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Voies de dissémination des E. coli

Phénotypes et génotypes de la résistance aux antibiotiques chez Escherichia coli d’origine animale en Tunisie : Multirésistance des isolats aviaires, fond génétique riche et hétérogène

evelyn
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Voies de dissémination des E. coli

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Presentation Transcript

  1. Phénotypes et génotypes de la résistance aux antibiotiques chez Escherichia coli d’origine animale en Tunisie : Multirésistance des isolats aviaires, fond génétique riche et hétérogène Dhifalli Rym1, Kilani Hajer1, Yolanda Saénz2, Mansouri Riadh1, Mehri Wahib1, Ben Chehida Noureddine1, Abbassi Mohamed Salah1 1Laboratoire de recherche de bactériologie, Institut de la Recherche Vétérinaire de Tunisie, Bab Saadoun, Tunis, Tunisie. 2Unidad de Microbiología Molecular, Centro de Investigación Biomédica de La Rioja, Logroño, Spain

  2. Voies de dissémination des E. coli

  3. LE TRANSFERT DE LA RESISTANCE Traitements et prophylaxie Médecine vétérinaire Médecine humaine Communauté Additifs dans l’alimentation des animaux Hôpital Agriculture Protection des plantes Environnement Utilisation industrielle

  4. Etude de la résistance aux antibiotiques chez: Volaille, Bovin, Ovin Etude des gènes codant la résistance aux sulfamides et à la tétracycline OBJECTIFS Prévalence et caractérisation des structures des intégrons

  5. Matériel & méthodes Sites de prélèvements

  6. Matériel & méthodes 148 isolats de E. coli Antibiogramme • Isolement sur milieu MacConkey • Identification par Mini Galerie des Entérobactéries et Api20E (Bio-Mérieux) Extraction de l’ADN S R I PCR

  7. 3-Détection des gènes de résistance aux antibiotiques: tétracycline : tet(A), tet(B), tet(C) sulfonamides : sul1, sul2, et sul3 4- Etude des intégrons: a- Détection de la présence des integrons de classe 1 et de classe 2 (intI1 + intI2) b- Structures des régions variables des intégrons Cassette de gène Intégrase Promoteur attC qacEΔsul1 amorce anti-sens amorce sens

  8. Matériel & méthodes Relations génétiques des isolats PFGE Digestion enzymatique par XbaI Analyse des pulsotypes selon les critères de Tenover et al, 1995.

  9. Résultats Résistance aux antibiotiques

  10. Résultats

  11. Résultats Une seule souche productrice de BLSE a été détectée à partir de poulet de chair: Premier cas en Tunisie

  12. Résultats Etude moléculaire d’une collection de 88 isolats

  13. Gènes de résistance détectés en relation avec des phénotypes de résistance tetC 1 31 6 16 1 6 3 3 1

  14. Résultats Prévalence des intégrons • 60/88 (68%): intégrons+ • intI1 : 59 • intI2 : 2 • intI1 + intI2 : 2

  15. Résultats IntI2 dfrA1 sat aadA1 Différents arrangements de gènes cassettes des intégrons de classe 1 Intégron de classe 2 : la structure classique des intégrons classe 2

  16. Résultats Corrélation entre la résistance aux antibiotiques et la présence des intégrons

  17. Résultats Corrélation entre la multirésistance et la présence des intégrons

  18. Résultats Phylogénie : PFGE Grande diversité génétique : Les souches ne sont pas clonale

  19. Conclusion 1- Résistance élevé à : La streptomycine (67,5%), la tétracycline (57,4%), le sulphonamide (46,6%), l’amoxicilline (42%), aux triméthoprime-sulfaméthoxazole (40,5%) et l’acide nalidixique (30,8%) ; 2- La résistance aux antibiotiques est plus importante chez les isolats aviaires que les isolats d’origine bovine et ovine, probablement liée aux pratiques d’élevages intensifs avicoles et à la forte utilisation des antibiotiques dans ce secteur; 3- Association entre présence d’intégrons et multirésistance aux antibiotiques

  20. Perspectives  • Etude génétique approfondie d’une collection plus importante ; • Recherche des gènes de virulence pour déterminer la relation virulence-résistance aux antibiotiques ; • Etablissement d’un système de surveillance de la résistance aux antibiotiques en médecine vétérinaire. • Sensibilisation des responsables du secteur avicole par les problèmes de l’antibiorésistance

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