums atklāj gan cilvēka-cilvēka transmisiju, gan vairākus sporādiskus zoonotiskus gadījumus. Al-Hasa cilvēka-cilvēka transmisija ar sākotnēju zoonotisku gadījumu. • Rijādā pastāv 3 vīrusa celmi. Šo daudzveidību pētījuma autori skaidro ar cilvēku migrāciju uz Rijādu no attālākiem Saūda Arābijas reģioniem un kaimiņvalstu (galvaspilsētām). • Visu jauno MERS-CoV S proteīns atšķiras no labi izpētītā EMC/2012 1020. kodonā. Kā arī Munich/AbuDhabi/2013 satur histidīnu, kamēr visi Saūda Arābijas paraugi satur arginīnu šajā kodonā.

More Related